More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2230 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2230  hypothetical protein  100 
 
 
679 aa  1394    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000280585  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3075  hypothetical protein  46.1 
 
 
989 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.697159  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0692  hypothetical protein  46.12 
 
 
968 aa  551  1e-155  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.233309 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0822  hypothetical protein  43.47 
 
 
1006 aa  511  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0374  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.85 
 
 
684 aa  314  2.9999999999999996e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1994  molybdopterin/thiamine biosynthesis family protein  33.38 
 
 
672 aa  293  9e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2502  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  50.18 
 
 
292 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0151  hypothetical protein  47.16 
 
 
300 aa  246  6.999999999999999e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2046  hypothetical protein  45.36 
 
 
290 aa  242  1e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000420492  hitchhiker  0.0000188727 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12362  hypothetical protein  44.24 
 
 
318 aa  234  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1525  hypothetical protein  43.73 
 
 
287 aa  233  7.000000000000001e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1623  hypothetical protein  41.91 
 
 
295 aa  223  7e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.240534  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2396  hypothetical protein  49 
 
 
290 aa  217  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000837429  normal  0.548926 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0191  hypothetical protein  43.82 
 
 
291 aa  206  9e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.409062  normal  0.837302 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2045  hypothetical protein  33.74 
 
 
351 aa  179  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.161905  hitchhiker  0.0000184518 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2389  hypothetical protein  26.13 
 
 
762 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.280266  normal  0.917371 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0026  hypothetical protein  33.43 
 
 
817 aa  144  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1528  hypothetical protein  23.45 
 
 
771 aa  141  3.9999999999999997e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.2022  normal  0.983664 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2794  hypothetical protein  26.35 
 
 
770 aa  130  5.0000000000000004e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0547661  normal  0.0162252 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11385  hypothetical protein  25.65 
 
 
715 aa  127  7e-28  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1730  hypothetical protein  27.05 
 
 
709 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1749  hypothetical protein  27.05 
 
 
709 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.13421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1796  hypothetical protein  27.05 
 
 
709 aa  126  2e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.284537  normal  0.928195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0204  hypothetical protein  26.15 
 
 
711 aa  109  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4376  hypothetical protein  30.94 
 
 
710 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.209188  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1624  molybdopterin biosynthesis protein MoeY  29.07 
 
 
369 aa  96.3  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00849574  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1238  4-methyl-5-(beta-hydroxyethyl)thiazole monophosphate synthesis protein ThiF  33.75 
 
 
247 aa  95.5  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0802  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.93 
 
 
242 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2198  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.32 
 
 
258 aa  90.1  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00658459  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2029  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  37.32 
 
 
258 aa  89.7  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157166 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1968  hypothetical protein  27.27 
 
 
726 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1464  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.65 
 
 
242 aa  88.6  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2504  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.91 
 
 
285 aa  88.6  3e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00024143  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3036  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  35.58 
 
 
258 aa  87.8  6e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.569088  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2250  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.93 
 
 
348 aa  86.7  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0655249  normal  0.413698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5243  hypothetical protein  26.88 
 
 
730 aa  86.7  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2082  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.54 
 
 
288 aa  87  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.880254 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1922  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32.87 
 
 
309 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.459243  normal  0.0162799 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0597  molybdopterin biosynthesis protein  32.93 
 
 
349 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.348969  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3177  hypothetical protein  29.43 
 
 
320 aa  85.5  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000373208  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1062  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  32.91 
 
 
253 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0890  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.31 
 
 
273 aa  85.1  0.000000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4414  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  36.62 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00164225  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0735  thiamine biosynthesis protein ThiF  34.86 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1190  thiamine biosynthesis protein ThiF  35.78 
 
 
267 aa  84.7  0.000000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3717  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.48 
 
 
249 aa  84.7  0.000000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.184185  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3014  HesA/MoeB/thiF family protein  35.62 
 
 
252 aa  84.3  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000017357  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1149  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.76 
 
 
265 aa  82.4  0.00000000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000110097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03292  hypothetical protein  35.71 
 
 
269 aa  82.4  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0870  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.85 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.049758 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1014  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  34.85 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0318516 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0797  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.29 
 
 
265 aa  81.6  0.00000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1067  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.94 
 
 
267 aa  81.6  0.00000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.451189  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0513  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.33 
 
 
348 aa  81.3  0.00000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0795436 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2505  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.8 
 
 
254 aa  80.9  0.00000000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000813417  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1043  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold:MoeZ/MoeB  33.12 
 
 
280 aa  80.9  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000044291  hitchhiker  0.000000000393673 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1588  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.19 
 
 
259 aa  80.9  0.00000000000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.475165  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3288  thiF family protein  35.92 
 
 
255 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1111  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.94 
 
 
259 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002691  HesA/MoeB/ThiF family protein  35 
 
 
269 aa  79.3  0.0000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1394  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.79 
 
 
278 aa  79.3  0.0000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1010  nitroreductase  29.27 
 
 
361 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.869828  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1675  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  33.1 
 
 
242 aa  79.3  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.492542  hitchhiker  0.00106049 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1702  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  34.46 
 
 
264 aa  79.3  0.0000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00338443  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0203  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  33.55 
 
 
375 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.357554  normal  0.334206 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3237  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  40.68 
 
 
255 aa  79  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0154153  normal  0.0391126 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0833  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  26.82 
 
 
390 aa  78.2  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0884  molybdopterin biosynthesis protein  33.57 
 
 
276 aa  78.6  0.0000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.167114  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1898  HesA/MoeB/ThiF family protein  35 
 
 
273 aa  78.2  0.0000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5267  molybdopterin and thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing enzyme  30.9 
 
 
298 aa  78.2  0.0000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2639  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold-containing protein  35.11 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1816  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  31.55 
 
 
364 aa  77.8  0.0000000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06750  molybdopterin biosynthesis-like protein MoeZ  27.35 
 
 
398 aa  77.8  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0522  HesA/MoeB/ThiF family protein  34.51 
 
 
267 aa  77.4  0.0000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1157  thiamine biosynthesis protein ThiF  37.04 
 
 
215 aa  77.4  0.0000000000009  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3110  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  35.21 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2211  HesA/MoeB/ThiF family protein  28.24 
 
 
248 aa  77  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2212  thiF family protein  33.59 
 
 
272 aa  76.6  0.000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.261926  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0611  thiamine biosynthesis protein ThiF  33.55 
 
 
268 aa  77  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000802075  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3531  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  28.49 
 
 
377 aa  76.3  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.522613  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3072  thiamine biosynthesis protein ThiF  36.7 
 
 
267 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.868681  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3522  molybdopterin and thiamine biosynthesis dinucleotide-utilizing enzyme  30.66 
 
 
298 aa  76.6  0.000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0656  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  32 
 
 
255 aa  75.9  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1985  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.28 
 
 
367 aa  76.3  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.836735 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0362  adenylyltransferase  29.09 
 
 
257 aa  76.3  0.000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5312  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  31.91 
 
 
254 aa  76.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1178  thiamine biosynthesis protein ThiF  37.07 
 
 
267 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0763  molybdopterin biosynthesis protein MoeB  29.86 
 
 
251 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2477  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.36 
 
 
338 aa  76.6  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.509569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1651  hypothetical protein  26.55 
 
 
323 aa  76.3  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.234318  normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_002950  PG1693  HesA/MoeB/ThiF family protein  33.85 
 
 
249 aa  75.5  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.658136 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4801  hypothetical protein  28.68 
 
 
333 aa  75.5  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.454928  normal  0.109812 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0663  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  30.15 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.265316  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0792  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.86 
 
 
300 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.15291 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0827  hypothetical protein  28.57 
 
 
380 aa  75.1  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.862979  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0774  hypothetical protein  32 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.22156  decreased coverage  0.00314195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0722  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  32.86 
 
 
300 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1474  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  29.86 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.790679  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1659  thiamine biosynthesis protein ThiF  29.45 
 
 
200 aa  74.7  0.000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1970  UBA/THIF-type NAD/FAD binding fold  31.22 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000014844  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>