More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2076 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2076  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  100 
 
 		 300 aa  590  1e-167  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0353167  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0468  moxR protein, putative  60.71 
 
 		 303 aa  336  2.9999999999999997e-91  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5567  ATPase  60.07 
 
 		 305 aa  328  7e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0627555  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2623  ATPase  54.61 
 
 		 303 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.3673  normal  0.0965943 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2153  MoxR protein  57.14 
 
 		 303 aa  325  5e-88  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1837  ATPase  57.99 
 
 		 302 aa  325  5e-88  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2242  ATPase  58.09 
 
 		 313 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.839891  normal  0.451068 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0819  ATPase  57.89 
 
 		 315 aa  325  8.000000000000001e-88  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1778  ATPase  58.46 
 
 		 303 aa  324  9e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1856  ATPase  58.09 
 
 		 303 aa  324  1e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.195599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2530  ATPase  51.77 
 
 		 303 aa  324  1e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2098  ATPase  54.45 
 
 		 303 aa  323  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2051  ATPase  54.45 
 
 		 303 aa  322  4e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.285449  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2348  ATPase  54.24 
 
 		 315 aa  322  6e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2069  succinyl-CoA ligase, alpha subunit  54.09 
 
 		 306 aa  321  7e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.534339  normal  0.58415 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1967  ATPase  55.47 
 
 		 303 aa  322  7e-87  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.379731  normal  0.918061 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2107  ATPase  56.2 
 
 		 303 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3009  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  59.56 
 
 		 331 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.116146  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1897  MoxR protein  55.79 
 
 		 309 aa  319  3e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.585542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2287  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  55.81 
 
 		 303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.243939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2370  MoxR-like ATPase  52.45 
 
 		 305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.470488  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1752  ATPase  55.99 
 
 		 303 aa  319  3.9999999999999996e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.682382  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4561  hypothetical protein  55.6 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2275  ATPase  55.6 
 
 		 303 aa  317  1e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2529  AAA_3 ATPase  56.48 
 
 		 306 aa  316  4e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3146  ATPase  56.15 
 
 		 306 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109548 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2126  ATPase  54.87 
 
 		 303 aa  314  9e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1491  MoxR protein, putative  60.64 
 
 		 315 aa  314  9.999999999999999e-85  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00106383  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1245  putative MoxR like protein  58.8 
 
 		 306 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0487098  normal  0.300383 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3377  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.88 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.28342  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3626  putative ATPase  56.68 
 
 		 308 aa  312  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2163  ATPase  54.82 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2096  ATPase  58.16 
 
 		 306 aa  313  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2416  ATPase  52.55 
 
 		 303 aa  311  5.999999999999999e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2814  ATPase  54.33 
 
 		 306 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.826305  normal  0.378923 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2303  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  54.33 
 
 		 306 aa  311  5.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02436  methanol dehydrogenase regulator  57.28 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.808259  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1883  ATPase  55.86 
 
 		 306 aa  308  1.0000000000000001e-82  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2386  ATPase  57.28 
 
 		 306 aa  306  4.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26910  hypothetical protein  56.72 
 
 		 305 aa  303  3.0000000000000004e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02555  MoxR protein  51.06 
 
 		 315 aa  301  9e-81  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.080155  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2279  hypothetical protein  56.39 
 
 		 305 aa  301  1e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1219  ATPase  55.48 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.240667  normal  0.223931 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0864  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.27 
 
 		 317 aa  299  3e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2517  ATPase  58.02 
 
 		 315 aa  298  9e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.431864  normal  0.118214 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2778  hypothetical protein  52.33 
 
 		 350 aa  297  1e-79  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1879  MoxR protein-like  57.55 
 
 		 312 aa  297  2e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1323  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.67 
 
 		 308 aa  296  3e-79  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.167846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1116  ATPase  54.25 
 
 		 317 aa  294  1e-78  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03013  hypothetical protein  59.01 
 
 		 321 aa  293  2e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.601982 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1871  hypothetical protein  52.5 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1862  hypothetical protein  52.14 
 
 		 304 aa  293  2e-78  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1792  ATPase  57.76 
 
 		 317 aa  293  2e-78  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.611153  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1210  methanol dehydrogenase regulatory protein  53.92 
 
 		 317 aa  292  4e-78  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2450  ATPase  55.74 
 
 		 305 aa  292  4e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.620681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3854  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.66 
 
 		 323 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.484851  normal  0.657971 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3968  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  58.66 
 
 		 323 aa  291  8e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0680524 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2248  moxR protein, putative  54.13 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.161333  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1359  ATPase  51.27 
 
 		 310 aa  286  2e-76  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.020418  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2912  ATPase  58.63 
 
 		 349 aa  286  4e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.275117 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2053  moxR protein, putative  53.47 
 
 		 305 aa  285  7e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.528034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1119  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.28 
 
 		 318 aa  277  1e-73  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3277  ATPase  45.1 
 
 		 310 aa  276  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6584  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.26 
 
 		 325 aa  274  1.0000000000000001e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.597099 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0889  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  50.52 
 
 		 329 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0095  MoxR protein  56.62 
 
 		 317 aa  274  1.0000000000000001e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3181  MoxR protein  45.85 
 
 		 320 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0813  ATPase  48.04 
 
 		 310 aa  271  7e-72  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1953  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.37 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1929  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  46.99 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.788825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2274  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  47.17 
 
 		 320 aa  270  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2134  MoxR protein  45.13 
 
 		 320 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1968  ATPase  46.99 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2157  methanol dehydrogenase regulatory protein; magnesium chelatase  46.99 
 
 		 320 aa  269  4e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3201  ATPase  46.49 
 
 		 319 aa  268  1e-70  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.306413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0210  ATPase  47.1 
 
 		 347 aa  268  1e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.283743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1709  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  42.24 
 
 		 321 aa  268  1e-70  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0280  ATPase  44.11 
 
 		 312 aa  267  2e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.760866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0886  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  48.98 
 
 		 330 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1945  ATPase  51.62 
 
 		 335 aa  267  2e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1613  ATPase  48.38 
 
 		 305 aa  267  2e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.635167  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0941  ATPase  45.93 
 
 		 308 aa  267  2e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1679  ATPase  47.7 
 
 		 305 aa  266  2.9999999999999995e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2275  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  53.56 
 
 		 322 aa  265  5e-70  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19020  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  46.32 
 
 		 313 aa  265  7e-70  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2936  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.61 
 
 		 341 aa  265  8.999999999999999e-70  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000363093  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1100  putative regulatory protein  52.04 
 
 		 328 aa  265  1e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1676  methanol dehydrogenase regulatory protein  51.62 
 
 		 335 aa  263  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0704  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.94 
 
 		 314 aa  264  2e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3015  hypothetical protein  47.77 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2815  ATPase  47.04 
 
 		 309 aa  263  3e-69  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1523  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  43.06 
 
 		 305 aa  263  3e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1399  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.83 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1369  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  47.83 
 
 		 306 aa  263  3e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2538  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  44.98 
 
 		 314 aa  263  4e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0216  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  45.18 
 
 		 302 aa  262  4.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0316575  normal  0.204344 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2227  hypothetical protein  48.11 
 
 		 309 aa  262  6e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.837362  hitchhiker  0.00000000223173 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8515  ATPase associated with various cellular activities AAA_3  51.1 
 
 		 327 aa  260  2e-68  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0550529  normal  0.0546803 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3052  hypothetical protein  46.69 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0692  ATPase  46.26 
 
 		 323 aa  260  2e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0405623 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>