94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1295 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1295  protein of unknown function DUF1232  100 
 
 
116 aa  236  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0853  hypothetical protein  36.84 
 
 
108 aa  51.6  0.000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000628024  hitchhiker  0.000012824 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1330  protein of unknown function DUF1232  55.88 
 
 
96 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0116  hypothetical protein  37.88 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01225  hypothetical protein  29.57 
 
 
143 aa  50.8  0.000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.115092  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1595  hypothetical protein  46.43 
 
 
150 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000450152  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1672  hypothetical protein  50 
 
 
151 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000129043  normal  0.0587565 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4815  hypothetical protein  33.82 
 
 
182 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.586532  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2517  protein of unknown function DUF1232  40.82 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.545586  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4803  hypothetical protein  38.18 
 
 
105 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.162553  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2808  hypothetical protein  50 
 
 
126 aa  48.1  0.00004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.903772 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2736  hypothetical protein  28.23 
 
 
148 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.909587  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2523  hypothetical protein  45.45 
 
 
129 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0989751  normal  0.209211 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1265  hypothetical protein  41.82 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  unclonable  0.000000000179686  normal  0.0239094 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1307  hypothetical protein  41.82 
 
 
146 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000504633  normal  0.282911 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2908  protein of unknown function DUF1232  33.33 
 
 
152 aa  47.8  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3889  hypothetical protein  45.45 
 
 
133 aa  47  0.00008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000000344158  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0858  hypothetical protein  41.67 
 
 
171 aa  47  0.00008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4004  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126182  normal  0.882124 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1715  hypothetical protein  40 
 
 
145 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  unclonable  0.000000338135  normal  0.0231665 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2278  protein of unknown function DUF1232  33.7 
 
 
151 aa  46.6  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3628  hypothetical protein  45.45 
 
 
142 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.89928  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0842  protein of unknown function DUF1232  41.86 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.101011 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0315  hypothetical protein  42.59 
 
 
131 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2992  protein of unknown function DUF1232  40 
 
 
92 aa  45.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0704  hypothetical protein  47.5 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0247  hypothetical protein  45.45 
 
 
135 aa  45.8  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0438  hypothetical protein  36.62 
 
 
152 aa  45.4  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1437  hypothetical protein  28.3 
 
 
323 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.973186  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2125  hypothetical protein  36.76 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.836422  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0836  hypothetical protein  57.58 
 
 
167 aa  44.7  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.202842 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0098  hypothetical protein  45 
 
 
124 aa  45.1  0.0004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0422  helix-turn-helix domain-containing protein  39.29 
 
 
217 aa  44.7  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000401833  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4460  protein of unknown function DUF1232  35.8 
 
 
138 aa  44.7  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.441335 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2498  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0145  hypothetical protein  55 
 
 
132 aa  44.7  0.0005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0867  protein of unknown function DUF1232  27.03 
 
 
142 aa  44.3  0.0006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0407  protein of unknown function DUF1232  42.5 
 
 
124 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0363693  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1704  hypothetical protein  28.3 
 
 
323 aa  43.9  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0800873  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06311  hypothetical protein  43.14 
 
 
121 aa  43.9  0.0007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1034  hypothetical protein  43.4 
 
 
150 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.383392  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3716  hypothetical protein  46.67 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.270803 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0407  hypothetical protein  43.18 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.38857  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3070  hypothetical protein  36.84 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2537  protein of unknown function DUF1232  43.18 
 
 
155 aa  42.7  0.001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.36697  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3765  hypothetical protein  40 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000021606  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0012  hypothetical protein  43.75 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21830  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  unclonable  1.21545e-17  normal  0.0258957 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1863  hypothetical protein  40 
 
 
143 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.0000473047  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20980  hypothetical protein  28.43 
 
 
157 aa  42.7  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3605  hypothetical protein  51.43 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134025  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4763  protein of unknown function DUF1232  39.29 
 
 
122 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0597  hypothetical protein  38.1 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.182188  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1508  protein of unknown function DUF1232  43.9 
 
 
133 aa  41.6  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.987063  normal  0.0931118 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0277  protein of unknown function DUF1232  36.84 
 
 
134 aa  41.6  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2613  hypothetical protein  53.33 
 
 
100 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2593  protein of unknown function DUF1232  58.06 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1980  protein of unknown function DUF1232  37.1 
 
 
98 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.55739  normal  0.731004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2380  protein of unknown function DUF1232  31.71 
 
 
98 aa  41.2  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.658738  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4497  protein of unknown function DUF1232  27.63 
 
 
153 aa  41.6  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.923848 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0413  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 
217 aa  41.2  0.004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1269  hypothetical protein  48.72 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4573  hypothetical protein  42.11 
 
 
99 aa  41.6  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3332  hypothetical protein  50 
 
 
115 aa  41.2  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5022  hypothetical protein  36.67 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000591225  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3901  hypothetical protein  42.62 
 
 
132 aa  41.2  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0698239  normal  0.0160769 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0318  hypothetical protein  52.5 
 
 
116 aa  40.8  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1315  hypothetical protein  32.89 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000812186  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1552  protein of unknown function DUF1232  43.48 
 
 
121 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000451461  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0289  hypothetical protein  52.5 
 
 
116 aa  41.2  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0383  hypothetical protein  59.38 
 
 
115 aa  40.8  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3867  hypothetical protein  52.5 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4080  hypothetical protein  51.02 
 
 
117 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1386  hypothetical protein  54.55 
 
 
139 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3677  hypothetical protein  52.5 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4049  hypothetical protein  52.5 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3972  protein of unknown function DUF1232  51.02 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4167  hypothetical protein  51.02 
 
 
116 aa  40.8  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5346  hypothetical protein  35 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000784394  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5403  hypothetical protein  35 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000173737  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0549  DNA-binding protein  40 
 
 
217 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000426784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5320  hypothetical protein  35 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.34657e-47 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5468  hypothetical protein  35 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000040052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5080  hypothetical protein  35 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000000473899  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4927  hypothetical protein  35 
 
 
121 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000000366167  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0494  DNA-binding protein  40 
 
 
217 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.144904  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0468  DNA-binding protein  40 
 
 
217 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1839  protein of unknown function DUF1232  44.64 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1695  protein of unknown function DUF1232  59.26 
 
 
120 aa  40.4  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1813  protein of unknown function DUF1232  44.64 
 
 
96 aa  40.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5352  hypothetical protein  36.67 
 
 
121 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00015826  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2979  hypothetical protein  54.84 
 
 
142 aa  40  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.263138  normal  0.0407724 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4912  hypothetical protein  46.15 
 
 
121 aa  40  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.76328e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1977  hypothetical protein  42.22 
 
 
131 aa  40  0.01  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.284202 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>