197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1803 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1803  permease YjgP/YjgQ family protein  100 
 
 		 360 aa  721    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1949  permease, putative  46.22 
 
 		 359 aa  318  7e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000528059  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1297  permease YjgP/YjgQ family protein  46.47 
 
 		 358 aa  304  1.0000000000000001e-81  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0266045  normal  0.200906 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1424  permease YjgP/YjgQ family protein  42.38 
 
 		 360 aa  281  2e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.248764  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0375  permease YjgP/YjgQ family protein  44.97 
 
 		 361 aa  275  7e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0887769 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1432  permease YjgP/YjgQ family protein  28.93 
 
 		 359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1923  hypothetical protein  26.67 
 
 		 362 aa  109  6e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.24425e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0188  permease YjgP/YjgQ family protein  26.74 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258028  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1923  hypothetical protein  24.24 
 
 		 358 aa  103  3e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.765584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1248  permease YjgP/YjgQ  25.27 
 
 		 359 aa  104  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000476298  hitchhiker  0.00398949 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2588  permease YjgP/YjgQ family protein  26.27 
 
 		 359 aa  102  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3470  permease YjgP/YjgQ family protein  26.58 
 
 		 360 aa  97.8  2e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0220  permease YjgP/YjgQ  26.85 
 
 		 356 aa  93.6  5e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.633981 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1639  permease YjgP/YjgQ family protein  26.45 
 
 		 359 aa  93.6  5e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000266176  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3408  permease YjgP/YjgQ family protein  24.79 
 
 		 360 aa  90.9  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.328575  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1288  permease YjgP/YjgQ family protein  24.85 
 
 		 356 aa  87.8  2e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.030814  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3906  permease YjgP/YjgQ family protein  25.63 
 
 		 364 aa  87.8  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.101801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0302  hypothetical protein  24.53 
 
 		 359 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0495  permease YjgP/YjgQ  25.23 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0389  hypothetical protein  24.8 
 
 		 360 aa  83.2  0.000000000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.534497 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1307  permease YjgP/YjgQ family protein  20.72 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3735  permease YjgP/YjgQ family protein  22.13 
 
 		 359 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00300614  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1909  permease YjgP/YjgQ  24.28 
 
 		 354 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2026  permease YjgP/YjgQ family protein  24.59 
 
 		 358 aa  78.6  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.507643  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17610  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 1040 aa  75.9  0.000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1120  permease YjgP/YjgQ family protein  24.36 
 
 		 364 aa  72.4  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.187975 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2033  permease YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 360 aa  71.2  0.00000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.971288 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0106  permease YjgP/YjgQ family protein  23.12 
 
 		 356 aa  70.9  0.00000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0507  YjgP/YjgQ permease  24.86 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0678  hypothetical protein  26.86 
 
 		 362 aa  70.9  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0686  hypothetical protein  26 
 
 		 362 aa  70.5  0.00000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.743352  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0764  permease YjgP/YjgQ family protein  25.71 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.27721 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2369  permease YjgP/YjgQ family protein  21.63 
 
 		 359 aa  69.7  0.00000000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.792203  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01574  predicted permease  24.45 
 
 		 353 aa  69.3  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0334902  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4235  permease YjgP/YjgQ family protein  27.9 
 
 		 353 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2602  permease YjgP/YjgQ family protein  25.3 
 
 		 362 aa  69.3  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.193291  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1545  permease YjgP/YjgQ family protein  24.17 
 
 		 364 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2901  putative permease  24.17 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.220999  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0988  permease YjgP/YjgQ family protein  28.49 
 
 		 353 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.127526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3525  permease YjgP/YjgQ family protein  27.2 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.246904 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1141  putative permease  24.04 
 
 		 355 aa  67  0.0000000004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0157  permease YjgP/YjgQ family protein  25.07 
 
 		 1111 aa  66.2  0.0000000008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.0000684055  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0518  permease  20.75 
 
 		 356 aa  65.9  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.29406  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1020  permease YjgP/YjgQ family protein  28.22 
 
 		 353 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.362766  normal  0.829125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0983  permease YjgP/YjgQ family protein  28.22 
 
 		 353 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3560  permease YjgP/YjgQ  23.84 
 
 		 353 aa  65.1  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0179004  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0876  hypothetical membrane spanning protein  24.04 
 
 		 355 aa  65.5  0.000000002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1831  permease YjgP/YjgQ family protein  21.55 
 
 		 387 aa  64.7  0.000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1515  YjgP/YjgQ family protein  24.86 
 
 		 792 aa  64.7  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0797  hypothetical protein  24.32 
 
 		 352 aa  64.3  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0544635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0873  permease YjgP/YjgQ  24.61 
 
 		 351 aa  63.5  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000147876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2682  hypothetical protein  21.05 
 
 		 356 aa  62.8  0.000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2554  hypothetical protein  21.05 
 
 		 356 aa  62  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1093  permease YjgP/YjgQ  25.49 
 
 		 353 aa  61.6  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4049  hypothetical protein  24.46 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000497834  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3718  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0901  permease YjgP/YjgQ family protein  25.97 
 
 		 373 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.104569 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3677  permease YjgP/YjgQ family protein  24.46 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00250895  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3541  putative permease  24.46 
 
 		 358 aa  61.2  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000398482  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0743  putative permease  24.92 
 
 		 355 aa  60.8  0.00000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2177  permease YjgP/YjgQ  24.69 
 
 		 366 aa  60.8  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2785  permease YjgP/YjgQ family protein  23.27 
 
 		 358 aa  60.8  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661197  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1273  hypothetical protein  27.3 
 
 		 353 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17490  permease YjgP/YjgQ family protein  19.84 
 
 		 365 aa  60.5  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1370  hypothetical protein  23.55 
 
 		 352 aa  60.5  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14510  hypothetical protein  25.68 
 
 		 355 aa  60.5  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2825  permease YjgP/YjgQ family protein  23.27 
 
 		 352 aa  60.1  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0282438  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3472  permease YjgP/YjgQ family protein  23.78 
 
 		 362 aa  60.1  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0684  permease YjgP/YjgQ family protein  26.65 
 
 		 346 aa  59.7  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000671821  normal  0.0817909 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4195  permease YjgP/YjgQ family protein  24.25 
 
 		 358 aa  59.7  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1512  permease YjgP/YjgQ family protein  24.87 
 
 		 374 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1211  permease YjgP/YjgQ family protein  24.66 
 
 		 362 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000556533 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1284  hypothetical protein  25.68 
 
 		 355 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0501  hypothetical protein  18.47 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.183407 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3004  permease YjgP/YjgQ family protein  22.99 
 
 		 352 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000801817  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4390  permease YjgP/YjgQ family protein  19.25 
 
 		 391 aa  58.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1067  permease YjgP/YjgQ family protein  24.32 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000183228 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5799  YjgP/YjgQ like transporter  21.81 
 
 		 382 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0825514 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2464  permease YjgP/YjgQ  24.02 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0984614  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2907  permease YjgP/YjgQ family protein  22.99 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000245216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1395  permease YjgP/YjgQ family protein  23.96 
 
 		 360 aa  57  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.144867  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0538  permease YjgP/YjgQ family protein  24.67 
 
 		 368 aa  57  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0426669  normal  0.993388 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1542  hypothetical protein  22.99 
 
 		 362 aa  57  0.0000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2473  permease YjgP/YjgQ family protein  21.5 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2517  permease YjgP/YjgQ family protein  21.5 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2468  permease YjgP/YjgQ family protein  21.5 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2385  permease YjgP/YjgQ family protein  21.5 
 
 		 382 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1016  permease YjgP/YjgQ family protein  24.55 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00281225  normal  0.223874 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0926  permease YjgP/YjgQ family protein  22.69 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.133536  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1180  permease YjgP/YjgQ family protein  23.46 
 
 		 352 aa  56.6  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.182285  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3416  permease YjgP/YjgQ family protein  26.46 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.738379  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0826  permease YjgP/YjgQ family protein  21.5 
 
 		 382 aa  55.8  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.792817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1403  permease YjgP/YjgQ family protein  24.43 
 
 		 360 aa  55.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3080  permease YjgP/YjgQ  21.75 
 
 		 362 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0169896 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1352  permease YjgP/YjgQ family protein  21.04 
 
 		 1153 aa  55.1  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.929762  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1857  permease YjgP/YjgQ  21.18 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.693669  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0409  permease YjgP/YjgQ family protein  24.29 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1491  permease YjgP/YjgQ family protein  23.68 
 
 		 360 aa  54.3  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.269853  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1259  permease YjgP/YjgQ family protein  22.78 
 
 		 352 aa  54.3  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0237317  hitchhiker  0.000314396 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2312  permease YjgP/YjgQ  24.14 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>