More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1791 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1791  aminodeoxychorismate lyase  100 
 
 		 339 aa  699    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00439567  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1129  aminodeoxychorismate lyase  51.82 
 
 		 336 aa  315  6e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.399769 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2351  aminodeoxychorismate lyase  49.38 
 
 		 620 aa  288  1e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.260551 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0308  aminodeoxychorismate lyase  49.38 
 
 		 440 aa  287  1e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0315  aminodeoxychorismate lyase  46.77 
 
 		 389 aa  265  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0030  aminodeoxychorismate lyase  43.61 
 
 		 349 aa  253  4.0000000000000004e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.647846  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0625  aminodeoxychorismate lyase  40.79 
 
 		 357 aa  238  6.999999999999999e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512441  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1997  hypothetical protein  39.64 
 
 		 331 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0650  periplasmic solute-binding protein, aminodeoxychorismate lyase-like  40.38 
 
 		 356 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.368295  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3387  aminodeoxychorismate lyase  41 
 
 		 329 aa  209  4e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.107935  normal  0.0743499 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1501  aminodeoxychorismate lyase  38.07 
 
 		 334 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00653214  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4657  aminodeoxychorismate lyase  38 
 
 		 362 aa  205  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.333524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1716  aminodeoxychorismate lyase  38.24 
 
 		 333 aa  204  1e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.998027  normal  0.24374 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1988  aminodeoxychorismate lyase  38.24 
 
 		 345 aa  204  2e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2504  aminodeoxychorismate lyase  44.83 
 
 		 337 aa  204  3e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.917927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2198  hypothetical protein  37.31 
 
 		 349 aa  203  4e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.850653  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25730  hypothetical protein  37.2 
 
 		 349 aa  202  5e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0867332  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2459  aminodeoxychorismate lyase  38.38 
 
 		 344 aa  202  8e-51  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.5911  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1077  aminodeoxychorismate lyase  39.24 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.578473  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1633  hypothetical protein  37.13 
 
 		 355 aa  199  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3279  aminodeoxychorismate lyase  38.34 
 
 		 376 aa  198  1.0000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.258116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0918  aminodeoxychorismate lyase  37.01 
 
 		 345 aa  197  2.0000000000000003e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.174013  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1863  aminodeoxychorismate lyase  36.21 
 
 		 356 aa  197  3e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.322444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1543  hypothetical protein  36.22 
 
 		 340 aa  195  1e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2198  aminodeoxychorismate lyase  36.13 
 
 		 331 aa  194  2e-48  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.955684 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1605  aminodeoxychorismate lyase  36.58 
 
 		 339 aa  194  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0288124  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1417  aminodeoxychorismate lyase  37.23 
 
 		 338 aa  194  3e-48  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.626218  normal  0.75601 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0005  aminodeoxychorismate lyase  38.79 
 
 		 327 aa  192  6e-48  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000992333  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1467  aminodeoxychorismate lyase  37.09 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0630531  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14960  hypothetical protein  36.92 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1004  aminodeoxychorismate lyase  43.23 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1830  aminodeoxychorismate lyase  36.69 
 
 		 342 aa  191  2e-47  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1544  aminodeoxychorismate lyase  37.35 
 
 		 333 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0483176  normal  0.0781021 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1877  aminodeoxychorismate lyase  38.56 
 
 		 328 aa  189  7e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.10744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1632  aminodeoxychorismate lyase  35.91 
 
 		 351 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0682  aminodeoxychorismate lyase  36.75 
 
 		 333 aa  186  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0424367  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1783  hypothetical protein  37.46 
 
 		 377 aa  186  4e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0308564  normal  0.608544 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1494  aminodeoxychorismate lyase  35.76 
 
 		 400 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3828  hypothetical protein  34.12 
 
 		 379 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0420652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1651  hypothetical protein  35.05 
 
 		 371 aa  186  7e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.245799  normal  0.342253 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4153  aminodeoxychorismate lyase  38.16 
 
 		 393 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.507493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1529  aminodeoxychorismate lyase  36.39 
 
 		 387 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.538963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1426  aminodeoxychorismate lyase  38.8 
 
 		 332 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.219736  normal  0.242343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1042  aminodeoxychorismate lyase  36.09 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0148163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2254  aminodeoxychorismate lyase  37.76 
 
 		 323 aa  182  6e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1861  hypothetical protein  38.58 
 
 		 337 aa  181  1e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0824281 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0557  aminodeoxychorismate lyase  37.46 
 
 		 326 aa  181  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.245938  normal  0.0550645 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3413  aminodeoxychorismate lyase  41.03 
 
 		 334 aa  181  1e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1918  aminodeoxychorismate lyase  35.35 
 
 		 421 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.204138  unclonable  0.000000331509 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3021  aminodeoxychorismate lyase  34.44 
 
 		 358 aa  181  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.157507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3796  aminodeoxychorismate lyase  35.35 
 
 		 406 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.77523  normal  0.494507 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0607  hypothetical protein  35.59 
 
 		 370 aa  181  2e-44  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000669467  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1578  hypothetical protein  35.4 
 
 		 343 aa  180  2.9999999999999997e-44  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00227984  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0694  aminodeoxychorismate lyase  35.06 
 
 		 327 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000296609 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1910  aminodeoxychorismate lyase  35.33 
 
 		 341 aa  180  2.9999999999999997e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000953369  decreased coverage  0.000000738863 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0484  aminodeoxychorismate lyase  32.91 
 
 		 335 aa  180  4e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1829  aminodeoxychorismate lyase  36.07 
 
 		 332 aa  179  4.999999999999999e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.021454  normal  0.121238 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1532  hypothetical protein  36.26 
 
 		 414 aa  179  5.999999999999999e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0269325  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2520  aminodeoxychorismate lyase  37.69 
 
 		 325 aa  179  8e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0480566  hitchhiker  0.003327 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2268  aminodeoxychorismate lyase  33.82 
 
 		 343 aa  178  1e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.642  normal  0.198206 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003000  hypothetical protein  35.78 
 
 		 338 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0577137  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0508  hypothetical protein  37.62 
 
 		 340 aa  177  3e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1254  aminodeoxychorismate lyase  38.62 
 
 		 345 aa  177  3e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.874489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2241  aminodeoxychorismate lyase  33.04 
 
 		 337 aa  176  6e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1776  aminodeoxychorismate lyase  37.25 
 
 		 355 aa  175  9e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.81136  normal  0.183273 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1497  aminodeoxychorismate lyase  39.92 
 
 		 351 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02713  hypothetical protein  37.42 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.117678  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0882  aminodeoxychorismate lyase  34.9 
 
 		 357 aa  175  9.999999999999999e-43  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.871937 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1690  aminodeoxychorismate lyase  37.5 
 
 		 341 aa  174  9.999999999999999e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0437285  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0748  aminodeoxychorismate lyase  37.12 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0967  aminodeoxychorismate lyase  34.64 
 
 		 357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.829028  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3494  hypothetical protein  37.5 
 
 		 363 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000556203  normal  0.010619 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02331  hypothetical protein  36.77 
 
 		 316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1582  hypothetical protein  38.06 
 
 		 341 aa  174  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000314961  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0473  periplasmic solute-binding protein  33.53 
 
 		 345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0206414  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2262  aminodeoxychorismate lyase  32.74 
 
 		 344 aa  173  2.9999999999999996e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.945495  hitchhiker  0.000317634 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1743  hypothetical protein  31.8 
 
 		 333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2044  hypothetical protein  36.18 
 
 		 324 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.47923  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2215  aminodeoxychorismate lyase  35.23 
 
 		 345 aa  172  5e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1203  aminodeoxychorismate lyase  36.84 
 
 		 405 aa  172  5e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148773 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1765  aminodeoxychorismate lyase  33.92 
 
 		 391 aa  172  6.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.310683  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3618  aminodeoxychorismate lyase  32.42 
 
 		 362 aa  172  7.999999999999999e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000276729  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1641  hypothetical protein  36.45 
 
 		 350 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.667934  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1488  hypothetical protein  34.18 
 
 		 346 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0806646  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1584  aminodeoxychorismate lyase  36.45 
 
 		 364 aa  171  1e-41  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0339039  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1871  aminodeoxychorismate lyase  37.15 
 
 		 336 aa  171  1e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1603  hypothetical protein  33.23 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0141578  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2026  hypothetical protein  31.5 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1090  aminodeoxychorismate lyase  37.89 
 
 		 331 aa  171  2e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1947  aminodeoxychorismate lyase  40.53 
 
 		 335 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.817857 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1591  aminodeoxychorismate lyase  35.38 
 
 		 343 aa  170  4e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0649717  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2516  aminodeoxychorismate lyase  37.01 
 
 		 351 aa  170  4e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.470286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1660  aminodeoxychorismate lyase  34.78 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.132451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1735  aminodeoxychorismate lyase  34.78 
 
 		 336 aa  169  5e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.163239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02904  hypothetical protein  33.43 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1060  aminodeoxychorismate lyase  36.26 
 
 		 412 aa  169  8e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.017221 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1275  hypothetical protein  32.72 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.310439  normal  0.846206 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1661  aminodeoxychorismate lyase  35.5 
 
 		 341 aa  168  1e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.148869  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1435  aminodeoxychorismate lyase  34.42 
 
 		 344 aa  168  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1612  hypothetical protein  32.05 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000845082  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>