More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1874 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1874  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 793 aa  1617    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0166  TPR repeat-containing protein  31.01 
 
 		 754 aa  251  3e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.268335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0153  TPR repeat-containing protein  30.42 
 
 		 754 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.372833  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3340  TPR repeat-containing protein  29.56 
 
 		 828 aa  241  5e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.710571 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0165  TPR repeat-containing protein  28.54 
 
 		 828 aa  238  4e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0585605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0152  TPR repeat-containing protein  28.71 
 
 		 828 aa  236  8e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2993  TPR repeat-containing protein  29.76 
 
 		 789 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00312978 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3824  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  37.95 
 
 		 1106 aa  233  1e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.138221 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2992  TPR repeat-containing protein  28.47 
 
 		 824 aa  230  6e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000746825 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1509  TPR domain-containing protein  28.27 
 
 		 699 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  unclonable  0.000367862  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3741  TPR repeat-containing protein  37.19 
 
 		 1106 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1636  TPR repeat-containing protein  26.97 
 
 		 968 aa  214  3.9999999999999995e-54  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.992619 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2601  TPR domain/SecC motif-containing domain protein  34.72 
 
 		 585 aa  214  4.9999999999999996e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2855  hypothetical protein  29.89 
 
 		 937 aa  212  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0293  TPR repeat-containing protein  27.17 
 
 		 789 aa  212  3e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2093  TPR repeat-containing protein  33.61 
 
 		 1714 aa  207  5e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3801  TPR repeat-containing protein  28.19 
 
 		 713 aa  206  2e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.386604  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3825  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.15 
 
 		 589 aa  205  3e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0624707 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1841  TPR repeat-containing protein  27.48 
 
 		 3035 aa  202  1.9999999999999998e-50  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3369  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.27 
 
 		 667 aa  202  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0774784  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0121  TPR repeat-containing protein  24.9 
 
 		 732 aa  201  5e-50  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.261868  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0151  TPR repeat-containing protein  35.03 
 
 		 833 aa  200  7e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3339  TPR repeat-containing protein  27.81 
 
 		 732 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.469864 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1840  TPR repeat-containing protein  28.08 
 
 		 3560 aa  199  2.0000000000000003e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0164  TPR repeat-containing protein  34.75 
 
 		 833 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.863115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2997  TPR repeat-containing protein  35.9 
 
 		 708 aa  197  6e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0127987 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27710  glycosyl transferase,TPR repeat protein  27.15 
 
 		 1221 aa  197  7e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3742  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.93 
 
 		 589 aa  197  9e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2996  TPR repeat-containing protein  29.11 
 
 		 626 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.637966  normal  0.0209641 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  27.1 
 
 		 1085 aa  191  5e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3368  Tetratricopeptide domain protein  29.9 
 
 		 596 aa  190  7e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0148  TPR repeat-containing protein  34.26 
 
 		 619 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3331  TPR repeat-containing protein  34.79 
 
 		 633 aa  187  7e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.332967  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5619  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  28.51 
 
 		 739 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.474452 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0461  TPR repeat-containing protein  28.23 
 
 		 627 aa  186  2.0000000000000003e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.999909  normal  0.380381 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0161  TPR repeat-containing protein  33.52 
 
 		 598 aa  185  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4399  TPR repeat-containing protein  32.6 
 
 		 727 aa  184  6e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.516213 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2569  Methyltransferase type 11  33.42 
 
 		 1143 aa  182  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3338  TPR repeat-containing protein  29.78 
 
 		 595 aa  180  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.257374 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2822  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.59 
 
 		 529 aa  180  9e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0103  TPR repeat-containing protein  32.14 
 
 		 733 aa  179  1e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467133  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4439  Tetratricopeptide TPR_4  26.33 
 
 		 715 aa  179  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0641  TPR repeat-containing protein  25.58 
 
 		 1094 aa  179  2e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.230386  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5618  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  29 
 
 		 739 aa  178  3e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.645263 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3533  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  26.48 
 
 		 742 aa  177  5e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  34.25 
 
 		 796 aa  176  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3873  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 776 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.661818  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3955  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 776 aa  176  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1232  TPR repeat-containing protein  24.07 
 
 		 750 aa  175  2.9999999999999996e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.967237  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0094  TPR domain-containing protein  26.47 
 
 		 821 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.822931  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3451  TPR domain-containing protein  26.47 
 
 		 776 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0799942  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3099  TPR domain-containing protein  26.47 
 
 		 776 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1668  TPR domain-containing protein  26.47 
 
 		 776 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.329119  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2876  TPR domain-containing protein  26.47 
 
 		 821 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1233  TPR repeat-containing protein  23.98 
 
 		 909 aa  174  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.161918  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1389  TPR repeat-containing protein  26.29 
 
 		 700 aa  174  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.874801 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3269  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 693 aa  173  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.306934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0637  TPR repeat-containing protein  25.95 
 
 		 4489 aa  173  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5617  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  27.35 
 
 		 739 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.277247 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1008  TPR repeat-containing protein  28.42 
 
 		 672 aa  172  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0772  TPR repeat-containing protein  31.55 
 
 		 611 aa  171  4e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.447572  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1986  sulfotransferase  26.27 
 
 		 1415 aa  171  6e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.634546  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0100  TPR domain-containing protein  26.58 
 
 		 790 aa  169  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1160  hypothetical protein  33.42 
 
 		 630 aa  166  1.0000000000000001e-39  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.795058  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0616  TPR repeat-containing protein  28.32 
 
 		 974 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2387  tetratricopeptide TPR_2  30.54 
 
 		 745 aa  166  2.0000000000000002e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.625245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_863  predicted protein  25.46 
 
 		 708 aa  165  3e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.622244  normal  0.0203568 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00731  hypothetical protein  23.45 
 
 		 816 aa  164  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.456129 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2809  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 717 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2520  methyltransferase type 12  31.48 
 
 		 1116 aa  162  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0702  TPR repeat-containing protein  33.53 
 
 		 667 aa  162  2e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.274193  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3065  TPR repeat-containing protein  29.66 
 
 		 734 aa  162  3e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0065343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3037  TPR repeat-containing protein  30.53 
 
 		 717 aa  161  4e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1162  hypothetical protein  33.42 
 
 		 633 aa  160  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3210  TPR domain-containing protein  27.47 
 
 		 781 aa  160  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0863  TPR repeat-containing protein  30.11 
 
 		 647 aa  159  3e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.399235 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3835  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.51 
 
 		 790 aa  159  3e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.304839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4728  TPR repeat-containing protein  25.74 
 
 		 718 aa  158  3e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.346608 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0933  TPR repeat-containing protein  31.61 
 
 		 738 aa  158  4e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.450791  normal  0.93664 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0452  TPR repeat-containing protein  31.23 
 
 		 569 aa  155  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.384213  normal  0.0840159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0451  TPR repeat-containing protein  29.4 
 
 		 574 aa  154  4e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.871153  normal  0.12833 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2288  TPR repeat-containing protein  24.63 
 
 		 740 aa  154  7e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1827  TPR repeat-containing protein  23.51 
 
 		 761 aa  153  8.999999999999999e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0460239  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0122  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 660 aa  153  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.142603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5235  hypothetical protein  30.39 
 
 		 797 aa  152  2e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.050699  normal  0.568835 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1104  TPR repeat-containing protein  29.18 
 
 		 616 aa  152  2e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1547  hypothetical protein  31.59 
 
 		 459 aa  152  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.948596 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3854  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.82 
 
 		 723 aa  152  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0346  TPR repeat-containing protein  31.02 
 
 		 739 aa  151  4e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.110262  normal  0.110805 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4067  hypothetical protein  29.28 
 
 		 747 aa  151  4e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2578  O-linked N-acetylglucosamine transferase SPINDLY family-like protein  29.64 
 
 		 731 aa  151  5e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.17426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3536  hypothetical protein  27.43 
 
 		 731 aa  151  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6522  SPINDLY family O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.08 
 
 		 740 aa  150  6e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.722582  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3091  hypothetical protein  29.63 
 
 		 680 aa  149  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.677352  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0051  TPR repeat-containing protein  26.61 
 
 		 633 aa  149  2.0000000000000003e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00284913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2869  tetratricopeptide TPR_2  31.87 
 
 		 780 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0238  TPR repeat-containing protein  31.87 
 
 		 780 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1582  Methyltransferase type 12  30.23 
 
 		 1144 aa  147  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1087  TPR repeat-containing protein  24.09 
 
 		 808 aa  147  7.0000000000000006e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3428  tetratricopeptide TPR_2  29.89 
 
 		 560 aa  147  8.000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0384278  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>