More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1828 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1828  50S ribosomal protein L9  100 
 
 		 168 aa  332  1e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1352  50S ribosomal protein L9  57.23 
 
 		 167 aa  184  3e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1410  50S ribosomal protein L9  64.43 
 
 		 171 aa  184  5e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000225617  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2022  50S ribosomal protein L9  61.64 
 
 		 168 aa  179  1e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.278988  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2028  50S ribosomal protein L9  59.35 
 
 		 167 aa  180  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.728229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1096  50S ribosomal protein L9  59.06 
 
 		 160 aa  174  4e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.547655  normal  0.0167988 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2841  50S ribosomal protein L9  47.26 
 
 		 148 aa  137  7e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000145753  hitchhiker  0.000000000000102152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0761  50S ribosomal protein L9  49.31 
 
 		 151 aa  136  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000425439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2610  50S ribosomal protein L9  46.53 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.196058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0668  50S ribosomal protein L9  46.58 
 
 		 148 aa  132  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00124479  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2761  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1479  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 147 aa  130  6.999999999999999e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00653221 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3675  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 147 aa  130  7.999999999999999e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0017578  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0602  ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0116  50S ribosomal protein L9  49.31 
 
 		 149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0123  50S ribosomal protein L9  47.92 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0134  50S ribosomal protein L9  47.92 
 
 		 149 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0654  ribosomal protein L9  46.21 
 
 		 146 aa  124  5e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.233351  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1996  50S ribosomal protein L9  45.83 
 
 		 148 aa  124  6e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2509  50S ribosomal protein L9  42.67 
 
 		 151 aa  122  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000781135  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1043  50S ribosomal protein L9  41.78 
 
 		 204 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0955164 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2925  ribosomal protein L9  44.44 
 
 		 147 aa  121  5e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0843322  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0534  ribosomal protein L9  45.52 
 
 		 149 aa  119  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0161  50S ribosomal protein L9  45.27 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000000723092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3185  ribosomal protein L9  44.14 
 
 		 148 aa  119  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.564436  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4506  ribosomal protein L9  41.38 
 
 		 149 aa  119  3e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.594005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0150  50S ribosomal protein L9  43.75 
 
 		 151 aa  119  3e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157053  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1350  50S ribosomal protein L9  43.84 
 
 		 189 aa  118  4.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0676227  normal  0.268494 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0141  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0117  50S ribosomal protein L9  41.33 
 
 		 151 aa  116  9.999999999999999e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1774  50S ribosomal protein L9  42.86 
 
 		 189 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3412  50S ribosomal protein L9  44.52 
 
 		 149 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1775  50S ribosomal protein L9  45.89 
 
 		 149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000651865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2188  50S ribosomal protein L9  37.91 
 
 		 209 aa  114  6e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09988  ribosomal protein L9  36.99 
 
 		 149 aa  114  6e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.536224  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2535  ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 148 aa  114  6e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000849852  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0741  ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0681469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3040  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 188 aa  114  6.9999999999999995e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.186174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2388  50S ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 147 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1692  50S ribosomal protein L9  43.62 
 
 		 149 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0491  ribosomal protein L9  36.13 
 
 		 179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0132  50S ribosomal protein L9P  44.3 
 
 		 150 aa  112  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.191578  normal  0.450064 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4931  50S ribosomal protein L9  42.07 
 
 		 148 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.108353  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2911  ribosomal protein L9  40.97 
 
 		 147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000198897  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0120  50S ribosomal protein L9  43.7 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0927016  normal  0.199932 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0097  50S ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 151 aa  112  3e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.625219  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1210  50S ribosomal protein L9  42.47 
 
 		 209 aa  112  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0873917  normal  0.750153 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0110  50S ribosomal protein L9  38 
 
 		 151 aa  111  5e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000508651  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2458  50S ribosomal protein L9P  41.67 
 
 		 149 aa  111  5e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.174518 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4535  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 153 aa  110  6e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.323692 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0165  50S ribosomal protein L9  41.67 
 
 		 148 aa  110  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000317895  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0566  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 189 aa  110  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0830  ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 149 aa  110  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.211438  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0452  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 189 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.206752  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4542  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.736351 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0901  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 189 aa  108  3e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0476125 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3757  50S ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 148 aa  108  3e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1436  50S ribosomal protein L9  41.1 
 
 		 149 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0458  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 189 aa  108  4.0000000000000004e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1150  50S ribosomal protein L9  40.74 
 
 		 165 aa  108  4.0000000000000004e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0292661  hitchhiker  0.00494207 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1547  50S ribosomal protein L9  40.41 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1112  ribosomal protein L9  37.93 
 
 		 147 aa  108  5e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.573323  normal  0.866168 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0448  50S ribosomal protein L9  37.84 
 
 		 148 aa  108  5e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000315624  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0163  50S ribosomal protein L9  39.19 
 
 		 146 aa  107  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00237667  normal  0.639266 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00020  50S ribosomal protein L9  42.18 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0851  50S ribosomal protein L9P  42.28 
 
 		 149 aa  107  8.000000000000001e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3697  ribosomal protein L9  40 
 
 		 149 aa  107  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3490  50S ribosomal protein L9  37.34 
 
 		 195 aa  106  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1359  ribosomal protein L9  42.57 
 
 		 151 aa  106  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0122536  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3939  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.613806  normal  0.190537 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2007  ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 148 aa  105  2e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.474404 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4414  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.248049 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4307  50S ribosomal protein L9  39.04 
 
 		 190 aa  106  2e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0939755 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5065  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 148 aa  106  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.972236  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0586  50S ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 150 aa  105  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.482938  hitchhiker  3.77539e-17 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0777  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 149 aa  104  4e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000131124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2257  50S ribosomal protein L9  37.24 
 
 		 148 aa  105  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000108464  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3528  50S ribosomal protein L9  42.94 
 
 		 168 aa  105  4e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.156676  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04070  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3790  ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00574678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5718  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.595872  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002335  LSU ribosomal protein L9p  41.5 
 
 		 150 aa  104  5e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.178305  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04032  hypothetical protein  43.54 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4736  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257928  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4764  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4447  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4673  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3810  50S ribosomal protein L9  43.54 
 
 		 149 aa  104  5e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0581092 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4553  50S ribosomal protein L9  40.14 
 
 		 148 aa  104  5e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.156994  normal  0.554659 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0654  50S ribosomal protein L9  42.28 
 
 		 150 aa  104  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4351  ribosomal protein L9  41.72 
 
 		 148 aa  104  6e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3281  50S ribosomal protein L9  44.22 
 
 		 150 aa  104  7e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.134585  hitchhiker  0.000210385 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0081  50S ribosomal protein L9  35.17 
 
 		 148 aa  103  8e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.957353  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0597  50S ribosomal protein L9  38.36 
 
 		 179 aa  103  9e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23320  ribosomal protein L9  43.45 
 
 		 147 aa  103  9e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.507738  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0889  50S ribosomal protein L9  37.25 
 
 		 194 aa  103  9e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  0.514488 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1205  ribosomal protein L9  41.89 
 
 		 151 aa  103  1e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1361  ribosomal protein L9  40.69 
 
 		 150 aa  103  1e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5418  50S ribosomal protein L9  37.2 
 
 		 190 aa  103  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0206045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1642  50S ribosomal protein L9  36.81 
 
 		 164 aa  103  1e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0557513  normal  0.0367892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>