226 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1776 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1776  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  100 
 
 		 411 aa  843    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0350095  n/a   
 
 
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NC_008554  Sfum_0711  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  60.31 
 
 		 460 aa  462  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.62516  normal  1 
 
 
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NC_009943  Dole_1893  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  57.33 
 
 		 454 aa  448  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.836798  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3041  L-lysine 2,3-aminomutase  56.68 
 
 		 527 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010001  Cphy_1643  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.56 
 
 		 393 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1916  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  52.68 
 
 		 403 aa  375  1e-102  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010718  Nther_1886  L-lysine 2,3-aminomutase  49.03 
 
 		 420 aa  366  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185712 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1079  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.82 
 
 		 440 aa  365  1e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0133  L-lysine 2,3-aminomutase  47.35 
 
 		 730 aa  364  1e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013223  Dret_0696  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.86 
 
 		 440 aa  362  6e-99  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000415374  normal  0.0401463 
 
 
-
 
NC_002950  PG1070  L-lysine 2,3-aminomutase  49.17 
 
 		 416 aa  360  2e-98  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.628059 
 
 
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NC_002936  DET0221  GNAT family L-lysine 2,3-aminomutase/acetyltransferase  46.67 
 
 		 708 aa  356  2.9999999999999997e-97  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.893806  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_197  L-lysine 2,3-aminomutase/beta-lysine acetyltransferase, GNAT family  46.67 
 
 		 730 aa  355  5.999999999999999e-97  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.34 
 
 		 423 aa  355  5.999999999999999e-97  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.863108  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0215  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50 
 
 		 437 aa  354  1e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2118  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.91 
 
 		 472 aa  354  2e-96  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.284772  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2886  L-lysine 2,3-aminomutase  46.56 
 
 		 416 aa  352  5e-96  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.623873 
 
 
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NC_009674  Bcer98_1688  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.34 
 
 		 472 aa  352  5.9999999999999994e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.157129  n/a   
 
 
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NC_007512  Plut_1576  hypothetical protein  48.61 
 
 		 438 aa  352  7e-96  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0162039 
 
 
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NC_007519  Dde_0189  L-lysine 2,3-aminomutase  48.86 
 
 		 454 aa  352  8e-96  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2325  L-lysine 2,3-aminomutase  46.63 
 
 		 473 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_003909  BCE_2334  L-lysine 2,3-aminomutase  46.63 
 
 		 473 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005945  BAS2145  L-lysine 2,3-aminomutase  46.63 
 
 		 473 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_005957  BT9727_2083  lysine 2,3-aminomutase  46.63 
 
 		 473 aa  351  1e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2079  lysine 2,3-aminomutase  46.63 
 
 		 473 aa  351  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.492987  n/a   
 
 
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NC_007530  GBAA_2300  L-lysine 2,3-aminomutase  46.63 
 
 		 473 aa  351  1e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011059  Paes_0802  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.22 
 
 		 437 aa  351  1e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011658  BCAH187_A2408  L-lysine 2,3-aminomutase  46.63 
 
 		 473 aa  351  1e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.481514  n/a   
 
 
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NC_011725  BCB4264_A2281  L-lysine 2,3-aminomutase  47.06 
 
 		 473 aa  351  2e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009637  MmarC7_0106  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.82 
 
 		 433 aa  350  2e-95  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.928991  normal  0.154212 
 
 
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NC_013216  Dtox_0600  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.18 
 
 		 427 aa  349  4e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011772  BCG9842_B3042  L-lysine 2,3-aminomutase  46.78 
 
 		 473 aa  348  7e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.137592  normal  1 
 
 
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NC_009975  MmarC6_1795  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.09 
 
 		 433 aa  348  1e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009135  MmarC5_0666  L-lysine 2,3-aminomutase  45.55 
 
 		 433 aa  347  2e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0598217  n/a   
 
 
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NC_010003  Pmob_1080  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.5 
 
 		 436 aa  347  2e-94  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007955  Mbur_0274  L-lysine 2,3-aminomutase  45.88 
 
 		 435 aa  346  3e-94  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013173  Dbac_0211  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.07 
 
 		 437 aa  346  3e-94  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009634  Mevan_1223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.23 
 
 		 433 aa  346  3e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010831  Cphamn1_1649  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.68 
 
 		 437 aa  346  5e-94  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
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NC_007498  Pcar_1401  hypothetical protein  48.3 
 
 		 457 aa  345  6e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.536513  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0207  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.66 
 
 		 422 aa  345  8.999999999999999e-94  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008942  Mlab_0345  L-lysine 2,3-aminomutase  46.33 
 
 		 453 aa  344  2e-93  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000388257  normal  1 
 
 
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NC_010424  Daud_0171  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  51.25 
 
 		 420 aa  342  5.999999999999999e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013552  DhcVS_569  lysine 2,3-aminomutase  43.9 
 
 		 439 aa  341  2e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_002936  DET0628  radical SAM domain-containing protein  44.72 
 
 		 439 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00861881  n/a   
 
 
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NC_009635  Maeo_0240  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  44.99 
 
 		 437 aa  338  8e-92  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009455  DehaBAV1_0601  L-lysine 2,3-aminomutase  43.63 
 
 		 439 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007355  Mbar_A0670  L-lysine 2,3-aminomutase  45.58 
 
 		 414 aa  336  5.999999999999999e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.420719 
 
 
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NC_008025  Dgeo_0988  hypothetical protein  47.19 
 
 		 483 aa  335  7.999999999999999e-91  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.709939  normal  0.113697 
 
 
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NC_013501  Rmar_0136  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.95 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.192198  n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_3939  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.07 
 
 		 419 aa  325  7e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0153502  normal  0.0100362 
 
 
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NC_009483  Gura_2149  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  50.29 
 
 		 347 aa  325  9e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000218503  n/a   
 
 
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NC_007498  Pcar_2520  hypothetical protein  49.86 
 
 		 347 aa  325  1e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.707016  n/a   
 
 
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NC_009253  Dred_0740  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.79 
 
 		 406 aa  325  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008346  Swol_1121  lysine 2,3-aminomutase  39.01 
 
 		 422 aa  323  3e-87  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011145  AnaeK_1301  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.56 
 
 		 415 aa  322  9.000000000000001e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.156548  n/a   
 
 
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NC_011891  A2cp1_1402  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.56 
 
 		 415 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.522319  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_2548  L-lysine 2,3-aminomutase  45.56 
 
 		 375 aa  320  3e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1315  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  45.27 
 
 		 413 aa  320  3.9999999999999996e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.603808  normal  1 
 
 
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NC_013385  Adeg_1408  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.65 
 
 		 427 aa  319  6e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_1840  L-lysine 2,3-aminomutase  48.84 
 
 		 344 aa  317  3e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000138489  normal  1 
 
 
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NC_010424  Daud_1068  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.25 
 
 		 419 aa  317  3e-85  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000489798  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1821  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  48.41 
 
 		 344 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00597572 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1765  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  49.22 
 
 		 346 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.930699  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0457  L-lysine 2,3-aminomutase  42.46 
 
 		 415 aa  311  9e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0632034  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1754  L-lysine 2,3-aminomutase  48.41 
 
 		 353 aa  310  2.9999999999999997e-83  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.117521  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2274  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.27 
 
 		 407 aa  310  2.9999999999999997e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2398  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  47.26 
 
 		 344 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.723604  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0599  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.11 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1337  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.82 
 
 		 413 aa  305  1.0000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0608146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2931  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.06 
 
 		 408 aa  303  4.0000000000000003e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000971208  normal  0.769663 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2148  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.22 
 
 		 422 aa  299  8e-80  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0796  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.61 
 
 		 374 aa  297  2e-79  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0099  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41 
 
 		 365 aa  296  3e-79  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.521426  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1768  L-lysine 2,3-aminomutase  38.27 
 
 		 412 aa  295  9e-79  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.303353 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1316  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.32 
 
 		 385 aa  295  1e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1302  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.42 
 
 		 402 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.188876  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4485  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.82 
 
 		 381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1403  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.87 
 
 		 402 aa  283  3.0000000000000004e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2513  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  46.5 
 
 		 358 aa  280  4e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2547  L-lysine 2,3-aminomutase  40.6 
 
 		 402 aa  280  4e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4018  radical SAM domain-containing protein  44.28 
 
 		 360 aa  277  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.288086 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2103  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  53.44 
 
 		 341 aa  273  4.0000000000000004e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0224  L-lysine 2,3-aminomutase  45.24 
 
 		 324 aa  261  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.620911  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0377  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.11 
 
 		 356 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.284595 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4014  L-lysine 2,3-aminomutase  44.89 
 
 		 364 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1818  lysine 2,3-aminomutase  40.41 
 
 		 397 aa  253  6e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3223  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  43.24 
 
 		 356 aa  250  3e-65  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007964  Nham_2300  hypothetical protein  44.93 
 
 		 366 aa  248  1e-64  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.286942  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1886  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.49 
 
 		 356 aa  248  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3797  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  39.94 
 
 		 350 aa  248  2e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0445503  normal  0.635435 
 
 
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NC_009050  Rsph17029_3965  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  42.5 
 
 		 345 aa  248  2e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012850  Rleg_4126  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  38.55 
 
 		 350 aa  247  3e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.100876  normal  0.401423 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2794  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.79 
 
 		 363 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
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NC_009429  Rsph17025_3212  hypothetical protein  45.7 
 
 		 340 aa  247  3e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010725  Mpop_3192  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.25 
 
 		 353 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007494  RSP_3227  L-lysine 2,3-aminomutase  42.19 
 
 		 340 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011666  Msil_0453  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  41.19 
 
 		 363 aa  243  3e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.284633 
 
 
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NC_010172  Mext_3003  lysine 2,3-aminomutase YodO family protein  40.12 
 
 		 353 aa  242  7e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.108543  normal  1 
 
 
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NC_007778  RPB_2954  hypothetical protein  42.09 
 
 		 363 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
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