More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1792 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 		 514 aa  1065    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  59.92 
 
 		 517 aa  637    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  71.05 
 
 		 595 aa  746    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  66.73 
 
 		 516 aa  743    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  66.47 
 
 		 520 aa  712    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  63.69 
 
 		 526 aa  678    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  61.09 
 
 		 542 aa  654    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  62.35 
 
 		 520 aa  664    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  67.13 
 
 		 520 aa  714    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  59.14 
 
 		 519 aa  623  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  59.73 
 
 		 517 aa  620  1e-176  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  57.28 
 
 		 518 aa  616  1e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  50.29 
 
 		 514 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  37.14 
 
 		 526 aa  326  7e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  36.56 
 
 		 527 aa  312  1e-83  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  36.96 
 
 		 526 aa  310  2.9999999999999997e-83  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  37.97 
 
 		 531 aa  310  4e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  36.63 
 
 		 528 aa  308  1.0000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  35.59 
 
 		 528 aa  301  2e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 		 528 aa  297  3e-79  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  36.25 
 
 		 538 aa  296  5e-79  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  33.93 
 
 		 528 aa  296  9e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  34.76 
 
 		 532 aa  293  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  36.55 
 
 		 532 aa  290  6e-77  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  34.81 
 
 		 524 aa  288  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  33.73 
 
 		 517 aa  285  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  36 
 
 		 460 aa  281  2e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  34.26 
 
 		 544 aa  280  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  34.45 
 
 		 527 aa  277  3e-73  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  34.85 
 
 		 556 aa  275  2.0000000000000002e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  33.92 
 
 		 520 aa  271  2e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  34.52 
 
 		 529 aa  271  2e-71  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  34.08 
 
 		 526 aa  270  5.9999999999999995e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  33.2 
 
 		 528 aa  268  1e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  34.08 
 
 		 526 aa  269  1e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  34.62 
 
 		 526 aa  268  2e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  34.98 
 
 		 530 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  32.3 
 
 		 523 aa  262  8.999999999999999e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  32.82 
 
 		 523 aa  262  1e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  32.66 
 
 		 528 aa  258  2e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  32.68 
 
 		 535 aa  255  2.0000000000000002e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  31.68 
 
 		 509 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  32.09 
 
 		 535 aa  251  3e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  33.53 
 
 		 528 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  31.93 
 
 		 530 aa  243  7e-63  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  31.69 
 
 		 514 aa  240  4e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  32.81 
 
 		 527 aa  238  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  31.23 
 
 		 533 aa  237  5.0000000000000005e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  31.35 
 
 		 533 aa  236  7e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  33.81 
 
 		 527 aa  236  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  33.53 
 
 		 526 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  32 
 
 		 512 aa  228  2e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  32.68 
 
 		 516 aa  226  7e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 531 aa  223  4.9999999999999996e-57  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  31.77 
 
 		 531 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  31.22 
 
 		 532 aa  220  5e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  31.22 
 
 		 532 aa  220  6e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  32.31 
 
 		 516 aa  219  7e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  31.63 
 
 		 528 aa  217  4e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  29.01 
 
 		 537 aa  217  4e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  31.56 
 
 		 538 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  29.58 
 
 		 521 aa  206  1e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  29.9 
 
 		 521 aa  204  3e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  31.06 
 
 		 526 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  29.43 
 
 		 544 aa  201  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  30.83 
 
 		 522 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  31.25 
 
 		 535 aa  193  7e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2957  4-phytase  29.83 
 
 		 520 aa  191  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  29.84 
 
 		 525 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3647  4-phytase  29.75 
 
 		 509 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.770065 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2790  extracellular solute-binding protein family 5  29.61 
 
 		 527 aa  188  2e-46  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  27.54 
 
 		 524 aa  188  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  29.96 
 
 		 532 aa  186  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  29.38 
 
 		 534 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16530  ABC-type dipeptide transport system, periplasmic component  30.54 
 
 		 510 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.564688 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  28.4 
 
 		 521 aa  179  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  28.49 
 
 		 549 aa  179  9e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0858  4-phytase  31.03 
 
 		 524 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.557115  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  28.4 
 
 		 521 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.4 
 
 		 521 aa  179  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  28.4 
 
 		 521 aa  179  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  28.4 
 
 		 521 aa  179  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2454  extracellular solute-binding protein  29.9 
 
 		 528 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.269908  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  29.52 
 
 		 505 aa  173  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2686  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 528 aa  172  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.0000382125  normal  0.980281 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  27.76 
 
 		 495 aa  170  6e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4615  4-phytase  29.35 
 
 		 502 aa  168  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1669  extracellular solute-binding protein  29.68 
 
 		 510 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  26.77 
 
 		 515 aa  164  3e-39  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  27.99 
 
 		 534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 534 aa  164  4.0000000000000004e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2920  extracellular solute-binding protein family 5  29.23 
 
 		 515 aa  161  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2678  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 500 aa  161  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00233729  normal  0.64261 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  26.94 
 
 		 525 aa  161  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2056  periplasmic dipeptide transport protein precursor  26.97 
 
 		 532 aa  160  4e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.184376  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3828  dipeptide ABC transporter periplasmic dipeptide-binding protein  27.22 
 
 		 526 aa  160  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.808847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3907  extracellular solute-binding protein family 5  27.79 
 
 		 535 aa  160  7e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0138  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 535 aa  159  8e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0114  extracellular solute-binding protein  27.45 
 
 		 530 aa  159  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3103  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 519 aa  159  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.376049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>