47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1164 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 
184 aa  370  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  59.78 
 
 
184 aa  228  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  48.37 
 
 
184 aa  189  2e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.26228e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  46.74 
 
 
182 aa  157  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  38.59 
 
 
183 aa  135  5e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.69 
 
 
202 aa  105  4e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  34.25 
 
 
201 aa  98.2  7e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.02 
 
 
202 aa  97.8  8e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.69 
 
 
185 aa  95.5  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.46 
 
 
202 aa  95.1  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  27.57 
 
 
185 aa  85.1  5e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.76 
 
 
316 aa  82  4e-15  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  29.55 
 
 
180 aa  80.5  1e-14  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.04 
 
 
179 aa  78.6  4e-14  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  31.21 
 
 
177 aa  78.2  6e-14  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.62 
 
 
177 aa  76.6  2e-13  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  7.91976e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  34.53 
 
 
188 aa  75.1  5e-13  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.91 
 
 
187 aa  71.6  5e-12  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.11 
 
 
184 aa  71.2  8e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.65 
 
 
185 aa  70.9  9e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.09 
 
 
183 aa  70.1  2e-11  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.09 
 
 
187 aa  69.3  3e-11  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.55045e-05 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 
182 aa  68.9  4e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.78 
 
 
182 aa  68.2  6e-11  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.11 
 
 
176 aa  66.6  2e-10  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.29 
 
 
178 aa  64.7  8e-10  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.62 
 
 
187 aa  62  4e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  30.94 
 
 
188 aa  61.6  5e-09  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32 
 
 
182 aa  61.2  8e-09  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  29.58 
 
 
180 aa  60.5  1e-08  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.08 
 
 
180 aa  58.9  4e-08  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0395  hypothetical protein  24.24 
 
 
163 aa  58.5  5e-08  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.4 
 
 
194 aa  50.8  1e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0022  hypothetical protein  23.84 
 
 
180 aa  48.1  7e-05  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  26.49 
 
 
193 aa  48.1  7e-05  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  22.7 
 
 
437 aa  47.4  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  6.3148e-08 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  19.89 
 
 
196 aa  46.2  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  24.11 
 
 
222 aa  45.1  0.0006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.75 
 
 
177 aa  44.7  0.0007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  5.41236e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12027  hypothetical protein  20.67 
 
 
255 aa  43.1  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.58386e-11  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.61 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  23.19 
 
 
193 aa  42.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  22.95 
 
 
189 aa  42  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  21.01 
 
 
196 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  26.12 
 
 
207 aa  41.6  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  27.54 
 
 
270 aa  42  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  3.79179e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  25.29 
 
 
198 aa  42  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>