More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1553 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  100 
 
 
200 aa  402  1e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  47.45 
 
 
591 aa  179  2e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  43.3 
 
 
201 aa  171  8e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  45.36 
 
 
241 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  42.78 
 
 
256 aa  168  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  44.15 
 
 
197 aa  157  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.05722e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  43.75 
 
 
223 aa  156  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  41.92 
 
 
213 aa  152  3e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  37.57 
 
 
198 aa  139  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  36.7 
 
 
200 aa  137  8e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  43.23 
 
 
193 aa  137  1e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  37.63 
 
 
201 aa  135  4e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  40.93 
 
 
208 aa  135  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2815  phosphoglycerate mutase  34.34 
 
 
202 aa  134  1e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0398  Phosphoglycerate mutase  40.93 
 
 
209 aa  132  4e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.95004  normal  0.481126 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2288  phosphoglycerate mutase  44.44 
 
 
155 aa  132  5e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  36.79 
 
 
200 aa  128  6e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  35.79 
 
 
217 aa  127  9e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  37.89 
 
 
198 aa  121  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  36.84 
 
 
198 aa  120  2e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  34.67 
 
 
205 aa  117  9e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  38.12 
 
 
214 aa  112  3e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  32.96 
 
 
213 aa  110  2e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  2.63977e-06  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  35.52 
 
 
207 aa  109  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1379  Phosphoglycerate mutase  35.2 
 
 
197 aa  108  7e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
235 aa  102  4e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  32.31 
 
 
208 aa  101  7e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0488  fructose-2,6-bisphosphatase-like protein  32.61 
 
 
207 aa  100  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0628  phosphoglycerate mutase  32.12 
 
 
200 aa  100  1e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  2.1297e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.91 
 
 
442 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  34.62 
 
 
445 aa  99.8  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1855  phosphoglycerate mutase  37.13 
 
 
209 aa  99.4  3e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.54332  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.91 
 
 
442 aa  99  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  34.65 
 
 
225 aa  98.6  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1230  phosphoglycerate mutase  36.31 
 
 
207 aa  98.6  6e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1928  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  36.02 
 
 
201 aa  98.2  7e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0314739  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1204  phosphoglycerate mutase  37.91 
 
 
207 aa  98.2  7e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1673  Phosphoglycerate mutase  36.84 
 
 
378 aa  98.2  7e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00482153  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  30.05 
 
 
200 aa  98.2  8e-20  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  6.81703e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1847  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.49 
 
 
442 aa  97.8  9e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0233931  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05721  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.85 
 
 
442 aa  97.1  1e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2988  alpha-ribazole phosphatase  29.9 
 
 
203 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  1.61375e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.38 
 
 
442 aa  96.7  2e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0269  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
207 aa  96.7  2e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  34.39 
 
 
459 aa  95.9  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.05 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  30.05 
 
 
200 aa  96.3  3e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  31.5 
 
 
449 aa  95.9  4e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1583  phosphoglycerate mutase  32.18 
 
 
216 aa  95.1  6e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3312  Phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.176703  normal  0.738547 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2494  Phosphoglycerate mutase  35.35 
 
 
210 aa  94.4  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.439678  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2647  Phosphoglycerate mutase  31.12 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.372085 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1597  Phosphoglycerate mutase  29.59 
 
 
206 aa  94  1e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2789  Phosphoglycerate mutase  31.63 
 
 
212 aa  94.4  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00607  predicted alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.87 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  7.25652e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0690  alpha-ribazole phosphatase  28.87 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.94009e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  32.98 
 
 
442 aa  93.6  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00596  hypothetical protein  28.87 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  6.03804e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0664  alpha-ribazole phosphatase  28.87 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.32678e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1953  bifunctional RNase H/acid phosphatase  33.16 
 
 
382 aa  93.2  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0727  alpha-ribazole phosphatase  28.87 
 
 
203 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  4.87704e-09  normal  0.192993 
 
 
-
 
NC_002936  DET1422  phosphoglycerate mutase family protein  34.64 
 
 
207 aa  92.8  3e-18  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.314707  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  32.32 
 
 
214 aa  92.8  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  33 
 
 
214 aa  92.8  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  33.14 
 
 
214 aa  92.8  3e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3007  alpha-ribazole phosphatase  28.87 
 
 
203 aa  92.4  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.50204e-08  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3550  fructose-2 6-bisphosphatase-like protein  38.06 
 
 
316 aa  92.4  4e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0658  alpha-ribazole phosphatase  29.38 
 
 
203 aa  92  5e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  3.7528e-10  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2177  Phosphoglycerate mutase  31.82 
 
 
203 aa  91.7  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3595  phosphoglycerate mutase  34.74 
 
 
402 aa  91.7  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.977614  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0114  Phosphoglycerate mutase  25.77 
 
 
210 aa  92  6e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  1.10333e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  33.33 
 
 
447 aa  91.7  6e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0960  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 
214 aa  91.7  6e-18  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  4.42989e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5329  phosphoglycerate mutase  39.02 
 
 
197 aa  91.7  7e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.13512  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  28.72 
 
 
442 aa  91.7  7e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0598  phosphoglycerate mutase  38.65 
 
 
194 aa  91.7  7e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05171  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  30.11 
 
 
443 aa  91.3  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3153  alpha-ribazole phosphatase  29.32 
 
 
196 aa  91.3  8e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  1.5335e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  32.07 
 
 
448 aa  91.3  8e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1079  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 
214 aa  90.9  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  1.19918e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  38.27 
 
 
223 aa  90.9  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1657  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  31.18 
 
 
444 aa  90.5  2e-17  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0771  Phosphoglycerate mutase  31.72 
 
 
222 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0327  phosphoglycerate mutase  29.69 
 
 
389 aa  88.6  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0621  phosphoglycerate mutase family protein  31.72 
 
 
222 aa  89  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1900  phosphoglycerate mutase  31.79 
 
 
188 aa  88.6  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  39.02 
 
 
197 aa  88.2  7e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  31.16 
 
 
452 aa  88.2  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0881  Phosphoglycerate mutase  35.94 
 
 
391 aa  87.8  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1696  Phosphoglycerate mutase  36.96 
 
 
201 aa  87.4  1e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3132  Phosphoglycerate mutase  36.36 
 
 
195 aa  87.4  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0140691  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4807  Phosphoglycerate mutase  35.83 
 
 
198 aa  86.3  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  decreased coverage  0.000268692  normal  0.187033 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3818  Phosphoglycerate mutase  33.69 
 
 
227 aa  86.7  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.824484  normal  0.361533 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0902  phosphoglycerate mutase  30.37 
 
 
411 aa  86.3  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0126145  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1975  Phosphoglycerate mutase  31.22 
 
 
207 aa  86.7  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00690294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2893  phosphoglycerate mutase  39.51 
 
 
205 aa  87  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209877  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1513  phosphoribosyltransferase, putative/phosphoglycerate mutase family protein  34.76 
 
 
438 aa  86.7  2e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000537342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5889  bifunctional RNase H/acid phosphatase  31.91 
 
 
427 aa  86.7  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1067  phosphoglycerate mutase  29.44 
 
 
202 aa  86.7  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  5.9372e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4141  phosphoglycerate mutase  38.83 
 
 
196 aa  86.3  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.287698 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>