More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1788 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1788  signal peptide peptidase SppA, 67K type  100 
 
 		 611 aa  1246    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.969097  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03044  protease  40.69 
 
 		 616 aa  434  1e-120  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2055  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.72 
 
 		 615 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000100228  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2411  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.1 
 
 		 615 aa  432  1e-120  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000075558  hitchhiker  0.0002095 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2294  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.62 
 
 		 615 aa  433  1e-120  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.00000000944101  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2078  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.2 
 
 		 615 aa  431  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000218784  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002913  protease IV  40.82 
 
 		 616 aa  431  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000149898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2051  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.55 
 
 		 615 aa  432  1e-119  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00884416  hitchhiker  0.0000000000873335 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2420  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.33 
 
 		 614 aa  422  1e-117  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1941  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.3 
 
 		 613 aa  423  1e-117  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0528777  normal  0.0163156 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2253  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.77 
 
 		 613 aa  422  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00027249  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1909  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.1 
 
 		 614 aa  421  1e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000036932  hitchhiker  0.0000182105 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2069  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.5 
 
 		 614 aa  420  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000747082  hitchhiker  0.00035323 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1964  signal peptide peptidase SppA, 67K type  40.16 
 
 		 614 aa  421  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000013501  hitchhiker  0.00412535 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2299  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.94 
 
 		 613 aa  413  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000354581  normal  0.336297 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2311  acid phosphatase  39.21 
 
 		 612 aa  411  1e-113  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000317657  hitchhiker  0.000195822 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1901  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.94 
 
 		 613 aa  409  1e-113  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000029404  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2157  protease IV (endopeptidase IV)  39.02 
 
 		 617 aa  406  1.0000000000000001e-112  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2585  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.58 
 
 		 637 aa  403  1e-111  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1579  protease IV  40.13 
 
 		 616 aa  403  1e-111  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000832547  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2210  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.82 
 
 		 616 aa  401  9.999999999999999e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1723  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.85 
 
 		 617 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000437439  normal  0.0649195 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1970  protease 4  37.74 
 
 		 616 aa  396  1e-109  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.281538  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2266  protease 4  37.78 
 
 		 616 aa  397  1e-109  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2051  protease 4  37.82 
 
 		 618 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.278981 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1880  protease 4  37.82 
 
 		 618 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000366121  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2367  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.74 
 
 		 620 aa  398  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1406  protease 4  37.82 
 
 		 618 aa  397  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.147485  normal  0.119343 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1422  protease 4  37.62 
 
 		 618 aa  396  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.671113 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1389  protease 4  37.5 
 
 		 618 aa  395  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.146845  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  38.06 
 
 		 614 aa  392  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000233078  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01735  protease IV (signal peptide peptidase)  36.6 
 
 		 618 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0080246  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1876  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.6 
 
 		 618 aa  387  1e-106  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00501003  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1425  protease 4  36.6 
 
 		 622 aa  387  1e-106  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.107145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2021  protease 4  36.6 
 
 		 618 aa  388  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124959  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1866  protease 4  36.6 
 
 		 618 aa  387  1e-106  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.235233  decreased coverage  0.00000640053 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01723  hypothetical protein  36.6 
 
 		 618 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1850  protease 4  36.6 
 
 		 618 aa  387  1e-106  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0115674  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2722  protease 4  38.73 
 
 		 618 aa  384  1e-105  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.35096  hitchhiker  0.004785 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1990  protease 4  36.44 
 
 		 618 aa  384  1e-105  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0152485  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1983  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.48 
 
 		 617 aa  384  1e-105  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.265279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1681  protease 4  36.73 
 
 		 618 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.239548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0908  protease IV family protein  36.63 
 
 		 621 aa  380  1e-104  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.378235  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2486  protease 4  36.6 
 
 		 618 aa  378  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.944254  normal  0.176457 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01643  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.95 
 
 		 621 aa  378  1e-103  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.20854  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1968  signal peptide peptidase SppA, 67K type  39.56 
 
 		 617 aa  379  1e-103  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.845166  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2346  protease 4  38 
 
 		 616 aa  374  1e-102  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000106232  decreased coverage  0.00400443 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2091  protease 4  37.84 
 
 		 616 aa  370  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1982  protease 4  37.8 
 
 		 616 aa  366  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000207213  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0897  translation elongation factor G  38.14 
 
 		 610 aa  363  6e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000153698 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0442  protease 4  34.83 
 
 		 618 aa  360  3e-98  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.116179  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4062  signal peptide peptidase SppA, 67K type  42.13 
 
 		 613 aa  352  1e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.244218  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04043  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.21 
 
 		 629 aa  335  2e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3597  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.7 
 
 		 640 aa  334  3e-90  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2235  protease IV  36.48 
 
 		 633 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2145  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.3 
 
 		 633 aa  326  6e-88  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1737  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.79 
 
 		 605 aa  290  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.000998332  decreased coverage  0.00000852075 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2080  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.79 
 
 		 605 aa  290  6e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0522  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.13 
 
 		 626 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200693  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3074  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.69 
 
 		 590 aa  288  2e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250927 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0306  signal peptide peptidase SppA  35.29 
 
 		 609 aa  286  7e-76  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.0000532675  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3060  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.32 
 
 		 625 aa  286  9e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3962  signal peptide peptidase SppA, 67K type  33.1 
 
 		 605 aa  271  2.9999999999999997e-71  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2462  peptidase S49, protease IV  32.53 
 
 		 609 aa  264  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0639  signal peptide peptidase SppA, 67K type  37.37 
 
 		 595 aa  261  2e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.352059 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5841  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.19 
 
 		 587 aa  261  2e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2221  signal peptide peptidase SppA, 67K type  35.49 
 
 		 661 aa  260  4e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.431319 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4597  signal peptide peptidase SppA  30.82 
 
 		 611 aa  259  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.129173  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1590  signal peptide peptidase A  31.97 
 
 		 608 aa  257  5e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1095  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.14 
 
 		 598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1124  signal peptide peptidase SppA, 67K type  32.14 
 
 		 598 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.712372 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1223  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.22 
 
 		 590 aa  255  2.0000000000000002e-66  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  unclonable  0.000000375913  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0656  hypothetical protein  34.99 
 
 		 513 aa  254  4.0000000000000004e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2467  protease IV; signal peptide peptidase  33.33 
 
 		 583 aa  246  9.999999999999999e-64  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.023523 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1718  signal peptide peptidase SppA, 67K type  36.12 
 
 		 585 aa  236  1.0000000000000001e-60  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2408  signal peptide peptidase SppA, 67K type  30.31 
 
 		 589 aa  230  7e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.150308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2128  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.77 
 
 		 604 aa  228  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2800  signal peptide peptidase SppA, 67K type  34.92 
 
 		 588 aa  223  9e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.17427 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0579  signal peptide peptidase A  31.32 
 
 		 569 aa  198  2.0000000000000003e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.766562  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1138  signal peptide peptidase A  34.04 
 
 		 834 aa  193  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2771  signal peptide peptidase SppA, 36K type  27.72 
 
 		 584 aa  189  1e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1320  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.36 
 
 		 595 aa  188  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.3 
 
 		 562 aa  186  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8173  signal peptide peptidase SppA, 67K type  29.3 
 
 		 566 aa  186  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1267  signal peptide peptidase SppA, 36K type  32.94 
 
 		 834 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2863  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.96 
 
 		 563 aa  182  1e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.241333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1704  peptidase S49, protease IV  29.87 
 
 		 601 aa  182  2e-44  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.100824  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1042  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.42 
 
 		 593 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.824188  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1058  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.42 
 
 		 593 aa  181  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1402  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.5 
 
 		 649 aa  181  4e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0628867  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2179  signal peptide peptidase SppA, 36K type  47.16 
 
 		 299 aa  180  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1070  signal peptide peptidase SppA, 67K type  31.49 
 
 		 593 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.818145 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1434  peptidase S49  29.16 
 
 		 552 aa  176  1.9999999999999998e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1198  signal peptide peptidase SppA, 36K type  33.8 
 
 		 834 aa  175  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0603  signal peptide peptidase SppA, 36K type  28.82 
 
 		 597 aa  172  1e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.849681  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1186  signal peptide peptidase SppA, 36K type  31.09 
 
 		 831 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.504842 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0556  signal peptide peptidase A  30.94 
 
 		 601 aa  173  1e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10738  protease IV sppA  31.4 
 
 		 623 aa  172  1e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0110097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0670  signal peptide peptidase SppA, 36K type  29.07 
 
 		 597 aa  171  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0052  signal peptide peptidase SppA, 36K type  45 
 
 		 296 aa  171  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>