289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1104 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1104  metal dependent phosphohydrolase  100 
 
 
371 aa  760    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.485217  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4028  metal dependent phosphohydrolase  25.96 
 
 
299 aa  92  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000178316 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4422  metal dependent phosphohydrolase  26.23 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3944  metal dependent phosphohydrolase  25.96 
 
 
299 aa  90.9  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3268  metal dependent phosphohydrolase  30.27 
 
 
297 aa  88.6  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.927802  hitchhiker  0.0000364844 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0403  metal dependent phosphohydrolase  27.47 
 
 
290 aa  87.8  2e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0294  HD domain-containing protein  27.69 
 
 
303 aa  87  4e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0824041  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3446  metal dependent phosphohydrolase  31.18 
 
 
289 aa  87  4e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0904  HD domain-containing protein  30.11 
 
 
289 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0663  metal dependent phosphohydrolase  26.46 
 
 
286 aa  83.6  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2716  putative signal transduction protein  36.72 
 
 
302 aa  82.8  0.000000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.484408  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1981  metal dependent phosphohydrolase  28.16 
 
 
280 aa  82.8  0.000000000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2816  metal dependent phosphohydrolase  26.84 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0779  metal dependent phosphohydrolase  25.99 
 
 
297 aa  80.1  0.00000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0559606  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2064  metal dependent phosphohydrolase  29.5 
 
 
397 aa  80.5  0.00000000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.482341  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1197  putative signal transduction protein  26.06 
 
 
351 aa  79.7  0.00000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.408421  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1497  metal dependent phosphohydrolase  27.91 
 
 
285 aa  77.8  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0879  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 
298 aa  77.4  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0073  metal dependent phosphohydrolase  30.98 
 
 
285 aa  77  0.0000000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3449  metal dependent phosphohydrolase  32.03 
 
 
291 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000269119 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0812  metal dependent phosphohydrolase  32.03 
 
 
291 aa  76.6  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3011  metal dependent phosphohydrolase  26.64 
 
 
378 aa  76.3  0.0000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0156  metal dependent phosphohydrolase  28.42 
 
 
412 aa  76.3  0.0000000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.494474  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0903  putative signal transduction protein  30.98 
 
 
369 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00178827  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1512  putative signal transduction protein  29.83 
 
 
293 aa  75.9  0.000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1202  signal transduction protein  29.29 
 
 
292 aa  75.5  0.000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.203689  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0476  putative signal transduction protein  28.28 
 
 
274 aa  75.9  0.000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.16695  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2652  response regulator receiver modulated metal dependent phosphohydrolase  29.08 
 
 
412 aa  75.9  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.5401  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2063  HD domain-containing protein  30.43 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.126544  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0168  metal dependent phosphohydrolase  31.72 
 
 
407 aa  75.1  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02093  HD domain protein  30.52 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.394256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0073  metal dependent phosphohydrolase  29.89 
 
 
292 aa  75.1  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1846  metal dependent phosphohydrolase  26.88 
 
 
283 aa  74.3  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0007  putative signal transduction protein  35.17 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0011  putative signal transduction protein  35.17 
 
 
346 aa  73.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0123691 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1149  putative signal transduction protein  33.85 
 
 
278 aa  73.9  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.506889  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0011  putative signal transduction protein  35.17 
 
 
346 aa  73.6  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3076  metal dependent phosphohydrolase  27 
 
 
408 aa  73.6  0.000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0011  putative signal transduction protein  35.17 
 
 
346 aa  73.2  0.000000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000619076 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2296  HD domain-containing protein  27.6 
 
 
304 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.569971  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0005  putative signal transduction protein  32.73 
 
 
348 aa  72.8  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.373694  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4190  metal dependent phosphohydrolase  25.95 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000885116  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3900  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 
283 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000332345 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0651  metal dependent phosphohydrolase  30.17 
 
 
280 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2455  metal dependent phosphohydrolase  24.11 
 
 
455 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0024  putative signal transduction protein  33.57 
 
 
351 aa  72.4  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0515  metal dependent phosphohydrolase  25.95 
 
 
282 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000329454  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3816  metal dependent phosphohydrolase  24.86 
 
 
283 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.411166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3356  putative signal transduction protein  25.84 
 
 
276 aa  72  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.000000102808  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2576  HD domain-containing protein  27.96 
 
 
287 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0464  metal dependent phosphohydrolase  26.18 
 
 
284 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3214  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 
282 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000585577  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0351  metal dependent phosphohydrolase  24.87 
 
 
353 aa  70.5  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.889768  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2081  metal dependent phosphohydrolase  31.5 
 
 
285 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.0631434 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0769  metal dependent phosphohydrolase  26.1 
 
 
279 aa  70.5  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0888114 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0944  metal dependent phosphohydrolase  29.95 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0281  metal dependent phosphohydrolase  28.49 
 
 
284 aa  70.1  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00372927  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1205  putative signal transduction protein  27.54 
 
 
292 aa  70.1  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2936  putative signal transduction protein  21.94 
 
 
281 aa  69.7  0.00000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0085333  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1403  putative signal transduction protein  25.27 
 
 
280 aa  69.7  0.00000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1225  GGDEF domain-containing protein  25.91 
 
 
517 aa  69.7  0.00000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.489016  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0013  hypothetical protein  33.79 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1483  Fis family transcriptional regulator  29.41 
 
 
324 aa  69.7  0.00000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.237466  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3231  putative signal transduction protein  27.17 
 
 
352 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1904  putative signal transduction protein  26.74 
 
 
272 aa  69.3  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1161  metal dependent phosphohydrolase  26.39 
 
 
280 aa  68.9  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.663858  normal  0.172045 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3014  HD domain-containing protein  26.92 
 
 
302 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1312  metal dependent phosphohydrolase  29.63 
 
 
284 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0368639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1356  signal transduction protein  28.66 
 
 
273 aa  68.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.867049  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2772  metal dependent phosphohydrolase  25.91 
 
 
285 aa  68.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.846457  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0667  metal dependent phosphohydrolase  24.49 
 
 
297 aa  67.8  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0639089  normal  0.446665 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0742  metal dependent phosphohydrolase  26.92 
 
 
427 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1583  putative signal transduction protein  25.2 
 
 
279 aa  67.8  0.0000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.23287  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0005  metal dependent phosphohydrolase  34.21 
 
 
350 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.387927  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0015  putative signal transduction protein  29.13 
 
 
347 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000189797 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0013  putative signal transduction protein  29.94 
 
 
351 aa  67.4  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000360962 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2635  metal dependent phosphohydrolase  27.18 
 
 
283 aa  67  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1460  metal dependent phosphohydrolase  29.03 
 
 
384 aa  67  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3214  putative signal transduction protein  27.52 
 
 
293 aa  66.6  0.0000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1978  HDIG  28.35 
 
 
280 aa  66.6  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.663445 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0643  metal dependent phosphohydrolase  25.41 
 
 
425 aa  67  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1270  metal dependent phosphohydrolase  22.92 
 
 
279 aa  67  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1772  metal dependent phosphohydrolase  24.42 
 
 
440 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0702712  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0007  putative signal transduction protein  33.1 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000736166 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2242  metal dependent phosphohydrolase  27.42 
 
 
291 aa  66.6  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2873  diguanylate cyclase  26.06 
 
 
650 aa  66.6  0.0000000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2435  putative signal transduction protein  26.82 
 
 
438 aa  66.6  0.0000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0007  putative signal transduction protein  33.1 
 
 
347 aa  66.6  0.0000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0608223 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0690  metal dependent phosphohydrolase  29.47 
 
 
544 aa  66.2  0.0000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.218536 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2988  putative signal transduction protein  27.75 
 
 
281 aa  66.2  0.0000000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2242  putative signal transduction protein  27.05 
 
 
317 aa  66.2  0.0000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5126  putative signal transduction protein  27.07 
 
 
256 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0641  putative signal transduction protein  38.1 
 
 
456 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0670  metal dependent phosphohydrolase  29.53 
 
 
287 aa  65.9  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0674014  normal  0.44823 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0462  putative signal transduction protein  26.09 
 
 
313 aa  65.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.540815 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0035  metal dependent phosphohydrolase  24.08 
 
 
298 aa  65.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2112  metal dependent phosphohydrolase  27.57 
 
 
282 aa  65.9  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4389  putative signal transduction protein  26.04 
 
 
270 aa  65.9  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.274124  normal  0.875464 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1367  putative signal transduction protein  29.71 
 
 
288 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.276404  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1873  putative signal transduction protein  25.58 
 
 
415 aa  65.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.747115  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>