More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1494 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1494  PfkB domain protein  100 
 
 
331 aa  677    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0243607  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0819  cell division protein FtsA  55.66 
 
 
328 aa  365  1e-100  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000392808  normal  0.759534 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1084  PfkB domain protein  52.31 
 
 
327 aa  356  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1113  PfkB domain protein  52.31 
 
 
327 aa  355  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.941643 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2764  PfkB  47.81 
 
 
370 aa  306  3e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.040802  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3284  ribokinase-like domain-containing protein  47.11 
 
 
330 aa  299  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000189129  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1910  carbohydrate kinase  41.16 
 
 
339 aa  242  5e-63  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.0000000000000704659  hitchhiker  0.00127543 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1845  ribokinase-like domain-containing protein  40.65 
 
 
341 aa  238  9e-62  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000273033  unclonable  0.000000000472438 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0562  PfkB domain protein  40.12 
 
 
328 aa  237  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2200  PfkB  39.52 
 
 
339 aa  233  4.0000000000000004e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000468276  decreased coverage  0.00888496 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1228  ribokinase-like domain-containing protein  35.8 
 
 
337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3284  PfkB  35.76 
 
 
336 aa  196  4.0000000000000005e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.469583  normal  0.0441315 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1030  pfkB family carbohydrate kinase  36.94 
 
 
330 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.577037  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05621  carbohydrate kinase  33.97 
 
 
333 aa  196  5.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05631  carbohydrate kinase  34.94 
 
 
335 aa  196  6e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.577343 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05321  carbohydrate kinase  33.65 
 
 
333 aa  195  1e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0559209  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2691  ribokinase-like domain-containing protein  36.64 
 
 
330 aa  194  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.272607  normal  0.270933 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1838  carbohydrate kinase  34.94 
 
 
335 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0198  ribokinase-like domain-containing protein  37.74 
 
 
330 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0316  pfkB family carbohydrate kinase  33.75 
 
 
330 aa  191  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.930013  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0457  PfkB  34.85 
 
 
333 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0506  carbohydrate kinase-like  33.65 
 
 
334 aa  188  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4021  PfkB  35.22 
 
 
330 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.737193  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0690  carbohydrate kinase PfkB family  36.22 
 
 
338 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0036  pfkB family carbohydrate kinase  34.24 
 
 
333 aa  185  8e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.564268  normal  0.540344 
 
 
-
 
NC_004310  BR0169  carbohydrate kinase  36.36 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0162  carbohydrate kinase  36.36 
 
 
330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.98466  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07411  carbohydrate kinase  35.37 
 
 
342 aa  183  3e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0149  PfkB  35.78 
 
 
407 aa  183  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.029935  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4407  PfkB domain protein  33.44 
 
 
330 aa  179  7e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0178  ribokinase-like domain-containing protein  35.42 
 
 
331 aa  179  7e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.613115  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2989  ribokinase-like domain-containing protein  34.04 
 
 
338 aa  179  9e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4645  ribokinase-like domain-containing protein  35.4 
 
 
337 aa  178  1e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.161745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5108  PfkB domain protein  35.4 
 
 
337 aa  178  1e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.905931 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3378  ribokinase-like domain-containing protein  35.02 
 
 
330 aa  177  2e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.463525  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3532  ribokinase-like domain-containing protein  35.03 
 
 
337 aa  177  3e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.321565  normal  0.851243 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4087  PfkB domain protein  33.12 
 
 
330 aa  176  4e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05691  carbohydrate kinase  32.38 
 
 
338 aa  176  4e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0990225  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  31.71 
 
 
332 aa  175  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0251  PfkB  35.74 
 
 
333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.214496  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0121  ribokinase-like domain-containing protein  33.94 
 
 
328 aa  172  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.02163  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5046  ribokinase-like domain-containing protein  35.05 
 
 
329 aa  172  5.999999999999999e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.151131 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5186  PfkB domain protein  34.47 
 
 
337 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.430634  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0461  PfkB domain protein  34.85 
 
 
333 aa  171  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1165  PfkB domain protein  35.24 
 
 
335 aa  171  2e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.188666 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1639  ribokinase-like domain-containing protein  34.04 
 
 
331 aa  170  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.487738  normal  0.0146751 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1668  carbohydrate kinase PfkB family  35.4 
 
 
337 aa  169  5e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1260  PfkB domain protein  33.74 
 
 
331 aa  169  6e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1671  PfkB  31.65 
 
 
331 aa  169  7e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.276087  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0218  PfkB  34.77 
 
 
333 aa  167  2e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0010  PfkB  34.24 
 
 
333 aa  167  2e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  decreased coverage  0.00317456  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2452  PfkB  32.06 
 
 
330 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.826037  normal  0.155331 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0215  ribokinase-like domain-containing protein  36.04 
 
 
333 aa  166  5.9999999999999996e-40  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.26013  normal  0.0979989 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05061  carbohydrate kinase  32.19 
 
 
348 aa  165  8e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0313242  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1307  PfkB domain protein  33.65 
 
 
338 aa  165  9e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.887451  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0581  PfkB  36.16 
 
 
333 aa  163  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189374  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2565  ribokinase-like domain-containing protein  32.93 
 
 
333 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.650274  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3022  PfkB domain protein  32.1 
 
 
333 aa  160  2e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.523599  normal  0.417909 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0151  PfkB  31.85 
 
 
331 aa  152  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2022  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 
330 aa  150  2e-35  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0494  PfkB domain protein  31.46 
 
 
360 aa  150  4e-35  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.441156  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2872  ribokinase-like domain-containing protein  29.91 
 
 
335 aa  147  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.417432 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0055  ribokinase-like domain-containing protein  30.25 
 
 
334 aa  139  4.999999999999999e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.747338  normal  0.368725 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2854  ribokinase-like domain-containing protein  30.56 
 
 
328 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000011716  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2568  ribokinase-like domain-containing protein  31.25 
 
 
333 aa  123  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0234215 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0041  ribokinase-like domain-containing protein  34.08 
 
 
304 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1117  ribokinase-like domain-containing protein  31.73 
 
 
305 aa  110  3e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.145837 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0491  PfkB  35.61 
 
 
303 aa  106  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0735  PfkB domain-containing protein  30.37 
 
 
317 aa  98.6  1e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.263465  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02272  adenosine kinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06390)  27.14 
 
 
352 aa  91.3  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0154807  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0078  ribokinase-like domain-containing protein  32.71 
 
 
302 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0275  PfkB domain-containing protein  29.73 
 
 
312 aa  86.7  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0276  PfkB domain protein  24.49 
 
 
304 aa  84.3  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0070  ribokinase-like domain-containing protein  32.09 
 
 
305 aa  84.7  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.60231  normal  0.104072 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0949  PfkB  33.19 
 
 
301 aa  82.8  0.000000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0147  ribokinase-like domain-containing protein  27.86 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.719935  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0253  ribokinase  25 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0259  ribokinase  25 
 
 
304 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  29.92 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57331  adenosine kinase  27.35 
 
 
350 aa  79  0.0000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.066494 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0939  ribokinase  29.25 
 
 
302 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000942042  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  29.46 
 
 
304 aa  78.6  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1124  ribokinase  26.21 
 
 
403 aa  77  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_18364  predicted protein  26.56 
 
 
273 aa  75.5  0.000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.132458 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  25.38 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1366  ribokinase-like domain-containing protein  27.5 
 
 
320 aa  73.2  0.000000000007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  25.71 
 
 
628 aa  72.8  0.000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0162  ribokinase  26.62 
 
 
309 aa  72.8  0.000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0395  aminoimidazole riboside kinase  24.65 
 
 
311 aa  72.8  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0581877  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1285  ribokinase  24.57 
 
 
307 aa  72  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000150833  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1048  ribokinase  26.85 
 
 
301 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2118  PfkB domain protein  26.75 
 
 
307 aa  71.2  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0902  PfkB domain protein  28.95 
 
 
309 aa  71.2  0.00000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0659  ribokinase  27.3 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3771  ribokinase  27.3 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4124  ribokinase  24.92 
 
 
403 aa  70.5  0.00000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  26.24 
 
 
642 aa  70.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3407  ribokinase  27.05 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000207  inosine-guanosine kinase  27.27 
 
 
434 aa  70.5  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.471058  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1435  ribokinase-like domain-containing protein  30 
 
 
293 aa  70.1  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000559808 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>