175 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2055 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_2055  2'-5' RNA ligase  100 
 
 		 184 aa  371  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.180735  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0973  2'-5' RNA ligase  40.44 
 
 		 194 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15722  hitchhiker  0.0000262624 
 
 
-
 
NC_002936  DET1456  2'-5' RNA ligase family protein  32.98 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000758334  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1234  2 -5 RNA ligase  31.38 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00152481  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1257  2'-5' RNA ligase  31.91 
 
 		 193 aa  103  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000034969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2529  2'-5' RNA ligase  34.46 
 
 		 190 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0231  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 185 aa  97.8  8e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0488  2'-5' RNA ligase  37.5 
 
 		 195 aa  95.9  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1825  2'-5' RNA ligase  32.97 
 
 		 187 aa  92.8  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11900  2'-5' RNA ligase  29.1 
 
 		 189 aa  92.4  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  5.56695e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0088  2'-5' RNA ligase  32.42 
 
 		 184 aa  92.4  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000385137 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3716  2'-5' RNA ligase  33.16 
 
 		 200 aa  92.4  3e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.784361  hitchhiker  0.00258994 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0107  2'-5' RNA ligase  31.43 
 
 		 184 aa  91.3  7e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1002  2'-5' RNA ligase  32.22 
 
 		 185 aa  90.9  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0674  2'-5' RNA ligase  37.78 
 
 		 177 aa  90.5  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3539  2'-5' RNA ligase  32.98 
 
 		 201 aa  90.1  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.146255 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0937  2'-5' RNA ligase  33.69 
 
 		 187 aa  90.1  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000195897  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0959  2'-5' RNA ligase  33.69 
 
 		 187 aa  89.7  2e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000732376  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3530  2',5' RNA ligase  31.87 
 
 		 184 aa  88.6  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0804998  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2011  2'-5' RNA ligase  32.43 
 
 		 194 aa  87.8  7e-17  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1266  2'-5' RNA ligase  31.35 
 
 		 193 aa  86.7  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0332104  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0408  2'-5' RNA ligase  24.32 
 
 		 189 aa  83.2  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1388  2',5' RNA ligase  31.89 
 
 		 183 aa  81.6  0.000000000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.482192  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0322  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 179 aa  81.6  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0904  2'-5' RNA ligase  27.23 
 
 		 271 aa  81.6  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0022796 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1117  2'-5' RNA ligase  29.84 
 
 		 181 aa  81.6  0.000000000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1768  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 182 aa  81.6  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000411765  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2139  2',5' RNA ligase  31.79 
 
 		 190 aa  80.9  0.000000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.207746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1785  2'-5' RNA ligase  32 
 
 		 180 aa  80.1  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0857  2'-5' RNA ligase  37.84 
 
 		 172 aa  80.5  0.00000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.358243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1327  2'-5' RNA ligase  31.89 
 
 		 171 aa  79  0.00000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.243857  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1561  2'-5' RNA ligase  29.38 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1736  2'-5' RNA ligase  27.03 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.556008 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2521  2'-5' RNA ligase  30 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000915911  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1580  2'-5' RNA ligase  29.26 
 
 		 181 aa  77.4  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3040  2'-5' RNA ligase  28.07 
 
 		 189 aa  77  0.0000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.308422 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0159  2'-5' RNA ligase  29.71 
 
 		 184 aa  77.4  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1462  2'-5' RNA ligase  29.1 
 
 		 194 aa  77  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.982086  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1781  2'-5' RNA ligase  28.02 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2809  2',5' RNA ligase  29.03 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.222732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3617  2'-5' RNA ligase  30.3 
 
 		 189 aa  75.9  0.0000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000624511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0571  2'-5' RNA ligase  26.55 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.223285  hitchhiker  0.00111432 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1157  2'-5' RNA ligase  29.03 
 
 		 189 aa  75.5  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1707  2'-5' RNA ligase  29.26 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.553995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0012  2'-5' RNA ligase  30.98 
 
 		 179 aa  75.5  0.0000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0833472 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4534  2'-5' RNA ligase  25.81 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2404  2'-5' RNA ligase  31.21 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1238  2'-5' RNA ligase  29.95 
 
 		 186 aa  74.7  0.0000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1741  2'-5' RNA ligase  29.94 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000285675 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2026  2'-5' RNA ligase  27.06 
 
 		 189 aa  74.3  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0972486  normal  0.0903404 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4845  2'-5' RNA ligase  27.08 
 
 		 181 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1729  2'-5' RNA ligase  29.03 
 
 		 188 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4815  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.52 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.797227  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1634  2'-5' RNA ligase  30.77 
 
 		 174 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.108546  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2724  2'-5' RNA ligase  30.21 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0035  2',5' RNA ligase, putative  29.95 
 
 		 179 aa  72.8  0.000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0461  2'-5' RNA ligase  33.97 
 
 		 195 aa  72.4  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1256  putative integral membrane transport protein  29.89 
 
 		 190 aa  72  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00112331  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1078  2',5' RNA ligase  31.75 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3366  2'-5' RNA ligase  28.04 
 
 		 184 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1576  2'-5' RNA ligase  29.28 
 
 		 179 aa  71.2  0.000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1647  2'-5' RNA ligase  29.32 
 
 		 183 aa  71.2  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4453  2'-5' RNA ligase  25.93 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0421  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.4 
 
 		 181 aa  70.9  0.00000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4838  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.4 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.305277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4598  2'-5' RNA ligase family protein  25.65 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4435  2'-5' RNA ligase  25.65 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4955  2'-5' RNA ligase family protein  25.65 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4820  putative 2'-5' RNA ligase family protein  25.65 
 
 		 181 aa  70.1  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3055  2',5' RNA ligase  30.94 
 
 		 180 aa  70.1  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0746  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 170 aa  70.1  0.00000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.836735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0080  2'-5' RNA ligase  25.93 
 
 		 202 aa  69.7  0.00000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.91428  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5904  2'-5' RNA ligase  29.8 
 
 		 298 aa  69.3  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.230551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0285  2'-5' RNA ligase  26.78 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000353357  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0280  2'-5' RNA ligase  29.67 
 
 		 174 aa  68.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1290  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 		 190 aa  67.8  0.00000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.189928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0273  2'-5' RNA ligase  30.53 
 
 		 188 aa  67.8  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1939  2'-5' RNA ligase  25.3 
 
 		 181 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.33767  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0994  2'-5' RNA ligase  28.18 
 
 		 174 aa  67.4  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.657287  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0987  2'-5' RNA ligase  25 
 
 		 171 aa  67  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0381875  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0370  hypothetical protein  29.68 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  33.85 
 
 		 192 aa  65.9  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3960  2',5' RNA ligase  36.84 
 
 		 194 aa  66.2  0.0000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.250579  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1484  2'-5' RNA ligase  24.59 
 
 		 173 aa  65.9  0.0000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2754  2'-5' RNA ligase  27.87 
 
 		 184 aa  65.9  0.0000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0172  2'-5' RNA ligase  28.76 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1655  2'-5' RNA ligase  28.34 
 
 		 194 aa  65.5  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4070  2'-5' RNA ligase  38.51 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4103  2'-5' RNA ligase  37.84 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2137  2',5' RNA ligase  30.48 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0503  2'-5' RNA ligase  28.57 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000000682832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8791  2'-5' RNA ligase  30.13 
 
 		 215 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.825967 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4176  2'-5' RNA ligase  33.57 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.15981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1962  2'-5' RNA ligase  28.19 
 
 		 186 aa  60.1  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000287299  normal  0.896193 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1390  2'-5' RNA ligase  25.68 
 
 		 183 aa  59.7  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5914  2,5 RNA ligase  30 
 
 		 188 aa  59.3  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.720477 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1636  2'-5' RNA ligase  24.36 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0386  2'-5' RNA ligase, putative  29.7 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  34.51 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1166  2'-5' RNA ligase  26.55 
 
 		 184 aa  58.9  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>