More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1754 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1754  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 547 aa  1120    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0325052  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0772  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.57 
 
 		 551 aa  593  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2697  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  49.1 
 
 		 579 aa  545  1e-153  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.278242 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0210  AhpF family protein/thioredoxin reductase  50.09 
 
 		 550 aa  531  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.018  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2077  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.13 
 
 		 602 aa  521  1e-146  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3874  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  46.37 
 
 		 548 aa  464  1e-129  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.697389  normal  0.0433305 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1278  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  42.91 
 
 		 316 aa  240  4e-62  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0097  thioredoxin reductase  45.22 
 
 		 320 aa  233  8.000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.653318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0823  thioredoxin reductase  41.78 
 
 		 396 aa  230  6e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0254  thioredoxin reductase  45.79 
 
 		 308 aa  227  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0385075  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0567  thioredoxin reductase  40.06 
 
 		 340 aa  227  3e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.132959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2972  thioredoxin reductase  42.71 
 
 		 315 aa  225  1e-57  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000488903  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0760  thioredoxin reductase  42.52 
 
 		 323 aa  224  4.9999999999999996e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.474741  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0924  thioredoxin reductase  42.52 
 
 		 304 aa  223  8e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3149  thioredoxin reductase  42.67 
 
 		 318 aa  218  2e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2453  thioredoxin reductase  44.78 
 
 		 321 aa  218  2.9999999999999998e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.62912 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1576  thioredoxin reductase  42.35 
 
 		 317 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2112  thioredoxin reductase  43.85 
 
 		 324 aa  216  8e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2880  thioredoxin reductase  44.52 
 
 		 321 aa  215  9.999999999999999e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.805293  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2420  thioredoxin reductase  42.71 
 
 		 304 aa  215  1.9999999999999998e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0228  thioredoxin reductase  42.24 
 
 		 312 aa  214  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0058  thioredoxin reductase  41.53 
 
 		 317 aa  214  4.9999999999999996e-54  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00992397  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0381  thioredoxin reductase  42.86 
 
 		 326 aa  213  7.999999999999999e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1512  thioredoxin reductase  41.98 
 
 		 309 aa  213  7.999999999999999e-54  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000715153  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1779  thioredoxin reductase  42.46 
 
 		 308 aa  212  1e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2685  thioredoxin reductase  45.27 
 
 		 318 aa  212  1e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.118835 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2471  thioredoxin-disulfide reductase  40.2 
 
 		 302 aa  212  1e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000932394  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0058  thioredoxin reductase  41.2 
 
 		 317 aa  212  1e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0360012  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0680  thioredoxin reductase  44.9 
 
 		 320 aa  211  3e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0359349  normal  0.0127651 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0256  thioredoxin reductase  40.19 
 
 		 335 aa  211  4e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.464072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6803  thioredoxin reductase, FAD/NAD(P)-binding  43 
 
 		 321 aa  211  4e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.2043  normal  0.741138 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4027  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 323 aa  210  5e-53  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1834  alkyl hydroperoxide reductase, subunit F  30.65 
 
 		 510 aa  210  6e-53  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0190333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0181  thioredoxin reductase  41.56 
 
 		 334 aa  209  7e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3701  thioredoxin reductase  40.2 
 
 		 318 aa  209  8e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.600246  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6431  thioredoxin reductase  40.34 
 
 		 310 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.2716 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1919  thioredoxin reductase  42.11 
 
 		 306 aa  209  9e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0294  thioredoxin reductase  41.25 
 
 		 304 aa  209  1e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3793  thioredoxin reductase  42.38 
 
 		 325 aa  209  2e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.119595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0114  thioredoxin reductase  42.07 
 
 		 304 aa  207  3e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0114  thioredoxin reductase  39.93 
 
 		 308 aa  207  5e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000498339  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3408  thioredoxin reductase  40.44 
 
 		 320 aa  207  6e-52  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.15977  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2879  thioredoxin reductase  44.26 
 
 		 312 aa  206  6e-52  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5262  thioredoxin reductase  38.61 
 
 		 318 aa  206  1e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5243  thioredoxin-disulfide reductase  38.61 
 
 		 318 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5007  thioredoxin reductase  38.61 
 
 		 321 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.548386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4836  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  38.61 
 
 		 321 aa  206  1e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4851  thioredoxin-disulfide reductase (thioredoxin reductase (NADPH))  38.61 
 
 		 321 aa  206  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.881258  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5277  thioredoxin-disulfide reductase  39.27 
 
 		 318 aa  206  1e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.450322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5387  thioredoxin reductase  38.61 
 
 		 318 aa  206  1e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3338  thioredoxin reductase  40.88 
 
 		 331 aa  206  1e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5319  thioredoxin-disulfide reductase  38.61 
 
 		 318 aa  206  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0614  thioredoxin reductase  40.59 
 
 		 313 aa  205  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.305667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5778  thioredoxin reductase  40.33 
 
 		 333 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0605147  normal  0.600469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5402  thioredoxin reductase  40.33 
 
 		 333 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5491  thioredoxin reductase  40.33 
 
 		 333 aa  204  3e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0634892  normal  0.216162 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4951  thioredoxin reductase  38.94 
 
 		 318 aa  204  4e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.414255  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1013  thioredoxin reductase  38.93 
 
 		 308 aa  204  4e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5680  thioredoxin-disulfide reductase  39.34 
 
 		 318 aa  203  6e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2772  thioredoxin reductase  43.19 
 
 		 321 aa  203  8e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0600  thioredoxin reductase  37.58 
 
 		 317 aa  203  9e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00298127  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1576  thioredoxin reductase  43.19 
 
 		 327 aa  202  9.999999999999999e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.608559  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2262  thioredoxin reductase  39.22 
 
 		 319 aa  201  1.9999999999999998e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0017275  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7328  thioredoxin reductase  38.98 
 
 		 348 aa  201  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0622  thioredoxin reductase  41.08 
 
 		 312 aa  202  1.9999999999999998e-50  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00106042  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0518  thioredoxin reductase  38.31 
 
 		 306 aa  201  3e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0376  thioredoxin reductase  37.5 
 
 		 310 aa  201  3e-50  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000265637  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1512  thioredoxin reductase  42.63 
 
 		 321 aa  201  3e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2441  thioredoxin reductase  43.43 
 
 		 345 aa  201  3e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0877885  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3838  thioredoxin reductase  42.76 
 
 		 321 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1453  thioredoxin reductase  42.72 
 
 		 321 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.904503 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2362  thioredoxin reductase  39.54 
 
 		 318 aa  201  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1853  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  40.61 
 
 		 305 aa  200  6e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6067  thioredoxin reductase  40.74 
 
 		 331 aa  200  6e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.976607  normal  0.125234 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1731  thioredoxin reductase  38.24 
 
 		 316 aa  199  9e-50  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0101  thioredoxin reductase  40.85 
 
 		 306 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.386376  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2750  thioredoxin-disulfide reductase  40.61 
 
 		 312 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2436  thioredoxin-disulfide reductase  40.61 
 
 		 312 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3203  thioredoxin reductase  41.91 
 
 		 361 aa  198  2.0000000000000003e-49  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.121454  normal  0.627549 
 
 
-
 
NC_002936  DET0542  thioredoxin-disulfide reductase  36.75 
 
 		 306 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0375  thioredoxin-disulfide reductase  40.13 
 
 		 323 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1283  thioredoxin reductase  37.5 
 
 		 320 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1985  thioredoxin reductase  38.49 
 
 		 320 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.594025  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0545  thioredoxin reductase  40.13 
 
 		 323 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.192083  hitchhiker  0.00000399991 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3070  thioredoxin reductase  37.13 
 
 		 316 aa  198  2.0000000000000003e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000407332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_483  thioredoxin reductase  37.09 
 
 		 306 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0414  thioredoxin reductase  40.52 
 
 		 314 aa  199  2.0000000000000003e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0681074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3328  thioredoxin reductase  37.46 
 
 		 318 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1344  thioredoxin-disulfide reductase  37.5 
 
 		 320 aa  198  2.0000000000000003e-49  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1293  thioredoxin reductase  38.69 
 
 		 320 aa  197  3e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.429956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1026  thioredoxin reductase  40.86 
 
 		 324 aa  198  3e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.15779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2424  thioredoxin reductase  39.2 
 
 		 320 aa  197  3e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0211  thioredoxin reductase  39.05 
 
 		 343 aa  198  3e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0566  thioredoxin reductase  39.35 
 
 		 313 aa  197  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.302989  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13948  thioredoxin reductase trxB2  40.92 
 
 		 335 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1717  thioredoxin reductase  36.84 
 
 		 320 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0214207  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1221  thioredoxin reductase  41.06 
 
 		 324 aa  197  5.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1731  thioredoxin reductase  37.91 
 
 		 316 aa  197  5.000000000000001e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1692  thioredoxin reductase 1  37.58 
 
 		 314 aa  197  5.000000000000001e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.160177  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2289  thioredoxin reductase  39.75 
 
 		 320 aa  197  5.000000000000001e-49  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>