111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2167 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  100 
 
 
191 aa  390  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  44.72 
 
 
195 aa  148  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  44.44 
 
 
195 aa  145  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  40.84 
 
 
194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  45.75 
 
 
192 aa  145  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  45.1 
 
 
195 aa  142  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  44.25 
 
 
188 aa  141  5e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  43.42 
 
 
196 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  42.76 
 
 
196 aa  138  4.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  44.08 
 
 
195 aa  137  7e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  42.11 
 
 
198 aa  137  7.999999999999999e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  42.76 
 
 
195 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  39.89 
 
 
194 aa  135  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  44.44 
 
 
195 aa  134  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  43.42 
 
 
195 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  43.42 
 
 
195 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  43.42 
 
 
195 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  43.42 
 
 
195 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  43.42 
 
 
195 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  43.42 
 
 
195 aa  134  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  43.42 
 
 
195 aa  134  9e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  42.31 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  42.31 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  42.31 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  42.31 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  42.31 
 
 
194 aa  133  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  41.72 
 
 
200 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  41.88 
 
 
195 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  42.31 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  42.31 
 
 
188 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  42.11 
 
 
194 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  42.76 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  40.62 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  44 
 
 
195 aa  130  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  40.12 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  40.12 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  40.12 
 
 
194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  40 
 
 
195 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  40 
 
 
195 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  40 
 
 
195 aa  129  3e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  38.85 
 
 
231 aa  128  5.0000000000000004e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  40 
 
 
195 aa  127  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  40.76 
 
 
194 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  41.45 
 
 
195 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  39.38 
 
 
195 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  39.38 
 
 
194 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  39.38 
 
 
194 aa  125  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  40 
 
 
194 aa  124  6e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  39.53 
 
 
196 aa  124  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  35.63 
 
 
185 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  40.13 
 
 
205 aa  123  2e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  39.47 
 
 
205 aa  122  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  35.14 
 
 
187 aa  121  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  38.86 
 
 
183 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  35.71 
 
 
191 aa  119  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  39.07 
 
 
190 aa  119  3.9999999999999996e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  37.25 
 
 
194 aa  115  5e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  37.5 
 
 
186 aa  112  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  40 
 
 
194 aa  110  2.0000000000000002e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  35.84 
 
 
189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  36.75 
 
 
185 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  37.65 
 
 
189 aa  107  8.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  39.16 
 
 
186 aa  107  9.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  37.65 
 
 
185 aa  107  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  34.86 
 
 
185 aa  103  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  38.18 
 
 
190 aa  102  3e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  31.25 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  41.74 
 
 
167 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  35.34 
 
 
327 aa  70.1  0.00000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  29.51 
 
 
230 aa  69.7  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  28.33 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01121  putative lipoprotein  30.11 
 
 
190 aa  59.3  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  32.09 
 
 
230 aa  58.5  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  28.23 
 
 
301 aa  56.2  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  27.13 
 
 
229 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  29.03 
 
 
299 aa  55.1  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4192  protein of unknown function DUF500  28.09 
 
 
236 aa  55.1  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  27.42 
 
 
301 aa  54.7  0.0000008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  28.49 
 
 
242 aa  53.1  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  25.71 
 
 
230 aa  52.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  32 
 
 
297 aa  52.8  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2146  protein of unknown function DUF500  37.5 
 
 
222 aa  52.8  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0013338  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  33.33 
 
 
249 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  30 
 
 
231 aa  51.6  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2073  protein of unknown function DUF500  37.5 
 
 
222 aa  51.6  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000191857 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  29.03 
 
 
182 aa  51.2  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  27.46 
 
 
186 aa  51.2  0.000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  28.25 
 
 
257 aa  51.2  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  28.69 
 
 
231 aa  51.2  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  26.82 
 
 
210 aa  49.7  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0638  hypothetical protein  25.56 
 
 
225 aa  48.9  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.608568  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0733  hypothetical protein  31.01 
 
 
233 aa  48.9  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000336107  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  30.16 
 
 
188 aa  47.4  0.0001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  26.17 
 
 
190 aa  46.6  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  25.73 
 
 
178 aa  45.4  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0392  hypothetical protein  23.5 
 
 
187 aa  45.1  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4764  hypothetical protein  25.32 
 
 
260 aa  44.7  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00104284  normal  0.0279942 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2385  protein of unknown function DUF500  23.97 
 
 
267 aa  44.7  0.0009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.440615  normal  0.201549 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  26.32 
 
 
231 aa  43.9  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  22.47 
 
 
233 aa  43.9  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>