More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2181 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2181  ABC-2 type transporter  100 
 
 
374 aa  746    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64312  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2362  ABC-2 type transporter  74.8 
 
 
382 aa  574  1.0000000000000001e-163  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0759041  normal  0.863187 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1496  ABC-2 type transporter  74.53 
 
 
382 aa  572  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.679397  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0166  hypothetical protein  73.26 
 
 
374 aa  557  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000154077 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3447  ABC-2 type transporter  71.24 
 
 
376 aa  551  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0565648  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2634  ABC transporter, permease protein  73.8 
 
 
374 aa  547  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1040  ABC transporter, permease  74.06 
 
 
374 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0437  ABC transporter, permease  73.8 
 
 
374 aa  549  1e-155  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2777  ABC-type multidrug transport system, permease component  73.8 
 
 
374 aa  547  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1308  ABC transporter, permease protein  73.53 
 
 
374 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0164  ABC transporter, permease protein  73.53 
 
 
374 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0920361  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0138  ABC transporter, permease  73.53 
 
 
374 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2341  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  74.06 
 
 
374 aa  543  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.612393  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0758  ABC-2 type transporter  74.32 
 
 
376 aa  539  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2685  hypothetical protein  69.97 
 
 
373 aa  520  1e-146  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1505  ABC-2 type transporter  68.82 
 
 
373 aa  516  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.366767  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1951  ABC-2 type transporter  69.71 
 
 
373 aa  514  1.0000000000000001e-145  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.171698  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1683  multidrug ABC transporter permease component  69.62 
 
 
397 aa  517  1.0000000000000001e-145  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0017586  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0171  hypothetical protein  70.43 
 
 
375 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.330821  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6205  ABC-2 type transporter  69.71 
 
 
374 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.261883 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5884  ABC-2 type transporter  71.58 
 
 
374 aa  497  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0626  ABC-2 type transporter  69.44 
 
 
373 aa  495  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69060  putative permease of ABC transporter  65.78 
 
 
374 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16770  ABC-2 type transporter, permease component  63.34 
 
 
372 aa  486  1e-136  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00841824  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1825  ABC-2 type transporter  67.21 
 
 
370 aa  484  1e-136  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0526143  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1349  ABC transporter, permease protein, putative  66.12 
 
 
370 aa  482  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3418  ABC-2 type transporter  66.4 
 
 
373 aa  484  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5973  ABC transporter permease  65.51 
 
 
374 aa  483  1e-135  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1307  putative ABC transporter, permease protein  65.57 
 
 
370 aa  478  1e-134  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4914  ABC-2 type transporter  65.85 
 
 
370 aa  479  1e-134  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03335  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  63.37 
 
 
374 aa  471  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3774  ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 
374 aa  471  1e-132  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0229  ABC-2 type transporter  63.37 
 
 
374 aa  471  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3837  ABC transporter, ATP-binding protein  63.37 
 
 
374 aa  471  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3777  ABC transporter ATP-binding protein  64.5 
 
 
374 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.439357  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0169  hypothetical protein  64.31 
 
 
371 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.466784  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3957  ABC transporter ATP-binding protein  64.15 
 
 
374 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3967  ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 
374 aa  471  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03287  hypothetical protein  63.37 
 
 
374 aa  471  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4830  ABC transporter, ATP-binding protein  63.64 
 
 
374 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3854  ABC transporter ATP-binding protein  64.15 
 
 
374 aa  472  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0230  ABC-2 type transporter  63.37 
 
 
374 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3684  ABC transporter, ATP-binding protein  63.37 
 
 
374 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3787  ABC transporter, ATP-binding protein  64.15 
 
 
374 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3897  ABC transporter ATP-binding protein  63.88 
 
 
374 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4687  ABC-2 type transporter  65.4 
 
 
370 aa  464  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.696171  normal  0.325536 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0315  ABC-2 type transporter  67.65 
 
 
374 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3576  hypothetical protein  60.49 
 
 
370 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  59.57 
 
 
374 aa  446  1.0000000000000001e-124  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4663  hypothetical protein  63.76 
 
 
370 aa  444  1.0000000000000001e-124  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.736815  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3659  putative ABC transporter (permease protein)  62.57 
 
 
370 aa  444  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00759514  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00132  putative ABC transport protein  59.84 
 
 
373 aa  444  1e-123  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1431  hypothetical protein  61.35 
 
 
371 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1150  ABC-2 type transporter  60.65 
 
 
412 aa  428  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.13202  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0019  ABC-2 type transporter  57.26 
 
 
373 aa  405  1.0000000000000001e-112  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0811  ABC-2 type transporter  53.39 
 
 
375 aa  393  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5443  hypothetical protein  53.24 
 
 
372 aa  381  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00889571 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5208  ABC transporter  51.35 
 
 
370 aa  375  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.325379  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5269  ABC-2 type transporter  51.08 
 
 
370 aa  376  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139137  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4844  ABC-2 type transporter  50.41 
 
 
375 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0699099 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5116  ABC-2 type transporter  51.62 
 
 
370 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.75858  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7848  putative ABC transporter (permease protein)  53.37 
 
 
376 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00792305  normal  0.174905 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0566  ABC-2 type transporter  51.22 
 
 
399 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.222842  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0501  ABC-2 type transporter  51.22 
 
 
399 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2949  ABC-2 type transporter  52.49 
 
 
382 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3789  ABC-2 type transporter  51.22 
 
 
390 aa  365  1e-100  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0537  ABC-2 type transporter  50.95 
 
 
398 aa  368  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0209  ABC-2 type transporter  53.59 
 
 
393 aa  367  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.223728  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1742  ABC-2 type transporter  49.73 
 
 
401 aa  364  1e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00338931 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0557  hypothetical protein  51.74 
 
 
379 aa  362  6e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1613  ABC-2 type transporter  48.36 
 
 
374 aa  361  1e-98  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1562  ABC-2 type transporter  48.09 
 
 
374 aa  361  1e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.986622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0750  ABC-2 type transporter  49.46 
 
 
375 aa  353  2e-96  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.212958  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9218  ABC transporter  46.49 
 
 
374 aa  351  1e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.797463  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5749  ABC-2 type transporter  48.64 
 
 
375 aa  348  1e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.166668  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0080  ABC-2 type transporter  51.96 
 
 
379 aa  341  1e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0879828  normal  0.577589 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3879  ABC transporter  51.16 
 
 
350 aa  340  2.9999999999999998e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3215  hypothetical protein  39.57 
 
 
374 aa  281  2e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3157  ABC transporter, inner membrane subunit  41.3 
 
 
374 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00527406  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3895  ABC-2 type transporter  40.49 
 
 
374 aa  270  4e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.505485  normal  0.0804287 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1136  hypothetical protein  33.78 
 
 
381 aa  210  4e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1151  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 
376 aa  158  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.382414  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 
377 aa  157  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3272  ABC-2 type transporter  30.61 
 
 
376 aa  155  9e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1379  ABC-2 type transporter  32.77 
 
 
370 aa  152  1e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.463817  hitchhiker  0.000000727606 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0977  ABC-2 type transporter  30.59 
 
 
376 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.750139 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0655  hypothetical protein  29.65 
 
 
376 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00126989 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1603  ABC transporter, permease protein, putative  31.62 
 
 
378 aa  145  1e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0857  hypothetical protein  29.7 
 
 
377 aa  145  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  30.21 
 
 
366 aa  144  4e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2907  ABC-2 type transporter  30.89 
 
 
376 aa  139  7e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1295  ABC transporter permease protein  30.37 
 
 
376 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0481069  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  27.66 
 
 
376 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3460  hypothetical protein  29.6 
 
 
373 aa  136  5e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4676  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 
379 aa  136  5e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  27.2 
 
 
368 aa  136  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3104  ABC-2 type transporter  29.16 
 
 
375 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1797  ABC-2 type transporter  28.92 
 
 
368 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1910  ABC multidrug efflux pump, inner membrane subunit  29.89 
 
 
376 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0170149  normal  0.0809617 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1518  ABC-2 type transporter  28.08 
 
 
378 aa  133  5e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>