More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1975 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1975  GntR domain protein  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.64094  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0156  GntR domain protein  42.86 
 
 		 230 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.108623 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1205  GntR domain protein  40.37 
 
 		 238 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0725034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0749  GntR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 236 aa  150  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0527  GntR domain-containing protein  37.56 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.914747  normal  0.270736 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1310  GntR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 249 aa  134  8e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.168144  normal  0.307204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1522  GntR domain-containing protein  36.04 
 
 		 245 aa  134  9.999999999999999e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0133617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3405  GntR domain protein  36.7 
 
 		 239 aa  128  6e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  8.69353e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2304  GntR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 233 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0216  GntR domain-containing protein  34.09 
 
 		 235 aa  122  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.613582 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2067  GntR domain protein  32.38 
 
 		 252 aa  122  6e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000610321  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0554  GntR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00161353  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1244  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 231 aa  116  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0929  GntR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 232 aa  116  3e-25  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0628731  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21660  transcriptional regulator, GntR family  34.42 
 
 		 235 aa  115  5e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.716798 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0158  GntR domain-containing protein  33.49 
 
 		 239 aa  115  6e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3404  GntR domain protein  33.18 
 
 		 245 aa  115  7.999999999999999e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000285286  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4413  GntR domain protein  34.43 
 
 		 241 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2670  GntR domain-containing protein  33.33 
 
 		 243 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.015323  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1298  GntR domain protein  38.53 
 
 		 242 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0878835  normal  0.515032 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11478  transcriptional regulator, GntR family protein  30.56 
 
 		 233 aa  112  5e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2187  GntR domain-containing protein  31.76 
 
 		 239 aa  111  7.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00327996  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1275  GntR domain protein  31.86 
 
 		 241 aa  111  8.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5612  GntR domain protein  36.77 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.100575  normal  0.179295 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1626  GntR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000858772  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3345  DNA-binding transcriptional repressor LldR  33.47 
 
 		 268 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.956466  normal  0.392938 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1996  GntR domain protein  30.94 
 
 		 250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.482445  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2589  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 233 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0339999  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0393  GntR domain protein  31.86 
 
 		 238 aa  108  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1891  GntR family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 265 aa  108  6e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00390754  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2197  GntR domain-containing protein  32.38 
 
 		 239 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0306  FCD domain-containing protein  32.6 
 
 		 228 aa  107  1e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.438434  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1767  GntR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1078  transcriptional regulatory DNA-binding transcription regulator protein  34.84 
 
 		 255 aa  106  3e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0374  transcriptional regulator PdhR  31.76 
 
 		 250 aa  106  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.783921  hitchhiker  0.000643873 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2695  GntR domain-containing protein  31.51 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0648967 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1034  GntR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 255 aa  105  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.369271  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0945  GntR domain protein  35.02 
 
 		 251 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.280817  normal  0.0677412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2607  GntR domain protein  34.29 
 
 		 234 aa  105  6e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0794563 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0301  hypothetical protein  31.84 
 
 		 228 aa  105  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0954  GntR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 255 aa  105  8e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.709612  hitchhiker  0.000000169252 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1446  GntR domain-containing protein  33.64 
 
 		 227 aa  105  8e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1804  GntR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 247 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00283289  hitchhiker  0.0098314 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4862  GntR domain protein  35.29 
 
 		 247 aa  104  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.105448 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2075  GntR domain-containing protein  31.56 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0194  GntR domain-containing protein  32.17 
 
 		 255 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3384  transcriptional regulator PdhR  31.62 
 
 		 250 aa  104  1e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0527  GntR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000211713  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5379  GntR domain-containing protein  32.75 
 
 		 234 aa  104  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.791423  normal  0.648453 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0423  transcriptional regulator PdhR  31.6 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2141  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3432  transcriptional regulator PdhR  31.88 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.517793  normal  0.595075 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5710  GntR domain protein  31.39 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.274671 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0418  transcriptional regulator PdhR  31.49 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3584  GntR-like  30.3 
 
 		 275 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.532256  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3643  GntR domain-containing protein  32.27 
 
 		 260 aa  103  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1426  GntR domain-containing protein  33.89 
 
 		 253 aa  103  2e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0427  transcriptional regulator PdhR  31.6 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.988139  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3600  transcriptional regulator PdhR  31.6 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.988331  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0425  transcriptional regulator PdhR  31.6 
 
 		 250 aa  103  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.113174  normal  0.0306695 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3068  transcriptional regulator NanR  30.34 
 
 		 235 aa  103  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1140  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3905  GntR domain-containing protein  31.76 
 
 		 235 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4276  GntR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 253 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0786169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1739  GntR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.549482  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0685  GntR-like  32.31 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3914  transcriptional regulator PdhR  32.05 
 
 		 250 aa  102  3e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.517213  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2961  GntR domain-containing protein  31.67 
 
 		 259 aa  103  3e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4102  GntR domain protein  32.74 
 
 		 243 aa  103  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1164  GntR domain-containing protein  32.31 
 
 		 249 aa  103  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1316  GntR domain protein  33.49 
 
 		 202 aa  102  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4055  transcriptional regulator PdhR  32.05 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112662  normal  0.466854 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3935  transcriptional regulator PdhR  32.05 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.470057  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3418  transcriptional regulator PdhR  31.49 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.530869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3857  transcriptional regulator PdhR  32.05 
 
 		 250 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000012948 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3067  transcriptional regulator NanR  31.51 
 
 		 258 aa  102  6e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0862108 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4037  GntR domain protein  34.15 
 
 		 226 aa  102  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1313  regulatory protein GntR HTH  30.09 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2274  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  102  7e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000375173  decreased coverage  0.000000235359 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0318  transcriptional regulator PdhR  31.49 
 
 		 250 aa  101  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3466  GntR domain protein  33.05 
 
 		 255 aa  101  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5153  GntR domain-containing protein  31.6 
 
 		 239 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.25689  normal  0.577182 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1010  GntR domain protein  33.65 
 
 		 251 aa  101  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4920  GntR domain protein  36.92 
 
 		 231 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.774759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0430  transcriptional regulator PdhR  31.91 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00096101 
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3872  GntR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 243 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.405491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0881  GntR domain protein  34.41 
 
 		 244 aa  100  2e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6525  GntR domain-containing protein  33.92 
 
 		 253 aa  99.8  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.223773  normal  0.0260964 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2785  GntR domain-containing protein  31.67 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00845086  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43060  GntR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 258 aa  99.8  3e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145133  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2716  GntR domain-containing protein  31.34 
 
 		 379 aa  99.8  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.474503  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5075  GntR domain-containing protein  34.9 
 
 		 262 aa  99.4  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.805672  normal  0.0518495 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  30.13 
 
 		 240 aa  99.8  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1888  GntR family transcriptional regulator  32.74 
 
 		 257 aa  99.4  4e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.146862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3778  transcriptional regulator PdhR  31.44 
 
 		 250 aa  99.4  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0138  GntR domain-containing protein  30.49 
 
 		 268 aa  99.4  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  decreased coverage  0.00000290412  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3331  Uxu operon transcriptional regulator  31.6 
 
 		 249 aa  99  5e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.172597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4155  GntR domain-containing protein  32.42 
 
 		 240 aa  99.4  5e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0585899  normal  0.800121 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1046  GntR domain-containing protein  31.88 
 
 		 253 aa  99  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3247  Uxu operon transcriptional regulator  31.6 
 
 		 249 aa  99  6e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>