More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1466 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  43.79 
 
 		 871 aa  647    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  42.26 
 
 		 870 aa  693    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0355  DNA mismatch repair protein MutS  59.53 
 
 		 910 aa  1049    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0171458 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  39.72 
 
 		 867 aa  672    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  42.97 
 
 		 881 aa  673    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 		 932 aa  682    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1437  DNA mismatch repair protein MutS  59.26 
 
 		 905 aa  1017    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.402439  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.25 
 
 		 863 aa  643    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  43.78 
 
 		 870 aa  672    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 		 863 aa  662    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  42.07 
 
 		 858 aa  650    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  43.64 
 
 		 872 aa  657    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  59.11 
 
 		 904 aa  1059    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  43.17 
 
 		 873 aa  695    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  42.42 
 
 		 872 aa  644    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  43.94 
 
 		 869 aa  671    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  42.6 
 
 		 869 aa  665    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  43.74 
 
 		 870 aa  656    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 		 868 aa  664    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1466  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 872 aa  1777    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  40.54 
 
 		 887 aa  638    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1181  DNA mismatch repair protein MutS  54.66 
 
 		 927 aa  949    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 		 872 aa  637    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1339  DNA mismatch repair protein MutS  62.9 
 
 		 896 aa  1085    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.742998  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  43.29 
 
 		 891 aa  639    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  41.86 
 
 		 910 aa  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  41.84 
 
 		 910 aa  644    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  40.7 
 
 		 896 aa  671    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  42.81 
 
 		 859 aa  676    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  41.91 
 
 		 857 aa  638    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  43.39 
 
 		 889 aa  669    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  43.44 
 
 		 868 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  39.44 
 
 		 881 aa  630  1e-179  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  42.48 
 
 		 858 aa  631  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  41.2 
 
 		 900 aa  632  1e-179  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  43.69 
 
 		 863 aa  630  1e-179  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  42.68 
 
 		 882 aa  627  1e-178  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  40.09 
 
 		 853 aa  624  1e-177  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0863  DNA mismatch repair protein MutS  37.87 
 
 		 873 aa  619  1e-176  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.462297  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  41.79 
 
 		 880 aa  621  1e-176  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  43.12 
 
 		 850 aa  618  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  41.84 
 
 		 858 aa  617  1e-175  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  37.87 
 
 		 872 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  40.48 
 
 		 860 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  37.87 
 
 		 872 aa  612  9.999999999999999e-175  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  41.28 
 
 		 837 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  41.63 
 
 		 855 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  41.63 
 
 		 855 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  42.63 
 
 		 854 aa  611  1e-173  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  44.34 
 
 		 882 aa  610  1e-173  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1626  DNA mismatch repair protein MutS  41.8 
 
 		 857 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.262432  normal  0.25405 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  40.67 
 
 		 895 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 		 873 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  43.04 
 
 		 855 aa  608  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  40.45 
 
 		 878 aa  608  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  42.47 
 
 		 865 aa  606  9.999999999999999e-173  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4152  DNA mismatch repair protein MutS  41.91 
 
 		 857 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.121513 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1179  DNA mismatch repair protein MutS  41.99 
 
 		 880 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809456 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4050  DNA mismatch repair protein MutS  42.03 
 
 		 857 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.593835  hitchhiker  0.000000000609956 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  43.65 
 
 		 882 aa  602  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  40.12 
 
 		 863 aa  605  1.0000000000000001e-171  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  43 
 
 		 898 aa  603  1.0000000000000001e-171  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  37.27 
 
 		 868 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  40.09 
 
 		 872 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3816  DNA mismatch repair protein MutS  38.91 
 
 		 892 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3803  DNA mismatch repair protein MutS  38.91 
 
 		 892 aa  599  1e-170  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4058  DNA mismatch repair protein MutS  41.95 
 
 		 855 aa  602  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.374775  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3618  DNA mismatch repair protein MutS  38.8 
 
 		 892 aa  601  1e-170  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3510  DNA mismatch repair protein MutS  38.78 
 
 		 890 aa  601  1e-170  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1376  DNA mismatch repair protein MutS  41.87 
 
 		 859 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3781  DNA mismatch repair protein MutS  38.8 
 
 		 892 aa  600  1e-170  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0472636 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  39.14 
 
 		 875 aa  601  1e-170  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3905  DNA mismatch repair protein MutS  38.8 
 
 		 892 aa  601  1e-170  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  39.54 
 
 		 903 aa  600  1e-170  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  44.26 
 
 		 823 aa  601  1e-170  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0621  DNA mismatch repair protein MutS  41.47 
 
 		 859 aa  602  1e-170  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.947929  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1431  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 892 aa  601  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.964721 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 		 878 aa  602  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  39.64 
 
 		 857 aa  602  1e-170  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3540  DNA mismatch repair protein MutS  41.04 
 
 		 890 aa  599  1e-170  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.190608  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 		 885 aa  596  1e-169  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 		 858 aa  597  1e-169  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3528  DNA mismatch repair protein MutS  41.56 
 
 		 894 aa  597  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  41.45 
 
 		 860 aa  598  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  40.54 
 
 		 892 aa  598  1e-169  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1166  DNA mismatch repair protein MutS  41.98 
 
 		 863 aa  597  1e-169  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  41.44 
 
 		 897 aa  598  1e-169  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  43.49 
 
 		 897 aa  598  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2519  DNA mismatch repair protein MutS  39.12 
 
 		 840 aa  598  1e-169  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.521925  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3868  DNA mismatch repair protein MutS  38.89 
 
 		 890 aa  598  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  41.76 
 
 		 881 aa  592  1e-168  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  41.48 
 
 		 862 aa  593  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  41.09 
 
 		 871 aa  595  1e-168  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  42.54 
 
 		 854 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  40.86 
 
 		 859 aa  591  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  43.83 
 
 		 882 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  43.87 
 
 		 882 aa  589  1e-167  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  38.86 
 
 		 872 aa  590  1e-167  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  42.86 
 
 		 887 aa  589  1e-167  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  42.62 
 
 		 907 aa  589  1e-167  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.548974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>