More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1408 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1408  inner-membrane translocator  100 
 
 		 317 aa  618  1e-176  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.616079  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1483  inner-membrane translocator  53.74 
 
 		 295 aa  285  5.999999999999999e-76  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1862  inner-membrane translocator  51.57 
 
 		 294 aa  279  4e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.513545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2188  inner-membrane translocator  48.08 
 
 		 294 aa  265  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2039  inner-membrane translocator  48.08 
 
 		 294 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000380808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0367  inner-membrane translocator  45.42 
 
 		 291 aa  242  7e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622442  unclonable  0.0000000514338 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0996  inner-membrane translocator  45.58 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2129  inner-membrane translocator  46.69 
 
 		 294 aa  238  8e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0385  inner-membrane translocator  49.64 
 
 		 293 aa  236  5.0000000000000005e-61  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1822  inner-membrane translocator  46.29 
 
 		 294 aa  230  2e-59  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4796  inner-membrane translocator  45.07 
 
 		 290 aa  228  7e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.212285  normal  0.40666 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0834  inner-membrane translocator  42.11 
 
 		 300 aa  228  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000998369  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0892  inner-membrane translocator  45.8 
 
 		 290 aa  226  5.0000000000000005e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1672  inner-membrane translocator  47.02 
 
 		 299 aa  226  6e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4070  inner-membrane translocator  46.48 
 
 		 295 aa  225  9e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1733  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  48.08 
 
 		 294 aa  224  2e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.293981  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1516  inner-membrane translocator  44.21 
 
 		 291 aa  220  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.713706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1046  inner-membrane translocator  45.77 
 
 		 289 aa  214  9.999999999999999e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.316666 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4550  inner-membrane translocator  46.13 
 
 		 290 aa  211  2e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0669  inner-membrane translocator  46.53 
 
 		 294 aa  205  9e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3104  inner-membrane translocator  41.4 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0679  inner-membrane translocator  46.85 
 
 		 290 aa  202  7e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.796058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1680  inner-membrane translocator  43.82 
 
 		 291 aa  199  7.999999999999999e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1865  inner-membrane translocator  40.28 
 
 		 294 aa  191  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0271  inner-membrane translocator  36.72 
 
 		 319 aa  182  9.000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.297409  normal  0.531451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3001  inner-membrane translocator  34.58 
 
 		 338 aa  177  1e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.893544 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3172  inner-membrane translocator  36.67 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.538875  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3208  inner-membrane translocator  36.33 
 
 		 309 aa  175  8e-43  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.805935  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6412  inner-membrane translocator  37.82 
 
 		 316 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3796  inner-membrane translocator  36.09 
 
 		 309 aa  172  5.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3056  inner-membrane translocator  37.89 
 
 		 292 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2728  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 311 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.613747  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2712  inner-membrane translocator  36 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3364  inner-membrane translocator  36 
 
 		 309 aa  169  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.320486 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5829  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  34.53 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.903514  normal  0.264846 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0589  inner-membrane translocator  35.62 
 
 		 316 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0822  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.6 
 
 		 316 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.221033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0728  inner-membrane translocator  37.05 
 
 		 303 aa  167  2e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3207  inner-membrane translocator  36.73 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2522  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1886  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2497  inner-membrane translocator  34.53 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.260851  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0940  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.71 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0796319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2415  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911595  normal  0.010798 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6112  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2544  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.995133  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0797  inner-membrane translocator  34.2 
 
 		 316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.320354 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1875  inner-membrane translocator  34.67 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1143  putative amino-acid transport permease protein  35.39 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.0034863  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0989  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  35.39 
 
 		 316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.341358  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1423  inner-membrane translocator  36.62 
 
 		 290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.36442  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0983  hydrophobic amino acid ABC transporter permease/ATP-binding protein  34.53 
 
 		 316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.156629  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0835  inner-membrane translocator  38.78 
 
 		 301 aa  164  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0785  branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 316 aa  164  3e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2105  inner-membrane translocator  34 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5354  inner-membrane translocator  34 
 
 		 309 aa  163  4.0000000000000004e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.764467 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2866  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 311 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.631221  normal  0.623408 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3821  inner-membrane translocator  43.11 
 
 		 293 aa  162  9e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2283  inner-membrane translocator  35.44 
 
 		 295 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2362  inner-membrane translocator  36.75 
 
 		 291 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.016238  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2253  inner-membrane translocator  37.41 
 
 		 301 aa  161  1e-38  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4757  inner-membrane translocator  35.06 
 
 		 317 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3624  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 308 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1479  inner-membrane translocator  36.61 
 
 		 302 aa  160  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0773  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2139  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  37.54 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.270395  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0863  high-affinity branched-chain amino acid ABC transporter, permease protein  37.54 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.21729  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1288  inner-membrane translocator  33.55 
 
 		 309 aa  160  4e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3349  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5018  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 319 aa  159  5e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1838  high-affinity branched-chain amino acid transport system permease protein  37.54 
 
 		 308 aa  159  6e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2608  inner-membrane translocator  35.81 
 
 		 302 aa  159  7e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5269  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.867489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4431  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 308 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.964764  hitchhiker  0.00013091 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4946  inner-membrane translocator  37.54 
 
 		 308 aa  158  9e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4332  inner-membrane translocator  35.97 
 
 		 308 aa  159  9e-38  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.797929  normal  0.146471 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3144  inner-membrane translocator  34.95 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00376696  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0652  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  37.21 
 
 		 319 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.276019  normal  0.481307 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3768  inner-membrane translocator  39.02 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.179629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3707  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  38.19 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.229916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0998  branched chain amino acid ABC transporter inner membrane protein  35.11 
 
 		 289 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.301783  normal  0.758902 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3837  inner-membrane translocator  35.54 
 
 		 287 aa  158  1e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.622329  normal  0.114435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1652  inner-membrane translocator  36.27 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.124335  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2607  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  decreased coverage  0.00528539  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3254  inner-membrane translocator  35.29 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0478  inner-membrane translocator  37.68 
 
 		 290 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.164888  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0914  inner-membrane translocator  37.5 
 
 		 291 aa  156  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6490  inner-membrane translocator  35.34 
 
 		 291 aa  155  6e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0479005  normal  0.485877 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3500  inner-membrane translocator  38.19 
 
 		 291 aa  155  7e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.334303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0099  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  35.18 
 
 		 308 aa  155  7e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1651  inner-membrane translocator  38.6 
 
 		 291 aa  155  9e-37  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0110  inner-membrane translocator  37.68 
 
 		 295 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4058  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  34.77 
 
 		 308 aa  154  2e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1123  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  34.3 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121709  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2751  inner-membrane translocator  36.05 
 
 		 301 aa  154  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0487  inner-membrane translocator  33.44 
 
 		 307 aa  154  2e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2440  putative amino-acid transmembrane ABC transporter protein  35.1 
 
 		 311 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3871  branched-chain amino acid transporter permease subunit LivH  33.44 
 
 		 308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.911793  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2492  inner-membrane translocator  34.77 
 
 		 304 aa  154  2.9999999999999998e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.366827  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3072  inner-membrane translocator  35.37 
 
 		 300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.117603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>