97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1871 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1871  C-methyltransferase  100 
 
 
413 aa  832    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.804572  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4217  C-methyltransferase  53.58 
 
 
411 aa  420  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.858444  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4509  C-methyltransferase  52.35 
 
 
411 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.391824  normal  0.0572283 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0848  C-methyltransferase  53.69 
 
 
409 aa  395  1e-109  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.436527  normal  0.303178 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0807  C-methyltransferase  53.2 
 
 
409 aa  394  1e-108  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.409336 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0772  C-methyltransferase  53.69 
 
 
409 aa  390  1e-107  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0227083 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2784  C-methyltransferase  45.83 
 
 
413 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.611308 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3333  C-methyltransferase  45.83 
 
 
413 aa  387  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4987  C-methyltransferase  50.26 
 
 
431 aa  384  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2770  methyltransferase type 12  47.91 
 
 
408 aa  378  1e-103  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4219  methyltransferase type 12  48.02 
 
 
412 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0363  C-methyltransferase  48.79 
 
 
416 aa  365  1e-100  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5197  C-methyltransferase  45.83 
 
 
415 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0057  putative C-3 methyl transferase  47.42 
 
 
410 aa  362  5.0000000000000005e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.00760269  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3390  C-methyltransferase  45.66 
 
 
420 aa  358  9e-98  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0218606  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1962  C-methyltransferase  45.81 
 
 
407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3060  C-methyltransferase  45.3 
 
 
406 aa  357  2.9999999999999997e-97  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0594  C-methyltransferase  48.04 
 
 
407 aa  354  2e-96  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.881628  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0438  methyltransferase, putative  44.33 
 
 
433 aa  346  6e-94  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.874295  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14051  hypothetical protein  43.42 
 
 
402 aa  345  6e-94  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3350  C-methyltransferase  46.87 
 
 
400 aa  344  1e-93  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.295208  normal  0.715465 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0381  putative methyltransferase  44.07 
 
 
433 aa  343  2e-93  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0629  hypothetical protein  48.04 
 
 
409 aa  342  5.999999999999999e-93  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4417  C-methyltransferase  48.23 
 
 
438 aa  342  1e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.482278 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3071  methyltransferase  44.09 
 
 
407 aa  337  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3397  methyltransferase, putative  43.6 
 
 
407 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3401  methyltransferase  43.35 
 
 
407 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27750  hypothetical protein  50.13 
 
 
373 aa  336  5e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3375  methyltransferase  43.35 
 
 
407 aa  334  2e-90  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1513  hypothetical protein  43.49 
 
 
408 aa  333  4e-90  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1048  putative SAM-dependent methyltransferase  45.34 
 
 
420 aa  332  1e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.195919  normal  0.773577 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0635  methyltransferase, putative  43.98 
 
 
411 aa  329  6e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3716  C-methyltransferase  47.32 
 
 
407 aa  327  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0776  C-methyltransferase  42.75 
 
 
411 aa  322  7e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0067  C-methyltransferase  43.78 
 
 
413 aa  316  6e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0480856  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2947  C-methyltransferase  44.12 
 
 
415 aa  306  6e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00433807  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3938  methyltransferase type 12  42.72 
 
 
444 aa  293  6e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.16065  normal  0.145676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6562  C-methyltransferase  43.31 
 
 
410 aa  288  1e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0790  C-methyltransferase  41.9 
 
 
427 aa  287  2.9999999999999996e-76  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00493713  normal  0.231188 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2158  C-methyltransferase  38.08 
 
 
409 aa  276  4e-73  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1221  C-methyltransferase  37.87 
 
 
419 aa  265  8.999999999999999e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.38117  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2386  C-methyltransferase  40.2 
 
 
410 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3092  C-methyltransferase  40.2 
 
 
410 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.763523  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4225  C-methyltransferase  35.66 
 
 
407 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.791496  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4712  C-methyltransferase  35.96 
 
 
408 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.844153 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2118  C-methyltransferase  35.45 
 
 
406 aa  215  9.999999999999999e-55  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.510018  normal  0.0302661 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29890  methyltransferase family protein  33.66 
 
 
408 aa  215  9.999999999999999e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2379  C-methyltransferase  31.15 
 
 
400 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2430  C-methyltransferase  30.89 
 
 
400 aa  212  1e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07271  hypothetical protein  27.03 
 
 
418 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.298061  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5658  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.36 
 
 
421 aa  207  3e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.311747  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2759  C-methyltransferase  33.17 
 
 
405 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.13285  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2265  C-methyltransferase  26.04 
 
 
436 aa  168  2e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1758  C-methyltransferase  27.82 
 
 
409 aa  151  2e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  0.587212 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1599  D-mycarose 3-C-methyltransferase  24.93 
 
 
416 aa  148  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2122  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  25.24 
 
 
409 aa  145  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0486559  normal  0.0722153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3991  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  25.58 
 
 
413 aa  133  6.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2403  C-methyltransferase  29.83 
 
 
400 aa  126  7e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0705  methyltransferase  24.36 
 
 
412 aa  124  4e-27  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0809  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  24.36 
 
 
412 aa  123  5e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2948  C-methyltransferase  26.12 
 
 
391 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.236256  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0212  C-methyltransferase  29.91 
 
 
359 aa  103  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.821739 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0365  C-methyltransferase  29.01 
 
 
376 aa  100  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.131067  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0071  aminotransferase class-III  26.67 
 
 
817 aa  96.3  9e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2387  C-methyltransferase  25.44 
 
 
402 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1270  NDP-hexose 3-C-methyltransferase TylCIII  36.59 
 
 
178 aa  94.4  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0673649 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3091  C-methyltransferase  25.81 
 
 
406 aa  90.5  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6563  C-methyltransferase  25.19 
 
 
396 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2391  methyltransferase type 12  24.62 
 
 
406 aa  86.7  8e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.044338  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1565  methyltransferase type 12  24.28 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.663655  normal  0.440278 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3347  methyltransferase  27.97 
 
 
390 aa  82  0.00000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0988027  normal  0.589908 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3088  C-methyltransferase  25.76 
 
 
406 aa  78.2  0.0000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2880  Methyltransferase type 11  26.65 
 
 
383 aa  72.4  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.252544  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2163  C-methyltransferase  21.73 
 
 
421 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.615529  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3714  methyltransferase type 11  24.73 
 
 
361 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3959  C-methyltransferase  23.53 
 
 
414 aa  67.4  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00636655  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1566  putative sugar nucleotide processing enzyme  25.38 
 
 
414 aa  62.4  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.445342 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1799  methyltransferase domain-containing protein  21.59 
 
 
378 aa  60.5  0.00000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.2313  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2166  Methyltransferase type 12  22.31 
 
 
397 aa  57.4  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6557  methyltransferase type 12  25.97 
 
 
425 aa  57  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5655  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  23.78 
 
 
392 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1809  putative sugar transferase  18.38 
 
 
401 aa  55.1  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0453  hypothetical protein  23.08 
 
 
305 aa  55.1  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1964  methyltransferase type 11  22.06 
 
 
352 aa  53.5  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0617  Methyltransferase type 12  22.32 
 
 
310 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0164647 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0836  Methyltransferase type 12  28.57 
 
 
310 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33332  predicted protein  22.16 
 
 
430 aa  50.8  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.32323 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3318  methyltransferase type 12  22.78 
 
 
383 aa  47.8  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434757 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0106  methyltransferase type 12  25 
 
 
306 aa  47.4  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000284903 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0163  putative methyltransferase  23.69 
 
 
401 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  31.33 
 
 
240 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0150  putative methyltransferase  24.12 
 
 
401 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  27.8 
 
 
252 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3163  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
1177 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4412  methyltransferase type 11  24.64 
 
 
303 aa  43.9  0.006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.033739  normal  0.97195 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2994  methyltransferase type 12  23.5 
 
 
401 aa  43.5  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.290652  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2933  glycosyl transferase family 2  25 
 
 
1177 aa  43.9  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>