58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1598 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1598  Methicillin resistance protein  100 
 
 
364 aa  761    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.075491  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0961  methicillin resistance protein  67.61 
 
 
359 aa  496  1e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.155911 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1247  femAB family protein  66.29 
 
 
352 aa  481  1e-135  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2928  Methicillin resistance protein  56.1 
 
 
410 aa  437  1e-121  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.651446 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0801  Methicillin resistance protein  38.78 
 
 
373 aa  258  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1611  Methicillin resistance protein  31.09 
 
 
370 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4843  Methicillin resistance protein  30.43 
 
 
360 aa  133  5e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000953777  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0599  FemA protein  27.38 
 
 
347 aa  132  6.999999999999999e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.33847  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2408  methicillin resistance protein  29.32 
 
 
363 aa  123  6e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2417  methicillin resistance protein  30.47 
 
 
366 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00836283  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2858  methicillin resistance protein  34.91 
 
 
342 aa  115  2.0000000000000002e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8162  Methicillin resistance protein  36.57 
 
 
343 aa  107  3e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.848631  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5796  Methicillin resistance protein  29.57 
 
 
370 aa  103  5e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4673  methicillin resistance protein  26.24 
 
 
383 aa  99.8  7e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0340  Methicillin resistance protein  32.94 
 
 
394 aa  95.5  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.944256 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1739  femAB family protein  27.64 
 
 
354 aa  88.2  2e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00186266  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1609  Methicillin resistance protein  28.5 
 
 
347 aa  86.7  6e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0792  methicillin resistance protein  31.55 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.114115  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3053  Methicillin resistance protein  25.08 
 
 
354 aa  84.3  0.000000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000266593 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0083  methicillin resistance protein  20 
 
 
354 aa  73.9  0.000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3975  methicillin resistance protein  29.47 
 
 
366 aa  67.4  0.0000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.393695 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2347  FemAB family protein  33 
 
 
445 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.439209  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2059  FemAB family protein  33 
 
 
445 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1256  Methicillin resistance protein  27.92 
 
 
347 aa  65.1  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000274445 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1185  methicillin resistance protein  23.55 
 
 
315 aa  64.3  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.192582  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2288  methicillin resistance protein  33.68 
 
 
421 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00915844  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2329  methicillin resistance protein  33.68 
 
 
421 aa  64.3  0.000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.179607  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2093  Methicillin resistance protein  26.63 
 
 
346 aa  63.9  0.000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.801885  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0190  hypothetical protein  28.82 
 
 
379 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1844  femX protein  32.98 
 
 
416 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.700473  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1415  methicillin resistance protein  27.75 
 
 
366 aa  60.5  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.89632  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3045  methicillin resistance protein  26.6 
 
 
335 aa  60.1  0.00000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0885  Methicillin resistance protein  24.62 
 
 
357 aa  60.1  0.00000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0771  methicillin resistance protein  21.78 
 
 
377 aa  59.7  0.00000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.455727  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1294  Methicillin resistance protein  27.49 
 
 
340 aa  58.5  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.402759 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0286  Methicillin resistance protein  24.62 
 
 
341 aa  57.4  0.0000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16380  uncharacterized methicillin resistance protein  23.2 
 
 
329 aa  57.4  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0947  femB protein  33.33 
 
 
417 aa  56.2  0.0000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.453149  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3349  hypothetical protein  26.7 
 
 
364 aa  56.2  0.0000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3584  hypothetical protein  25 
 
 
366 aa  55.5  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3193  hypothetical protein  27.81 
 
 
346 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0970  hypothetical protein  26.47 
 
 
346 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.534214  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1444  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  25 
 
 
339 aa  54.3  0.000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.593499  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1465  methicillin resistance protein  30.3 
 
 
419 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.109752  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1436  methicillin resistance protein  30.3 
 
 
419 aa  53.9  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.250722  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0961  hypothetical protein  23.2 
 
 
372 aa  52.8  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.605405  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0922  hypothetical protein  22.04 
 
 
307 aa  52.8  0.00001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2873  hypothetical protein  28.82 
 
 
380 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1068  hypothetical protein  27.57 
 
 
346 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04920  predicted ATP-grasp enzyme  23.04 
 
 
753 aa  51.6  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0663  hypothetical protein  26.67 
 
 
332 aa  50.8  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0220  hypothetical protein  19.42 
 
 
331 aa  48.1  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.186583  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0062  putative FemAB family protein  26.46 
 
 
323 aa  48.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.731343 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0739  methicillin resistance protein  21.47 
 
 
368 aa  44.7  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.274792  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1773  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  23.51 
 
 
345 aa  44.3  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2216  FemAB-related protein, PEP-CTERM system- associated  22.64 
 
 
342 aa  43.9  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1393  hypothetical protein  24.24 
 
 
331 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.238447  normal  0.393853 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0882  peptidoglycan interpeptide bridge formation protein  25.64 
 
 
388 aa  43.1  0.008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>