288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1447 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1447  protein of unknown function DUF163  100 
 
 		 154 aa  316  7.999999999999999e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000183222  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2291  hypothetical protein  40.65 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1809  hypothetical protein  40.65 
 
 		 156 aa  121  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.454132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0845  protein of unknown function DUF163  41.94 
 
 		 155 aa  121  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0190186 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0544  protein of unknown function DUF163  42.95 
 
 		 155 aa  116  9e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  38.85 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  38.85 
 
 		 159 aa  114  6e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0747  protein of unknown function DUF163  42.11 
 
 		 157 aa  113  7.999999999999999e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  37.58 
 
 		 159 aa  111  3e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  36.48 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 		 160 aa  107  6e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3770  protein of unknown function DUF163  36.13 
 
 		 157 aa  104  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0717595 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  36.31 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  37.82 
 
 		 159 aa  103  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  38.82 
 
 		 153 aa  103  7e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  37.5 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  36.84 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  37.34 
 
 		 160 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  33.54 
 
 		 159 aa  102  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  35.9 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  38.85 
 
 		 159 aa  101  4e-21  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  39.1 
 
 		 167 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  39.1 
 
 		 167 aa  100  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  39.1 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  39.1 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  39.1 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  39.1 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  39.1 
 
 		 159 aa  100  7e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  39.1 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  36.18 
 
 		 153 aa  100  9e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  38.71 
 
 		 165 aa  99.8  1e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16031  hypothetical protein  40.67 
 
 		 150 aa  99  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  38.46 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1287  hypothetical protein  41.72 
 
 		 144 aa  99  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  39.1 
 
 		 159 aa  99.4  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  37.18 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  38.46 
 
 		 159 aa  99  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  37.18 
 
 		 177 aa  99  2e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  39.1 
 
 		 159 aa  98.6  3e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  36.54 
 
 		 159 aa  96.7  9e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  32.48 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  36.31 
 
 		 159 aa  95.5  3e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 		 159 aa  95.1  3e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09451  hypothetical protein  39.6 
 
 		 145 aa  95.5  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.499948  normal  0.0862143 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 159 aa  94.7  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1183  hypothetical protein  37.75 
 
 		 144 aa  94.4  6e-19  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1296  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  94  7e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.433807  normal  0.073248 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  35.22 
 
 		 160 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3264  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  33.76 
 
 		 159 aa  92  2e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2069  rRNA large subunit methyltransferase  35.06 
 
 		 156 aa  92  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.608211  normal  0.214177 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 		 159 aa  92.4  2e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  35.71 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4277  rRNA large subunit methyltransferase  35.44 
 
 		 160 aa  92  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1412  hypothetical protein  35.76 
 
 		 145 aa  92  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.493866  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  35.03 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1551  hypothetical protein  40.4 
 
 		 158 aa  91.3  5e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.923861  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0447  rRNA large subunit methyltransferase  35.67 
 
 		 160 aa  90.5  7e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.399021  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 		 159 aa  90.5  8e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  34.62 
 
 		 159 aa  90.1  9e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  30.97 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1082  protein of unknown function DUF163  38.82 
 
 		 152 aa  90.1  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 		 159 aa  89.4  2e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0592  rRNA large subunit methyltransferase  35.71 
 
 		 155 aa  88.2  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.338399 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  29.68 
 
 		 157 aa  88.2  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3202  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  87.8  5e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.69553e-19  unclonable  6.7014e-24 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1010  rRNA large subunit methyltransferase  34.38 
 
 		 156 aa  87.8  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  33.33 
 
 		 159 aa  87.8  5e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1662  hypothetical protein  36.94 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.399666  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2216  rRNA large subunit methyltransferase  34.38 
 
 		 156 aa  87.4  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  33.97 
 
 		 159 aa  87  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1993  rRNA large subunit methyltransferase  36.77 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350093  normal  0.83098 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2195  rRNA large subunit methyltransferase  37.42 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2322  rRNA large subunit methyltransferase  34.38 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.810756  normal  0.749932 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2439  hypothetical protein  35.67 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  32.7 
 
 		 160 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1687  rRNA large subunit methyltransferase  34.38 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2337  rRNA large subunit methyltransferase  34.38 
 
 		 156 aa  86.7  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.390809  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03300  conserved hypothetical protein TIGR00246  36.67 
 
 		 148 aa  86.3  1e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2299  rRNA large subunit methyltransferase  34.38 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08411  hypothetical protein  28.39 
 
 		 157 aa  86.7  1e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0797  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1070  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.503879  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1889  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.841126  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2393  rRNA large subunit methyltransferase  36.13 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.147472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1379  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.588338  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5626  rRNA large subunit methyltransferase  34.38 
 
 		 156 aa  86.3  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1226  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1235  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0979  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0495213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0353  rRNA large subunit methyltransferase  33.75 
 
 		 156 aa  85.5  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.389517  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4207  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3883  rRNA large subunit methyltransferase  34.39 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.320389  normal  0.0327662 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  33.55 
 
 		 157 aa  84.7  4e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07091  hypothetical protein  35.1 
 
 		 145 aa  84.7  4e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0838601 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2788  rRNA large subunit methyltransferase  29.03 
 
 		 155 aa  84.7  5e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.132626 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0523  rRNA large subunit methyltransferase  33.76 
 
 		 160 aa  84  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.238061  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  34.69 
 
 		 155 aa  84  7e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000321376  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>