12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2231 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2231  protein of unknown function DUF1555  100 
 
 
263 aa  533  1e-151  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  unclonable  0.00000000471687  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2235  protein of unknown function DUF1555  67.8 
 
 
259 aa  331  8e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0504699  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2507  hypothetical protein  33.46 
 
 
259 aa  107  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000323084  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2510  hypothetical protein  33.21 
 
 
262 aa  105  6e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000239713  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3077  hypothetical protein  32.16 
 
 
288 aa  105  8e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0321099  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2509  hypothetical protein  32.25 
 
 
263 aa  98.2  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000000335843  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0694  protein of unknown function DUF1555  31.5 
 
 
284 aa  94  2e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.275116 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0693  protein of unknown function DUF1555  29.45 
 
 
287 aa  88.2  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.310303 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0404  hypothetical protein  29.5 
 
 
293 aa  87.4  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3076  hypothetical protein  28.15 
 
 
286 aa  80.1  0.00000000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113564  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2746  hypothetical protein  24.4 
 
 
336 aa  54.3  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.675997 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1994  hypothetical protein  50 
 
 
203 aa  45.8  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000557668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>