153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1497 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1497  putative signal transduction protein  100 
 
 		 414 aa  845    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3084  putative signal transduction protein  35.24 
 
 		 419 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3130  diguanylate phosphodiesterase  31.42 
 
 		 413 aa  192  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3129  diguanylate phosphodiesterase  30.42 
 
 		 415 aa  191  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2343  diguanylate phosphodiesterase  28.71 
 
 		 431 aa  170  4e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00856181  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2451  diguanylate phosphodiesterase  30.88 
 
 		 423 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.694346  normal  0.603659 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1720  diguanylate phosphodiesterase  29.28 
 
 		 412 aa  155  1e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1990  diguanylate phosphodiesterase  30.81 
 
 		 414 aa  154  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.973618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1268  diguanylate phosphodiesterase  41.21 
 
 		 407 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.15473  normal  0.0747469 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0010  diguanylate phosphodiesterase  29.34 
 
 		 487 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0508854 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3594  diguanylate phosphodiesterase  28.19 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00249356  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2840  diguanylate phosphodiesterase  31.44 
 
 		 403 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002124  predicted signal transduction protein  26.78 
 
 		 407 aa  139  7.999999999999999e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0413  diguanylate phosphodiesterase  27.64 
 
 		 397 aa  135  9e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000029399  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3947  diguanylate phosphodiesterase  26.6 
 
 		 413 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.103414  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2312  diguanylate phosphodiesterase  32.9 
 
 		 423 aa  129  7.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00298  signal transduction protein  25.98 
 
 		 407 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1937  putative signaling protein  26.55 
 
 		 400 aa  128  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1442  hypothetical protein  27.59 
 
 		 404 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000750338  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03533  EAL domain protein  24.5 
 
 		 408 aa  127  5e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0111496  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0322  putative signal transduction protein  29.8 
 
 		 403 aa  125  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1652  diguanylate phosphodiesterase  26.29 
 
 		 406 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003840  predicted signal transduction protein  26.49 
 
 		 404 aa  125  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000123266  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2383  hypothetical protein  25.74 
 
 		 408 aa  125  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1888  diguanylate phosphodiesterase  27.97 
 
 		 400 aa  119  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.61283  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03534  diguanylate phosphodiesterase  23.95 
 
 		 411 aa  116  7.999999999999999e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0852439  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0122  diguanylate phosphodiesterase  26.46 
 
 		 400 aa  116  8.999999999999998e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000715595  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1965  diguanylate phosphodiesterase  24.7 
 
 		 413 aa  114  3e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.616321  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3464  EAL domain-containing protein  25.5 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.126352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2098  diguanylate phosphodiesterase  30.94 
 
 		 405 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3736  diguanylate phosphodiesterase  28.7 
 
 		 406 aa  112  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000203381 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2930  putative signaling protein  23.41 
 
 		 406 aa  111  2.0000000000000002e-23  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1938  diguanylate phosphodiesterase  26.67 
 
 		 422 aa  111  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.509602  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0906  diguanylate phosphodiesterase  27.51 
 
 		 423 aa  110  3e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.3977  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0991  diguanylate phosphodiesterase  27.51 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0990  diguanylate phosphodiesterase  25.24 
 
 		 431 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0905  diguanylate phosphodiesterase  25.24 
 
 		 431 aa  109  9.000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5115  diguanylate phosphodiesterase  25 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.959026 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0828  diguanylate phosphodiesterase  27.97 
 
 		 413 aa  106  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.81779  normal  0.35188 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2780  diguanylate phosphodiesterase  23.06 
 
 		 411 aa  106  8e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.948032  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2174  diguanylate phosphodiesterase  24.76 
 
 		 408 aa  105  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.120475  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5114  diguanylate phosphodiesterase  26.46 
 
 		 464 aa  105  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488167 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0860  diguanylate phosphodiesterase  24.16 
 
 		 397 aa  104  3e-21  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1719  diguanylate phosphodiesterase  25.42 
 
 		 448 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.189633  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0347  diguanylate phosphodiesterase  26.32 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.145586  normal  0.218991 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0127  hypothetical protein  24.94 
 
 		 402 aa  103  6e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1476  putative signal transduction protein  28.46 
 
 		 403 aa  102  9e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000542008  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1729  diguanylate phosphodiesterase  26.63 
 
 		 419 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2615  diguanylate phosphodiesterase  24.33 
 
 		 411 aa  101  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1073  diguanylate phosphodiesterase  26.72 
 
 		 428 aa  101  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1315  diguanylate phosphodiesterase  24.82 
 
 		 449 aa  101  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3785  diguanylate phosphodiesterase  28.68 
 
 		 444 aa  100  4e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942548  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2981  diguanylate phosphodiesterase  23.72 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0150403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1852  diguanylate phosphodiesterase  23.72 
 
 		 412 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12834  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0339  signal transduction protein  24.85 
 
 		 409 aa  99.4  9e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0012225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1598  diguanylate phosphodiesterase  24.51 
 
 		 411 aa  99  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1149  EAL domain-containing protein  24.34 
 
 		 411 aa  97.8  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1316  diguanylate phosphodiesterase  25.54 
 
 		 419 aa  96.7  8e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0056  signal transduction protein  27.6 
 
 		 444 aa  96.3  9e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.680301  normal  0.542378 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2417  diguanylate phosphodiesterase  22.85 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000004717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2907  signal transduction protein  27.49 
 
 		 439 aa  94.7  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0386149  normal  0.411691 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1814  diguanylate phosphodiesterase  30.12 
 
 		 405 aa  94.7  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.877922  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1462  diguanylate phosphodiesterase  24.5 
 
 		 405 aa  94.4  4e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2882  putative signal transduction protein  23.39 
 
 		 397 aa  93.2  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.567941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3234  diguanylate phosphodiesterase  21.73 
 
 		 408 aa  92.8  9e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.114779 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3300  EAL  29.57 
 
 		 417 aa  92  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.220663 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2159  signal transduction protein  28.51 
 
 		 480 aa  89.7  7e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.140137  normal  0.149553 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1332  diguanylate phosphodiesterase  24.53 
 
 		 424 aa  89.7  8e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0920  diguanylate phosphodiesterase  25.28 
 
 		 416 aa  88.6  2e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.135015  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3062  signal transduction protein  31.29 
 
 		 403 aa  87.8  3e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0202013  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3725  putative signal transduction protein  28.1 
 
 		 378 aa  86.3  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1693  EAL domain protein  24.5 
 
 		 410 aa  85.9  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1384  putative signal transduction protein  31.28 
 
 		 463 aa  85.5  0.000000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2915  diguanylate phosphodiesterase  25.06 
 
 		 458 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.555808 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2937  diguanylate phosphodiesterase  23.88 
 
 		 411 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.64133  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1998  diguanylate phosphodiesterase  24.04 
 
 		 404 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1201  putative signal transduction protein  21.83 
 
 		 406 aa  82.4  0.00000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0842  signal transduction protein  29.18 
 
 		 389 aa  81.6  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0117523 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1612  diguanylate phosphodiesterase  22.96 
 
 		 410 aa  82  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0416985  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2723  putative signal transduction protein  31.58 
 
 		 399 aa  81.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000022717 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4155  putative signal transduction protein  30.56 
 
 		 438 aa  79.3  0.0000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.78127  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4244  diguanylate phosphodiesterase  23.49 
 
 		 428 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1779  diguanylate phosphodiesterase  25.59 
 
 		 450 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1352  hypothetical protein  23.37 
 
 		 411 aa  75.5  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2912  diguanylate phosphodiesterase  25.85 
 
 		 447 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.776236 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1568  diguanylate phosphodiesterase  24.5 
 
 		 460 aa  74.3  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1571  diguanylate phosphodiesterase  26.01 
 
 		 445 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256124  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0592  hypothetical protein  23.1 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0573  hypothetical protein  23.1 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0622  putative signal transduction protein  24.08 
 
 		 430 aa  62  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1776  diguanylate phosphodiesterase  23.32 
 
 		 448 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.265098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3839  putative signal transduction protein  23.43 
 
 		 403 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2212  putative signal transduction protein  23.26 
 
 		 394 aa  58.9  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.566783 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3112  putative signal transduction protein  24.14 
 
 		 413 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  28.46 
 
 		 425 aa  55.5  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31360  predicted signal transduction protein containing EAL and modified HD-GYP domains  22.5 
 
 		 418 aa  54.7  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.041924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  34.67 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  34.67 
 
 		 291 aa  51.6  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  40.68 
 
 		 293 aa  50.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2044  putative signal transduction protein  25.18 
 
 		 398 aa  50.4  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>