71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1654 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1654  hypothetical protein  100 
 
 
349 aa  720    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1208  Protein of unknown function DUF2235  48.29 
 
 
396 aa  300  3e-80  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1357  hypothetical protein  48.01 
 
 
349 aa  260  2e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.518592  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1365  Protein of unknown function DUF2235  42.94 
 
 
341 aa  253  5.000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149808  normal  0.119646 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3175  hypothetical protein  42.77 
 
 
345 aa  251  9.000000000000001e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0982  hypothetical protein  41.89 
 
 
344 aa  251  1e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2948  hypothetical protein  41.69 
 
 
345 aa  250  2e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3359  hypothetical protein  41.59 
 
 
344 aa  249  7e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0847  hypothetical protein  42.48 
 
 
345 aa  248  8e-65  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1004  hypothetical protein  41.59 
 
 
344 aa  248  9e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3273  hypothetical protein  41.89 
 
 
345 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1016  hypothetical protein  41.3 
 
 
344 aa  246  3e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3711  hypothetical protein  41.13 
 
 
345 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0894  hypothetical protein  40.88 
 
 
345 aa  218  1e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0887704  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0553  hypothetical protein  38.33 
 
 
523 aa  213  3.9999999999999995e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.576668  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1132  hypothetical protein  38.46 
 
 
347 aa  211  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0870  hypothetical protein  38.04 
 
 
514 aa  209  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0826211  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2435  hypothetical protein  38.53 
 
 
337 aa  209  8e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1595  hypothetical protein  39.23 
 
 
371 aa  207  2e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0220779 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3675  hypothetical protein  38.24 
 
 
337 aa  206  3e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.631226 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0955  hypothetical protein  39.73 
 
 
530 aa  202  8e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07939  conserved hypothetical protein  39.79 
 
 
411 aa  176  5e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3233  hypothetical protein  37.63 
 
 
407 aa  161  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.394866  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37820  hypothetical protein  33.93 
 
 
407 aa  160  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00268347  normal  0.0937384 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4814  hypothetical protein  33.65 
 
 
416 aa  155  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.856348  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2084  hypothetical protein  39.83 
 
 
357 aa  150  3e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4488  hypothetical protein  32.42 
 
 
424 aa  150  4e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.466121  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3072  hypothetical protein  35.22 
 
 
595 aa  149  8e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0996826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0071  hypothetical protein  34.29 
 
 
777 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.303295  normal  0.035165 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1704  hypothetical protein  35.77 
 
 
361 aa  144  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.271153  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7549  hypothetical protein  31.27 
 
 
420 aa  144  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.826361  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1746  hypothetical protein  31.56 
 
 
721 aa  144  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1986  hypothetical protein  32.01 
 
 
427 aa  143  5e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3090  hypothetical protein  36.46 
 
 
367 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.472406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1831  hypothetical protein  31.85 
 
 
432 aa  137  3.0000000000000003e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0079  hypothetical protein  33.62 
 
 
746 aa  136  7.000000000000001e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5666  hypothetical protein  32.82 
 
 
406 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.171189  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1992  hypothetical protein  35.74 
 
 
393 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0702  hypothetical protein  35.64 
 
 
367 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3124  hypothetical protein  31.91 
 
 
428 aa  133  5e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.850184  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3459  hypothetical protein  35.06 
 
 
364 aa  133  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5354  hypothetical protein  30.9 
 
 
831 aa  129  6e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00826917 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2320  hypothetical protein  36.19 
 
 
383 aa  122  8e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2233  hypothetical protein  31.89 
 
 
566 aa  116  5e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0531954  hitchhiker  0.00189611 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01725  conserved hypothetical protein  29.73 
 
 
456 aa  109  7.000000000000001e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4409  hypothetical protein  34.86 
 
 
503 aa  85.1  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8382  hypothetical protein  32.27 
 
 
520 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1542  hypothetical protein  29.36 
 
 
474 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.93985 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4091  hypothetical protein  31.43 
 
 
498 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1078  hypothetical protein  28.77 
 
 
514 aa  72  0.00000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05027  conserved hypothetical protein  27.27 
 
 
632 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0807  hypothetical protein  27.17 
 
 
686 aa  66.6  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0358115  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0941  hypothetical protein  27.7 
 
 
334 aa  65.9  0.0000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0930  hypothetical protein  26.71 
 
 
336 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2645  hypothetical protein  27.33 
 
 
539 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.380948 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3709  hypothetical protein  25.52 
 
 
436 aa  53.1  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2699  YD repeat protein  28.37 
 
 
1892 aa  53.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.499088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3818  hypothetical protein  26.25 
 
 
675 aa  50.4  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4353  peptidoglycan-binding LysM  23.46 
 
 
963 aa  49.7  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000300174 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1797  hypothetical protein  25.6 
 
 
969 aa  49.7  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06791  hypothetical protein  26.77 
 
 
503 aa  47.4  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0527  peptidoglycan-binding LysM  21.9 
 
 
960 aa  47  0.0005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.711409  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1529  hypothetical protein  25.81 
 
 
308 aa  47  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.118356  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5124  hypothetical protein  24.88 
 
 
342 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0937  hypothetical protein  26.61 
 
 
530 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.229754  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2033  hypothetical protein  28.08 
 
 
453 aa  45.1  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.234826  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4489  hypothetical protein  22.15 
 
 
577 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5125  hypothetical protein  22.15 
 
 
577 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5734  hypothetical protein  22.15 
 
 
577 aa  43.9  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.363284 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1227  hypothetical protein  27.62 
 
 
335 aa  43.9  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104509  normal  0.624953 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_19384  predicted protein  24.19 
 
 
393 aa  42.7  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.250044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>