More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1559 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1559  Methyltransferase type 11  100 
 
 
233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0523794  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0223  SAM-dependent methyltransferase  36.32 
 
 
242 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1811  Methyltransferase type 11  38.36 
 
 
235 aa  125  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3437  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 
244 aa  114  8.999999999999998e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1577  methyltransferase type 11  36.7 
 
 
301 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0911179  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1001  methyltransferase type 11  35.93 
 
 
237 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1472  Methyltransferase type 11  27.66 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3542  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.33 
 
 
243 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1312  methyltransferase type 11  33.63 
 
 
303 aa  94  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.117711  hitchhiker  0.0001856 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  35.68 
 
 
225 aa  89.7  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0639  Methyltransferase type 11  35.02 
 
 
307 aa  89.4  4e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.110248 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3142  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 
248 aa  88.6  7e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1820  Methyltransferase type 11  40.54 
 
 
315 aa  86.3  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2617  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
228 aa  84  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1806  hypothetical protein  32.64 
 
 
228 aa  82.8  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.727626  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0552  Methyltransferase type 11  40.5 
 
 
247 aa  76.6  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.286054  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1985  methyltransferase type 11  35.94 
 
 
261 aa  75.9  0.0000000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2386  Methyltransferase type 11  29.52 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000258424  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  33.93 
 
 
244 aa  75.5  0.0000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3701  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.260893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2794  methyltransferase type 11  34.92 
 
 
271 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.148231  hitchhiker  0.000692591 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4050  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.19 
 
 
261 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4778  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 
242 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.683048  normal  0.945308 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  38.39 
 
 
225 aa  74.7  0.000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1612  Methyltransferase type 11  30.93 
 
 
233 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0258  hypothetical protein  31.85 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2577  Methyltransferase type 11  35.48 
 
 
237 aa  70.5  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.602615  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0252  hypothetical protein  31.85 
 
 
253 aa  70.5  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  41.74 
 
 
276 aa  70.1  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  39.45 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3409  type 11 methyltransferase  42.48 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.321771  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3615  methyltransferase type 11  33.76 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.106494  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4090  methyltransferase type 11  33.76 
 
 
239 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.999549 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  31.41 
 
 
239 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0707  methyltransferase type 11  34.23 
 
 
250 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1723  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
265 aa  67.8  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.630675 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0944  hypothetical protein  34.48 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.162173  normal  0.410696 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2470  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 
254 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.225805  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2596  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
271 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0340316  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  37.61 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  44.33 
 
 
291 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.81 
 
 
271 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3047  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
244 aa  65.5  0.0000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0374295  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_003296  RS00761  hypothetical protein  29.38 
 
 
246 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286204  normal  0.107855 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2776  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.516724  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0083  UbiE/COQ5 family methlytransferase  35.8 
 
 
305 aa  65.5  0.0000000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.77 
 
 
282 aa  65.5  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  30.65 
 
 
710 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  36.15 
 
 
284 aa  64.3  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3357  Methyltransferase type 11  40.86 
 
 
211 aa  63.9  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  38.84 
 
 
291 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13761  transferase  28.17 
 
 
776 aa  63.5  0.000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.881516  normal  0.437263 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0953  arsenite S-adenosylmethyltransferase  31.03 
 
 
265 aa  62.8  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000240908  hitchhiker  0.000000043462 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4080  arsenite S-adenosylmethyltransferase  30.11 
 
 
283 aa  62.8  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.214239  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  29.78 
 
 
278 aa  62.8  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2444  methyltransferase type 11  25.79 
 
 
280 aa  62.8  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
295 aa  62.8  0.000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  32.95 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1633  methyltransferase type 11  33.73 
 
 
409 aa  62.8  0.000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0334927  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  33.71 
 
 
257 aa  62.4  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2546  Methyltransferase type 11  38.94 
 
 
244 aa  62  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0272722 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4877  methyltransferase type 11  38.21 
 
 
327 aa  62  0.000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362422 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  31.91 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1590  methyltransferase type 11  29.12 
 
 
267 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0597949 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5778  Methyltransferase type 11  34.64 
 
 
276 aa  61.2  0.00000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.537325  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0474  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.53 
 
 
265 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.715311 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0303  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.87 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 
240 aa  60.5  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  37.39 
 
 
260 aa  60.8  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3113  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 
350 aa  60.5  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00520497  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28280  methyltransferase family protein  37.82 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.639383  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  30.5 
 
 
711 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2493  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
238 aa  60.8  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0424755  normal  0.184077 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0284  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.87 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0297  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.87 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378405  normal  0.771638 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 
305 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4260  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
261 aa  60.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0165  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.89 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.119395  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2880  methyltransferase type 11  33.14 
 
 
246 aa  59.7  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0166  DNA topoisomerase VI subunit A-like protein  31.13 
 
 
257 aa  59.7  0.00000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 
270 aa  60.1  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2918  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
248 aa  59.7  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0444641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8125  acetyltransferase-like protein  33.54 
 
 
464 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.467171 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1715  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 
411 aa  59.7  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.680204  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2929  biotin biosynthesis protein BioC  32.73 
 
 
267 aa  59.7  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0507  Methyltransferase type 11  32.49 
 
 
258 aa  59.7  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.459981  hitchhiker  0.00000192307 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2358  methyltransferase type 11  29.34 
 
 
216 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.53267  normal  0.0101141 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1096  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.78 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0356367  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3941  methyltransferase type 11  35.2 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4696  methyltransferase type 11  41.94 
 
 
256 aa  59.3  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.219462 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 
319 aa  58.9  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2899  biotin biosynthesis protein BioC  44.68 
 
 
262 aa  59.3  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.785116  normal  0.0952013 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2440  Methyltransferase type 11  38.68 
 
 
216 aa  58.9  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0165065  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1625  hypothetical protein  29.51 
 
 
239 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.207342 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  42.06 
 
 
252 aa  58.9  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20390  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1, 4-benzoquinol methylase  35.29 
 
 
245 aa  58.9  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0797828  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2842  biotin biosynthesis protein BioC  32.73 
 
 
267 aa  58.9  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1427  biotin synthesis protein BioC  32.73 
 
 
267 aa  58.9  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0282  UbiE/COQ5 family methyltransferase  29.22 
 
 
256 aa  58.5  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.986318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>