283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1188 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1188  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
837 aa  1719  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0791  endonuclease/exonuclease/phosphatase  42.32 
 
 
808 aa  613  1e-174  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.548418  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0383  endonuclease/exonuclease/phosphatase  52.85 
 
 
266 aa  256  2e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4845  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  49.61 
 
 
283 aa  247  6e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.346949  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4697  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.58 
 
 
328 aa  243  1e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.18 
 
 
328 aa  241  3e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215897  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4045  endonuclease/exonuclease/phosphatase  50.82 
 
 
242 aa  234  5e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5423  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  51.44 
 
 
242 aa  224  5e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313531  hitchhiker  0.0062358 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2727  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.71 
 
 
246 aa  223  1e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.216689  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1514  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  45.71 
 
 
246 aa  222  2e-56  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.126297 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5127  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.93 
 
 
242 aa  215  2e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.336729  normal  0.0539363 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0900  endonuclease/exonuclease/phosphatase  48.43 
 
 
257 aa  211  4e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1343  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  47.84 
 
 
279 aa  209  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.591358  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5005  hypothetical protein  45.78 
 
 
245 aa  208  3e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3653  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.75 
 
 
249 aa  184  5e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.477132  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3760  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  39.75 
 
 
249 aa  183  1e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2670  endonuclease/exonuclease/phosphatase  36.25 
 
 
260 aa  141  5e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.246537  normal  0.0515035 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3383  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.81 
 
 
671 aa  121  5e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.835813  normal  0.7475 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1543  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  27.04 
 
 
724 aa  119  3e-25  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.199855 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2132  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.61 
 
 
226 aa  117  1e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5411  endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.8 
 
 
250 aa  115  2e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.746518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1473  hypothetical protein  32.92 
 
 
273 aa  114  7e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.257293  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2799  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.04 
 
 
244 aa  114  1e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0201  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.2 
 
 
264 aa  111  7e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6090  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.06 
 
 
258 aa  110  8e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.18128  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21370  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.56 
 
 
281 aa  110  9e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0147  metal-dependent hydrolase  32.95 
 
 
673 aa  110  9e-23  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2772  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.69 
 
 
261 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.472556  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5588  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
269 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15644  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6314  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
269 aa  109  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0901897 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4022  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.59 
 
 
271 aa  108  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6501  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.06 
 
 
263 aa  109  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.126817  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1328  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.06 
 
 
263 aa  109  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.42531  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2865  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.29 
 
 
261 aa  108  6e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2702  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.94 
 
 
265 aa  108  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5493  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.06 
 
 
278 aa  107  1e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.306278  hitchhiker  0.00234729 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0870  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.76 
 
 
287 aa  107  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.282627  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0239  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.93 
 
 
258 aa  106  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.577245  normal  0.289646 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0496  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 
246 aa  105  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1524  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.82 
 
 
228 aa  102  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2679  endonuclease/exonuclease/phosphatase  33.33 
 
 
282 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1972  metal-dependent hydrolase  33.74 
 
 
338 aa  99.8  2e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3513  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.15 
 
 
236 aa  99.4  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00703913  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1880  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.74 
 
 
338 aa  99  3e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.850381  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3786  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.83 
 
 
269 aa  98.6  5e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2988  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.32 
 
 
282 aa  97.8  6e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.685317  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3930  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.5 
 
 
247 aa  98.2  6e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0720293 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5198  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.92 
 
 
278 aa  97.8  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.440175 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5307  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.96 
 
 
244 aa  97.4  9e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4976  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.87 
 
 
266 aa  97.1  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  hitchhiker  4.83065e-08 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0408  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  33.47 
 
 
1153 aa  96.3  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.352854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4171  type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase  25.82 
 
 
655 aa  96.3  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2363  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.67 
 
 
255 aa  95.9  3e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2877  hypothetical protein  33.96 
 
 
277 aa  95.9  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0905  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.15 
 
 
278 aa  95.9  3e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.965687  normal  0.246268 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01462  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.45 
 
 
233 aa  95.5  4e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2527  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.12 
 
 
576 aa  95.5  4e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3204  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.33 
 
 
259 aa  93.6  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0692  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.05 
 
 
245 aa  93.6  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.221154  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0846  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.66 
 
 
292 aa  93.6  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24010  metal-dependent hydrolase  32.31 
 
 
286 aa  92.4  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.078651 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0260  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.51 
 
 
639 aa  91.3  7e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.61014  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1140  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.95 
 
 
231 aa  91.3  7e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_118  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  32.93 
 
 
639 aa  90.9  9e-17  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1059  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.4 
 
 
285 aa  90.5  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0432754  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6275  Metal-dependent hydrolase-like protein  30.52 
 
 
617 aa  90.5  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0433121  decreased coverage  0.00812081 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1324  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.6 
 
 
285 aa  90.1  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0807274  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2528  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.28 
 
 
312 aa  90.1  2e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.772852  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  28.23 
 
 
299 aa  90.1  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2964  membrane protein of unknown function  24.38 
 
 
697 aa  89.4  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0506819  normal  0.334819 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0997  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  30.33 
 
 
285 aa  89  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0607  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.58 
 
 
253 aa  88.6  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0339  membrane protein of unknown function  26.6 
 
 
715 aa  89  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4059  endonuclease/exonuclease/phosphatase  32.67 
 
 
260 aa  87.8  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.67832 
 
 
-
 
NC_002936  DET0108  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  31.3 
 
 
591 aa  87.8  7e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4026  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.75 
 
 
265 aa  86.3  2e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3253  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.61 
 
 
253 aa  85.9  3e-15  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.378001  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2520  endonuclease/exonuclease/phosphatase  30.33 
 
 
232 aa  85.5  4e-15  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2849  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.36 
 
 
276 aa  82.8  3e-14  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.942011  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0008  hypothetical protein  28.97 
 
 
244 aa  82.4  3e-14  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.26697e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3731  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.4 
 
 
243 aa  82  5e-14  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0806  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.41 
 
 
255 aa  81.3  8e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.636912  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0877  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.41 
 
 
255 aa  81.3  8e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23458  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5408  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.06 
 
 
634 aa  80.5  1e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.521256  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1422  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.69 
 
 
235 aa  79.7  2e-13  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.329688 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2325  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.34 
 
 
231 aa  78.6  4e-13  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.415298 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5450  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.57 
 
 
257 aa  77.8  8e-13  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3046  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  34.46 
 
 
235 aa  77  1e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000889267  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0904  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.31 
 
 
289 aa  77.4  1e-12  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.355759  normal  0.240953 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2384  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.9 
 
 
300 aa  77  1e-12  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0080  hypothetical protein  25.87 
 
 
302 aa  77.4  1e-12  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25550  metal-dependent hydrolase  27.05 
 
 
657 aa  76.6  2e-12  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.202364 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2393  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.59 
 
 
277 aa  76.3  2e-12  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0086  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.58 
 
 
257 aa  75.5  3e-12  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2639  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.8 
 
 
288 aa  75.9  3e-12  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3633  endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.48 
 
 
252 aa  75.9  3e-12  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0240015  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1327  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.08 
 
 
245 aa  75.9  3e-12  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.51669  hitchhiker  0.00270426 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0359  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.77 
 
 
248 aa  75.5  4e-12  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1299  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.19 
 
 
252 aa  75.5  4e-12  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5732  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.64 
 
 
300 aa  75.5  4e-12  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.673881  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>