34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1250 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1250  peptidase C1A papain  100 
 
 
477 aa  992    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0216738  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0761  peptidase C1A papain  35.25 
 
 
934 aa  139  7.999999999999999e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0657055  normal  0.223124 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2881  peptidase C1A, papain  28.79 
 
 
255 aa  93.2  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0672095  normal  0.779094 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3000  papain cysteine protease family protein  28.63 
 
 
255 aa  91.3  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.131276  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1336  peptidase C1A papain  29.55 
 
 
272 aa  90.1  8e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.551785  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0117  peptidase C1A papain  30.71 
 
 
271 aa  89.4  1e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0133  cysteine protease  30.71 
 
 
271 aa  89.4  2e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2646  peptidase C1A papain  29.1 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1726  peptidase C1A papain  25 
 
 
789 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0734  cysteine protease  28.21 
 
 
323 aa  76.3  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6088  peptidase C1A papain  28.79 
 
 
395 aa  75.5  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0091  peptidase C1A, papain  31.34 
 
 
303 aa  74.7  0.000000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0130  peptidase C1A papain  28.94 
 
 
307 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0983  peptidase C1A papain  29.06 
 
 
305 aa  72.4  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1209  Fibronectin type III domain protein  27.59 
 
 
1242 aa  65.1  0.000000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0109  peptidase C1A papain  26.64 
 
 
308 aa  64.7  0.000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2670  peptidase C1A, papain  26.32 
 
 
307 aa  62  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00279233  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6485  peptidase C1A papain  28.29 
 
 
494 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1628  peptidase C1A papain  21.82 
 
 
820 aa  60.1  0.00000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0134  Fibronectin type III domain protein  26.17 
 
 
1628 aa  58.5  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.504623  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1306  peptidase C1A, papain  25.33 
 
 
688 aa  57.4  0.0000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0209237  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2675  hypothetical protein  26.94 
 
 
688 aa  57.4  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0842  peptidase C1A, papain  25.09 
 
 
535 aa  54.7  0.000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.503051  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0046  putative serine protease  23.94 
 
 
1066 aa  54.3  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000707412  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2994  peptidase C1A papain  22.91 
 
 
405 aa  51.6  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.766742  normal  0.41345 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2675  hypothetical protein  24.63 
 
 
353 aa  51.2  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3867  peptidase C1A papain  23.28 
 
 
640 aa  50.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2547  hypothetical protein  24.59 
 
 
353 aa  50.1  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0574  peptidase C1A papain  24.71 
 
 
487 aa  49.7  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.17095 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3866  peptidase C1A papain  25.78 
 
 
284 aa  49.3  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.401195  normal  0.15996 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4065  peptidase C1A, papain  28.21 
 
 
224 aa  48.5  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.561338 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0779  periplasmic copper-binding protein  23.31 
 
 
1332 aa  45.1  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.195346  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1773  hypothetical protein  21.74 
 
 
718 aa  44.7  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00222697 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3580  hypothetical protein  25.57 
 
 
753 aa  44.3  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.28463  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>