100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2216 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  100 
 
 		 342 aa  704    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2472  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  56.67 
 
 		 344 aa  386  1e-106  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2469  hypothetical protein  54.49 
 
 		 344 aa  387  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1775  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  55.76 
 
 		 344 aa  381  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2344  hypothetical protein  51.45 
 
 		 344 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0683  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  51.8 
 
 		 348 aa  338  7e-92  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3065  hypothetical protein  52.11 
 
 		 348 aa  334  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0204721  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0138  hypothetical protein  39.16 
 
 		 471 aa  259  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0233537  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2369  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  38.51 
 
 		 368 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2511  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  33.94 
 
 		 356 aa  209  5e-53  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.723604 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1516  hypothetical protein  33.23 
 
 		 343 aa  206  5e-52  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.069659  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0142  hypothetical protein  35.63 
 
 		 350 aa  204  2e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.103004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01304  hypothetical protein  36.69 
 
 		 357 aa  199  7e-50  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1980  hypothetical protein  31.58 
 
 		 352 aa  196  4.0000000000000005e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2523  hypothetical protein  31.71 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.193947  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0288  hypothetical protein  34.44 
 
 		 354 aa  192  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1195  hypothetical protein  29.94 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2969  hypothetical protein  34.72 
 
 		 346 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.852464  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0665  hypothetical protein  32.12 
 
 		 345 aa  180  2e-44  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0449506  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1922  hypothetical protein  34.23 
 
 		 355 aa  177  2e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.26263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4037  hypothetical protein  32.53 
 
 		 349 aa  172  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.493535  normal  0.627077 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2404  hypothetical protein  31.74 
 
 		 344 aa  171  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0589  hypothetical protein  31.55 
 
 		 347 aa  169  5e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.611508 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3275  FemAB-related protein, PEP-CTERM system-associated  32.14 
 
 		 353 aa  167  2e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.299337  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0832  hypothetical protein  30.54 
 
 		 349 aa  162  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00050056  normal  0.312706 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3113  hypothetical protein  32.25 
 
 		 345 aa  155  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2330  hypothetical protein  32.21 
 
 		 351 aa  149  5e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.1528  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  29.64 
 
 		 346 aa  131  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  26.2 
 
 		 380 aa  123  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2865  hypothetical protein  28.08 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3956  hypothetical protein  24.92 
 
 		 369 aa  99  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000641904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  25.94 
 
 		 346 aa  90.5  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  26.4 
 
 		 346 aa  86.3  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  29.69 
 
 		 335 aa  84  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  24.91 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2342  hypothetical protein  26.42 
 
 		 352 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  25.77 
 
 		 339 aa  61.6  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2411  protein of unknown function DUF482  26.27 
 
 		 372 aa  61.6  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5010  femAB family protein  25.32 
 
 		 341 aa  58.9  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.342142  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  24.17 
 
 		 352 aa  57.8  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2853  hypothetical protein  26.11 
 
 		 348 aa  57  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.957178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1399  hypothetical protein  26.3 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  24.14 
 
 		 354 aa  55.8  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1758  protein of unknown function DUF482  28.57 
 
 		 426 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19080  hypothetical protein  28 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2634  hypothetical protein  28.66 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0584962  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  23 
 
 		 346 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  23.26 
 
 		 366 aa  54.3  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  22.94 
 
 		 370 aa  53.9  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  22.82 
 
 		 340 aa  53.5  0.000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  28.36 
 
 		 394 aa  53.5  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5112  hypothetical protein  26.97 
 
 		 336 aa  52.8  0.000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0964659  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  23.95 
 
 		 368 aa  51.6  0.00002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  25.16 
 
 		 345 aa  50.8  0.00003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  21.38 
 
 		 354 aa  50.8  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  21.72 
 
 		 341 aa  50.1  0.00005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2114  hypothetical protein  24.38 
 
 		 391 aa  50.1  0.00005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0393548 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2312  hypothetical protein  25.81 
 
 		 343 aa  50.1  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1736  hypothetical protein  27.59 
 
 		 414 aa  49.7  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.327747 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2273  hypothetical protein  25.89 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2007  protein of unknown function DUF482  26.95 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.199374  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3011  hypothetical protein  25.89 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.350718  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1586  hypothetical protein  25.89 
 
 		 392 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.215515  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2728  protein of unknown function DUF482  23.18 
 
 		 360 aa  48.5  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.482238  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4092  hypothetical protein  24.57 
 
 		 375 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1088  hypothetical protein  25.89 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.267189  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1083  hypothetical protein  25.89 
 
 		 441 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  24.64 
 
 		 366 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1241  hypothetical protein  25.89 
 
 		 464 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  22.29 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0740  hypothetical protein  25.89 
 
 		 441 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.391728  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  26.67 
 
 		 360 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2871  hypothetical protein  25.22 
 
 		 388 aa  47.4  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0275  hypothetical protein  25.93 
 
 		 350 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  28.26 
 
 		 370 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2359  protein of unknown function DUF482  27.82 
 
 		 393 aa  47  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.597494  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22410  hypothetical protein  25.57 
 
 		 374 aa  45.4  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000252116 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3828  hypothetical protein  24 
 
 		 375 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.210412  normal  0.0118616 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1249  hypothetical protein  25.43 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.25813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  21.76 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3837  hypothetical protein  25.41 
 
 		 375 aa  44.7  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.29195  normal  0.855927 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1896  hypothetical protein  25.57 
 
 		 374 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.376681  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  29.37 
 
 		 383 aa  44.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1113  hypothetical protein  21.97 
 
 		 335 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.79737  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2313  hypothetical protein  22.42 
 
 		 342 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3044  hypothetical protein  25.67 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1425  hypothetical protein  25.75 
 
 		 374 aa  44.3  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.345024 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1528  hypothetical protein  25.38 
 
 		 354 aa  44.3  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3419  hypothetical protein  26.9 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.346607  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3568  protein of unknown function DUF482  26.9 
 
 		 388 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.207559  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  23.6 
 
 		 372 aa  44.3  0.003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  22.64 
 
 		 364 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0437  hypothetical protein  28.12 
 
 		 387 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1337  hypothetical protein  22.79 
 
 		 342 aa  43.5  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2501  hypothetical protein  20.71 
 
 		 353 aa  43.5  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2314  hypothetical protein  22.89 
 
 		 338 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3500  protein of unknown function DUF482  26.21 
 
 		 388 aa  43.1  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0503  hypothetical protein  24.31 
 
 		 354 aa  43.1  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.180826  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2475  hypothetical protein  28.68 
 
 		 395 aa  42.7  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.407377  normal  0.0590595 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  22.58 
 
 		 359 aa  43.1  0.008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.155911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>