94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1323 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1136  putative ATP-dependent Lon protease  78.5 
 
 
682 aa  1147    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.541958  hitchhiker  0.000000432292 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2236  putative ATP-dependent Lon protease  68.77 
 
 
682 aa  1003    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000058517 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3231  putative ATP-dependent Lon protease  66.13 
 
 
684 aa  972    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1077  putative ATP-dependent Lon protease  58.76 
 
 
681 aa  858    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.543626 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1323  putative ATP-dependent Lon protease  100 
 
 
681 aa  1402    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2752  putative ATP-dependent Lon protease  74.38 
 
 
682 aa  1073    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5032  putative ATP-dependent Lon protease  39.56 
 
 
686 aa  501  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0301  putative ATP-dependent Lon protease  39.37 
 
 
676 aa  493  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0341  hypothetical protein  40.54 
 
 
694 aa  492  1e-137  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.168371  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2283  ATP-dependent Lon-type protease  38.31 
 
 
679 aa  484  1e-135  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1906  ATP-dependent protease La  37.87 
 
 
687 aa  478  1e-133  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.672246  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0999  ATP-dependent protease La  38.3 
 
 
679 aa  466  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.48984  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2488  ATP-dependent Lon protease  37.06 
 
 
678 aa  459  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2041  ATP-dependent protease La  37.19 
 
 
684 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1126  hypothetical protein  38.2 
 
 
678 aa  457  1e-127  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596948  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_258  ATP-dependent Lon protease  36.42 
 
 
676 aa  436  1e-121  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2105  hypothetical protein  37.5 
 
 
676 aa  434  1e-120  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1675  hypothetical protein  38.32 
 
 
689 aa  336  9e-91  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.404714  hitchhiker  0.000649266 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2202  hypothetical protein  38.91 
 
 
670 aa  333  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.501325  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3729  alkaline phosphatase domain-containing protein  39.45 
 
 
703 aa  332  1e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.141206  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0565  hypothetical protein  37.37 
 
 
686 aa  332  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.642014  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02910  conserved hypothetical protein TIGR02688  37.71 
 
 
694 aa  315  9.999999999999999e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000891633  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4849  hypothetical protein  38.52 
 
 
675 aa  298  3e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.895704  normal  0.860028 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1245  ATP-dependent Lon-type protease  34.2 
 
 
531 aa  243  7e-63  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.587882  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1800  ATP-dependent protease La  34.26 
 
 
469 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.186498  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3353  hypothetical protein  33.33 
 
 
508 aa  228  4e-58  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1519  ATP-dependent protease La  32.49 
 
 
470 aa  204  4e-51  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1063  hypothetical protein  28.84 
 
 
477 aa  197  6e-49  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0757607  hitchhiker  0.000125956 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0803  ATP-dependent protease La  30.28 
 
 
485 aa  180  7e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0793  ATP-dependent Lon-type protease-like protein  28.88 
 
 
485 aa  167  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1754  hypothetical protein  25.76 
 
 
473 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0583  ATP-dependent protease La  25.75 
 
 
186 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2695  ATP-dependent protease La  26.39 
 
 
811 aa  58.9  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7794  DNA-binding ATP-dependent protease La  28.57 
 
 
786 aa  54.7  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0810999  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3172  ATP-dependent protease La  27.5 
 
 
810 aa  54.3  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2444  Lon-A peptidase  29.51 
 
 
809 aa  52.8  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.431002  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0601  ATP-dependent protease La  30.46 
 
 
820 aa  53.1  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.273158  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1866  ATP-dependent protease La  26.88 
 
 
856 aa  52.4  0.00003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0469  ATP-dependent protease La  27.84 
 
 
823 aa  52.4  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0531  endopeptidase La  28.35 
 
 
823 aa  52.4  0.00003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1340  ATP-dependent protease La  26.67 
 
 
802 aa  51.6  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0924778 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2604  ATP-dependent protease La  26.98 
 
 
823 aa  50.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0869192  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4373  ATP-dependent protease La  28.19 
 
 
816 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.574007  normal  0.577886 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0493  ATP-dependent protease La  24.34 
 
 
797 aa  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.229233  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0867  ATP-dependent protease La  29.53 
 
 
775 aa  48.9  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1979  ATP-dependent protease La  23.73 
 
 
859 aa  49.3  0.0003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.205373 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2845  ATP-dependent protease La  25.62 
 
 
799 aa  48.5  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0128404  normal  0.0142705 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1558  Lon-A peptidase  26.58 
 
 
798 aa  48.5  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.100415  normal  0.0162452 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0548  ATP-dependent protease La  23.87 
 
 
807 aa  48.5  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0654617  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1146  ATP-dependent protease La  25.81 
 
 
801 aa  48.5  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.272683  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1687  ATP-dependent protease La  23.61 
 
 
801 aa  48.5  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016663  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0691  ATP-dependent protease La  28.99 
 
 
817 aa  48.5  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000937415  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0838  ATP-dependent protease La  27.12 
 
 
816 aa  48.5  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486343  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2032  Lon-A peptidase  27.52 
 
 
809 aa  48.1  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.914021  decreased coverage  0.00112725 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02475  ATP-dependent protease La  26.55 
 
 
823 aa  47.8  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0934  ATP-dependent protease La  25.7 
 
 
775 aa  47.4  0.0008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000076135  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2955  ATP-dependent protease La  27.52 
 
 
809 aa  47.4  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0653516 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0618  ATP-dependent protease La  26.58 
 
 
817 aa  47.4  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.26983e-33 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1892  ATP-dependent protease La  23.23 
 
 
793 aa  46.6  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0163436  hitchhiker  0.00257453 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0604  ATP-dependent protease La  26.58 
 
 
816 aa  47.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1777  ATP-dependent protease La  25 
 
 
802 aa  47.4  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.169591  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4792  ATP-dependent protease La  26.71 
 
 
812 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464734  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2585  ATP-dependent protease La  29.05 
 
 
774 aa  45.8  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000212252  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1842  ATP-dependent protease La  26.02 
 
 
811 aa  46.2  0.002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.523368  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0575  ATP-dependent protease La  28 
 
 
821 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.178151 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1429  ATP-dependent protease La  25.13 
 
 
825 aa  46.6  0.002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.067641  normal  0.0902926 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3084  ATP-dependent protease La  25.95 
 
 
898 aa  46.6  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.981667 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00122  mitochondrial ATP-dependent protease (Eurofung)  23.9 
 
 
932 aa  46.2  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0111325  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1725  ATP-dependent protease La  28.04 
 
 
814 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000125978  decreased coverage  0.00323118 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3609  ATP-dependent protease La  24.39 
 
 
805 aa  46.2  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.126707  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1211  Lon-A peptidase  26.85 
 
 
806 aa  45.8  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.451263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2806  ATP-dependent protease La  27.45 
 
 
816 aa  46.2  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000151057  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1179  ATP-dependent protease La  26.67 
 
 
815 aa  45.8  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000610541  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1130  ATP-dependent protease La  26.85 
 
 
806 aa  45.8  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1457  Lon-A peptidase  27.52 
 
 
808 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.181081  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0872  ATP-dependent protease La  22.64 
 
 
788 aa  45.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5717  ATP-dependent protease La  25.61 
 
 
804 aa  45.1  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.548129 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2141  ATP-dependent protease La  25.88 
 
 
835 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0189691  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2231  ATP-dependent protease La  25.88 
 
 
835 aa  45.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.019328  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0997  ATP-dependent protease La  22.64 
 
 
788 aa  45.4  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000039605 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2227  ATP-dependent protease La  24.88 
 
 
807 aa  45.1  0.005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1917  ATP-dependent protease La  25.61 
 
 
808 aa  45.1  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14920  Sporulation protease LonB  29.81 
 
 
558 aa  44.7  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.989264  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2647  ATP-dependent protease La  26.85 
 
 
804 aa  44.7  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.272722 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0082  Lon-A peptidase  22.93 
 
 
815 aa  44.3  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0112  ATP-dependent protease La  25.61 
 
 
820 aa  44.3  0.007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.187598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4570  ATP-dependent protease La  24.88 
 
 
807 aa  44.3  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2518  Lon-A peptidase  24.54 
 
 
799 aa  44.3  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.571942  normal  0.381839 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1411  Lon-A peptidase  29.08 
 
 
811 aa  44.3  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000104589  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0936  ATP-dependent protease La  25.26 
 
 
810 aa  43.9  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1867  ATP-dependent protease La  27.81 
 
 
804 aa  43.9  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0743782  hitchhiker  0.00647578 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1534  ATP-dependent protease La  27.81 
 
 
804 aa  43.9  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254924 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3006  ATP-dependent protease La  24.84 
 
 
797 aa  43.9  0.01  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0531  ATP-dependent protease La  27.15 
 
 
809 aa  43.9  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0680151  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>