229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1185 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1185  SNARE associated Golgi protein  100 
 
 
258 aa  509  1e-143  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4112  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 
209 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00687322  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1109  SNARE associated Golgi protein  40.49 
 
 
242 aa  152  4e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4073  SNARE associated Golgi protein  37.5 
 
 
209 aa  152  5e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0308  SNARE associated Golgi protein  42.48 
 
 
229 aa  148  8e-35  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2090  hypothetical protein  39.2 
 
 
238 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1993  hypothetical protein  35.68 
 
 
242 aa  139  3e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2229  SNARE associated Golgi protein  36.32 
 
 
264 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.403746 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2752  hypothetical protein  39.79 
 
 
239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.329172  normal  0.599109 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2775  hypothetical protein  32.44 
 
 
250 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1119  hypothetical protein  36.19 
 
 
225 aa  118  7.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2208  hypothetical protein  33.33 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.569423  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4331  SNARE associated Golgi protein  31.1 
 
 
232 aa  94  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2237  hypothetical protein  30.59 
 
 
266 aa  93.2  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.497647 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4700  SNARE associated Golgi protein  30.81 
 
 
232 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0431705  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2554  hypothetical protein  34.62 
 
 
207 aa  91.3  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1562  hypothetical protein  33.17 
 
 
623 aa  90.9  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0696889  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1105  rhodanese domain-containing protein  37.34 
 
 
325 aa  89.7  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0153774  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_29081  hypothetical protein  36.55 
 
 
199 aa  87  2e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0752  hypothetical protein  31.91 
 
 
229 aa  84.7  0.000000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1892  SNARE associated Golgi protein-like protein  31.09 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.328931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1834  hypothetical protein  31.09 
 
 
236 aa  82.8  0.000000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0621  hypothetical protein  30.29 
 
 
220 aa  82.4  0.000000000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18721  hypothetical protein  31.03 
 
 
198 aa  82.4  0.000000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.564165  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_31234  predicted protein  28.85 
 
 
174 aa  81.6  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.066629  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01719  predicted inner membrane protein  30.67 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01707  hypothetical protein  30.67 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1882  SNARE associated Golgi protein  30.67 
 
 
236 aa  80.9  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131258 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1973  hypothetical protein  30.67 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1440  hypothetical protein  30.67 
 
 
236 aa  79.7  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.212634  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18091  hypothetical protein  30.27 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.95558  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2469  hypothetical protein  31.51 
 
 
236 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0939  hypothetical protein  35.25 
 
 
222 aa  78.6  0.0000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592056 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1998  hypothetical protein  32.32 
 
 
192 aa  77.8  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.831633  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2793  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.54 
 
 
218 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.404315  normal  0.0961042 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18911  hypothetical protein  30.18 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.550079  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1959  hypothetical protein  32.95 
 
 
320 aa  77  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.247119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2456  hypothetical protein  34.2 
 
 
224 aa  74.7  0.000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00843119  normal 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_41130  predicted protein  30.26 
 
 
304 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.156284  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0429  SNARE associated Golgi protein  29.63 
 
 
229 aa  75.1  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4848  SNARE associated Golgi protein  30.25 
 
 
232 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.316937  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1280  hypothetical protein  30.32 
 
 
207 aa  74.3  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.932372  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1774  hypothetical protein  29.59 
 
 
198 aa  74.7  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21521  hypothetical protein  30.32 
 
 
213 aa  73.9  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1602  hypothetical protein  33.14 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0646  hypothetical protein  31.36 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0630  hypothetical protein  32.24 
 
 
227 aa  73.2  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_10356  predicted protein  29.53 
 
 
149 aa  72.8  0.000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.581519  hitchhiker  0.00659258 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3675  hypothetical protein  32.86 
 
 
239 aa  72  0.000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1314  hypothetical protein  30.05 
 
 
226 aa  71.2  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4304  SNARE associated Golgi protein-related protein  33.87 
 
 
217 aa  71.6  0.00000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.299101  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18721  hypothetical protein  32.81 
 
 
203 aa  71.6  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96466  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3653  mercuric reductase, membrane-associated  32.07 
 
 
704 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0190427  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3750  hypothetical protein  30.6 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1984  SNARE associated Golgi protein  31.34 
 
 
228 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1435  SNARE associated Golgi protein  31.88 
 
 
202 aa  68.2  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.000156702  decreased coverage  0.000261969 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6600  SNARE associated Golgi protein-like protein  33.68 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.512855 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_7311  predicted protein  28.48 
 
 
185 aa  67.8  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.243815 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_45676  predicted protein  25.69 
 
 
308 aa  66.6  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07070  hypothetical protein  32 
 
 
235 aa  66.6  0.0000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1332  SNARE associated Golgi protein  37.98 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.128419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02677  hypothetical protein  33.11 
 
 
225 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1430  SNARE associated Golgi protein  37.98 
 
 
262 aa  65.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.159298  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0474  SNARE associated Golgi protein  31.61 
 
 
224 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000739697 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2230  SNARE associated Golgi protein  28.28 
 
 
231 aa  64.3  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.571978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2072  integral membrane protein  29.8 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.721344  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0646  SNARE associated Golgi protein-related protein  26.51 
 
 
225 aa  63.9  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0458  SNARE associated Golgi protein  31.03 
 
 
224 aa  63.9  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0176  SNARE associated Golgi protein  31.43 
 
 
716 aa  62.4  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0589  pyruvate/2-oxoglutarate dehydrogenase complex dihydrolipoamide dehydrogenase (E3) component and related enzyme  30.58 
 
 
738 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1464  hypothetical protein  31.54 
 
 
714 aa  60.5  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1519  hypothetical protein  30.18 
 
 
714 aa  60.1  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3864  SNARE associated Golgi protein  28.47 
 
 
220 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4579  SNARE associated Golgi protein  26.79 
 
 
265 aa  60.1  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.300931  normal  0.641108 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43839  predicted protein  26.63 
 
 
409 aa  59.7  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.416143  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5151  hypothetical protein  27.46 
 
 
227 aa  59.3  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.41653 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.5 
 
 
746 aa  58.9  0.00000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0784754  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3865  SNARE associated Golgi protein  27.54 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1052  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.32 
 
 
243 aa  58.2  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.167125  normal  0.137944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24030  hypothetical protein  29.81 
 
 
232 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0199252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0193  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.43 
 
 
705 aa  58.2  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.475163  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0647  SNARE associated Golgi protein-related protein  28.86 
 
 
251 aa  58.2  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3558  SNARE associated Golgi protein  31.17 
 
 
722 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.626844  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4669  SNARE associated Golgi protein  35.29 
 
 
240 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3291  hypothetical protein  32.47 
 
 
240 aa  57.4  0.0000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2110  hypothetical protein  34 
 
 
234 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  31.37 
 
 
717 aa  57.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1865  DedA family membrane protein  37.23 
 
 
217 aa  57.8  0.0000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0119773  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1237  SNARE associated Golgi protein  31.33 
 
 
236 aa  57  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5227  hypothetical protein  25.29 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1585  hypothetical protein  31.93 
 
 
217 aa  56.6  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0628648  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5315  hypothetical protein  25.29 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5607  hypothetical protein  25.29 
 
 
220 aa  57  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.352858  normal  0.394132 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0668  hypothetical protein  33.59 
 
 
182 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1595  hypothetical protein  29.33 
 
 
227 aa  56.6  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0389  SNARE associated Golgi protein  28.39 
 
 
245 aa  56.2  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.892522  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0639  hypothetical protein  33.33 
 
 
182 aa  56.2  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1181  hypothetical protein  26.95 
 
 
229 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.339336  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0510  hypothetical protein  33.62 
 
 
182 aa  55.8  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00856705  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0559  DedA family protein  25.32 
 
 
231 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.604285  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>