128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1475 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1475  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 129 aa  264  2.9999999999999995e-70  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.125283  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1934  DNA polymerase beta domain protein region  60.78 
 
 		 104 aa  133  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.739683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0479  DNA polymerase, beta-like region  58.76 
 
 		 105 aa  126  8.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0033  hypothetical protein  52.13 
 
 		 110 aa  110  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  51.11 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2615  hypothetical protein  55.95 
 
 		 109 aa  105  2e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.111377 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0274  hypothetical protein  46.46 
 
 		 112 aa  104  5e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3960  DNA polymerase beta subunit  55.32 
 
 		 104 aa  103  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.886641  normal  0.332553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2416  DNA polymerase beta subunit  50.51 
 
 		 103 aa  102  2e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.606985  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3135  DNA polymerase beta domain protein region  41.12 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.434644 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2974  DNA polymerase beta domain protein region  41.12 
 
 		 108 aa  99.4  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3447  DNA polymerase beta subunit  51.09 
 
 		 98 aa  95.5  2e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.665517  normal  0.0889414 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3907  DNA polymerase beta domain protein region  43.3 
 
 		 109 aa  95.1  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1879  DNA polymerase beta domain protein region  40.95 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1853  DNA polymerase beta domain protein region  40.95 
 
 		 113 aa  94  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3484  DNA polymerase beta domain protein region  45.05 
 
 		 115 aa  93.6  7e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.628631 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2453  DNA polymerase beta domain protein region  41.24 
 
 		 109 aa  92  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.17145 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0337  DNA polymerase beta domain protein region  56.72 
 
 		 86 aa  89.7  1e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.707738 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4370  DNA polymerase beta domain protein region  42.86 
 
 		 132 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.541368 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2968  DNA polymerase beta domain protein region  38.14 
 
 		 126 aa  86.3  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.201607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4407  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 112 aa  81.6  0.000000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.622454  hitchhiker  0.00236557 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4345  DNA polymerase beta domain protein region  34.69 
 
 		 112 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  50.6 
 
 		 116 aa  80.9  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  43 
 
 		 100 aa  80.5  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2793  DNA polymerase, beta-like region  34.04 
 
 		 270 aa  72.8  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  38.38 
 
 		 99 aa  70.1  0.000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  39.18 
 
 		 102 aa  70.1  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  40.21 
 
 		 99 aa  69.7  0.00000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  36.08 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0152  DNA polymerase  32.35 
 
 		 100 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1342  DNA polymerase beta domain protein region  48.65 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3676  DNA polymerase beta domain protein region  36.08 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.839378  normal  0.137366 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1854  nucleotidyltransferase family protein  33.66 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000063807  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  33.68 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  33.68 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2568  hypothetical protein  58.97 
 
 		 68 aa  57.4  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0886  hypothetical protein  41.98 
 
 		 129 aa  57  0.00000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0454668  hitchhiker  0.00000000702025 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1784  nucleotidyltransferase  40.26 
 
 		 97 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1883  DNA polymerase, beta-like region  35.87 
 
 		 108 aa  55.5  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.230497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0279  DNA polymerase beta domain protein region  45 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.155068  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  38.55 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  41.18 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2493  DNA polymerase beta domain-containing protein region  33.33 
 
 		 96 aa  54.7  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0697  DNA polymerase beta subunit  36.56 
 
 		 96 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.424952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0374  DNA polymerase, beta-like region  37.5 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3260  transcriptional regulator, XRE family  33.04 
 
 		 152 aa  53.9  0.0000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3213  DNA polymerase beta domain protein region  34.62 
 
 		 96 aa  53.9  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3743  DNA polymerase beta domain protein region  43.59 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  42.19 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1113  DNA polymerase beta subunit  35.11 
 
 		 109 aa  52.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  34.41 
 
 		 113 aa  52.4  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  35.8 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0638  nucleotidyltransferase  45.45 
 
 		 101 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1148  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 115 aa  52  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0943  DNA polymerase beta subunit  35.35 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.744259 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0273  DNA polymerase, beta-like region  40 
 
 		 98 aa  50.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.288603 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  41.25 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 96 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  41.54 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0927  hypothetical protein  38.82 
 
 		 109 aa  49.3  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.430224  normal  0.445553 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0409  DNA polymerase beta subunit  34.62 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  32.67 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0357  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 101 aa  48.9  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0316504 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  32.67 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2036  DNA polymerase beta domain protein region  40.3 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.18823  normal  0.524072 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3031  DNA polymerase beta subunit  37.66 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.424813  normal  0.471509 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0202  DNA polymerase beta domain protein region  38.03 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.368731 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0348  DNA polymerase beta subunit  39.39 
 
 		 94 aa  48.1  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  40.62 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0296  DNA polymerase beta domain protein region  30.95 
 
 		 97 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.499305 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1803  DNA polymerase beta domain protein region  35.23 
 
 		 96 aa  48.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0703  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 109 aa  47.8  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000025763  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  39.06 
 
 		 96 aa  47.8  0.00005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  38.03 
 
 		 96 aa  47  0.00008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  38.61 
 
 		 102 aa  47  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  29.11 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2017  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 		 103 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.538218  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1637  DNA polymerase beta subunit  38.46 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3117  DNA polymerase beta subunit  32.1 
 
 		 110 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4165  DNA polymerase beta subunit  42.11 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2072  DNA polymerase beta domain protein region  32.18 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0110003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1694  DNA polymerase beta subunit  37.84 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.366424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  32.26 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1241  DNA polymerase beta domain-containing protein region  35.9 
 
 		 101 aa  46.6  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.282265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  40.91 
 
 		 93 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 98 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0829  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.141069  normal  0.412533 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  31.96 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3618  DNA polymerase beta domain protein region  30.77 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1948  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.506279 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1959  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.332639 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  37.97 
 
 		 96 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  33.33 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1733  DNA polymerase beta domain protein region  35.62 
 
 		 98 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.3433 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  35.59 
 
 		 109 aa  45.1  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0142  nucleotidyltransferase  33.33 
 
 		 86 aa  44.7  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1926  DNA polymerase, beta-like region  35.82 
 
 		 104 aa  44.7  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.327788  normal  0.570166 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  30.93 
 
 		 100 aa  44.7  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0627  DNA polymerase beta subunit  39.39 
 
 		 101 aa  44.7  0.0005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  30.77 
 
 		 102 aa  44.3  0.0005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>