100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1078 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1078  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 
185 aa  372  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000165378  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2672  hypothetical protein  58.24 
 
 
183 aa  206  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1433  twin-arginine translocation pathway signal  61.07 
 
 
186 aa  191  5e-48  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000262405  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0591  twin-arginine translocation pathway signal  60.45 
 
 
185 aa  189  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.694846 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2057  twin-arginine translocation pathway signal  52.12 
 
 
187 aa  185  3e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2091  twin-arginine translocation pathway signal  54.66 
 
 
186 aa  171  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0577412  hitchhiker  0.0000798401 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2684  twin-arginine translocation pathway signal  42.93 
 
 
197 aa  143  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.407299  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5337  putative lipoprotein  40.49 
 
 
195 aa  134  9e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.665264  normal  0.0273099 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2079  putative lipoprotein  45.34 
 
 
205 aa  128  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.983785 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1471  hypothetical protein  40.11 
 
 
188 aa  127  8.000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1878  putative lipoprotein  41.88 
 
 
200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4930  hypothetical protein  40.88 
 
 
194 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.171389 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1051  putative lipoprotein  36.84 
 
 
195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.670756  normal  0.850413 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1757  putative lipoprotein  44.1 
 
 
205 aa  124  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0708212  normal  0.314425 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1705  hypothetical protein  43.05 
 
 
195 aa  122  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.255734  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2167  hypothetical protein  35.63 
 
 
191 aa  123  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3716  hypothetical protein  38.46 
 
 
194 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.663624  normal  0.38808 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4453  putative lipoprotein  42.38 
 
 
196 aa  122  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00120805  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2501  putative lipoprotein  36.7 
 
 
194 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.309797  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2640  putative lipoprotein  36.7 
 
 
194 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.00196399  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1634  putative lipoprotein  39.29 
 
 
188 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1437  putative lipoprotein  36.7 
 
 
194 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0290  putative lipoprotein  39.29 
 
 
188 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.79417  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3808  hypothetical protein  38.46 
 
 
194 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.471527 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4555  hypothetical protein  38.46 
 
 
194 aa  122  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.162066  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3083  hypothetical protein  37.2 
 
 
231 aa  122  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0255  putative lipoprotein  36.7 
 
 
194 aa  122  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0772  putative lipoprotein  46.36 
 
 
196 aa  122  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.661854  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0936  putative lipoprotein  36.7 
 
 
194 aa  122  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2288  hypothetical protein  37.87 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805561  normal  0.288664 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2253  putative lipoprotein  35.79 
 
 
195 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.176921  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5185  hypothetical protein  35.45 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2163  putative lipoprotein  34.92 
 
 
195 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3821  hypothetical protein  40.12 
 
 
196 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.370045  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1180  putative lipoprotein  35.45 
 
 
195 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.374226  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2310  putative lipoprotein  35.45 
 
 
195 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.539087  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1907  putative lipoprotein  35.45 
 
 
195 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.96714  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1416  putative lipoprotein  35.45 
 
 
195 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.388983  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3397  putative lipoprotein  35.45 
 
 
195 aa  119  3e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.692423  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2270  putative lipoprotein  35.45 
 
 
195 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.581117  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2432  putative lipoprotein  35.45 
 
 
195 aa  119  3e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.294895  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1885  hypothetical protein  35.98 
 
 
195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1908  hypothetical protein  35.98 
 
 
195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000419973 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6194  hypothetical protein  35.98 
 
 
195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3102  putative lipoprotein  41.1 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0926165  normal  0.0477167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1794  hypothetical protein  35.45 
 
 
195 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3709  hypothetical protein  36.97 
 
 
194 aa  117  6e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.145903 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5534  hypothetical protein  36.97 
 
 
194 aa  117  7e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0530  putative lipoprotein  39.02 
 
 
194 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1949  putative lipoprotein  39.07 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.234759 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1822  hypothetical protein  34.92 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.134902  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4203  putative lipoprotein  35.26 
 
 
195 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1389  hypothetical protein  38.69 
 
 
195 aa  115  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.730417  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1692  hypothetical protein  40.4 
 
 
195 aa  114  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6449  putative lipoprotein  39.47 
 
 
195 aa  114  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.202926 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2882  putative lipoprotein  38.65 
 
 
192 aa  111  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1564  hypothetical protein  38.99 
 
 
189 aa  108  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00127888  normal  0.0974108 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1352  twin-arginine translocation pathway signal sequence domain-containing protein  37.25 
 
 
190 aa  107  1e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2123  putative lipoprotein  32.18 
 
 
194 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0746601 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0481  putative lipoprotein  37.37 
 
 
194 aa  106  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2325  twin-arginine translocation pathway signal  33.52 
 
 
191 aa  105  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00153358  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0421  hypothetical protein  33.68 
 
 
194 aa  104  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.104048 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3808  hypothetical protein  35.06 
 
 
190 aa  93.6  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.582275 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1497  hypothetical protein  34.39 
 
 
185 aa  92.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.92763  normal  0.142068 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2847  hypothetical protein  34.39 
 
 
189 aa  92  4e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1446  hypothetical protein  34.39 
 
 
185 aa  92  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.173409  normal  0.115639 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3754  putative lipoprotein  35.4 
 
 
194 aa  87.8  8e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0557  putative lipoprotein  33.33 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.289592 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0540  protein of unknown function DUF500  25.53 
 
 
233 aa  59.7  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1450  protein of unknown function DUF500  31.52 
 
 
230 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.552801  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3834  protein of unknown function DUF500  30.39 
 
 
229 aa  59.3  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3437  hypothetical protein  30.17 
 
 
182 aa  58.9  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2448  hypothetical protein  29.05 
 
 
178 aa  58.5  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2081  hypothetical protein  26.9 
 
 
178 aa  55.8  0.0000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1839  putative lipoprotein  27.42 
 
 
193 aa  55.1  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3380  hypothetical protein  29.17 
 
 
327 aa  54.7  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2313  hypothetical protein  27.84 
 
 
210 aa  54.3  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00418629  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1874  hypothetical protein  25.27 
 
 
188 aa  52.8  0.000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0249  hypothetical protein  31.45 
 
 
177 aa  50.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00691872  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1196  hypothetical protein  26.6 
 
 
209 aa  49.7  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0432  hypothetical protein  27.61 
 
 
242 aa  49.3  0.00003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3108  hypothetical protein  27.05 
 
 
230 aa  48.9  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3454  hypothetical protein  22.22 
 
 
231 aa  48.1  0.00008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0652967 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0503  hypothetical protein  27.4 
 
 
194 aa  46.6  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1331  hypothetical protein  32.5 
 
 
188 aa  47  0.0002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0010  hypothetical protein  41.94 
 
 
186 aa  45.1  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.019528  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5219  hypothetical protein  28.1 
 
 
188 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.307666 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0328  protein of unknown function DUF500  25.42 
 
 
225 aa  44.3  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857832 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1665  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  44.3  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1737  hypothetical protein  27.27 
 
 
301 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1086  hypothetical protein  29.75 
 
 
249 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1635  hypothetical protein  30.53 
 
 
257 aa  43.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00848244  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3990  protein of unknown function DUF500  29.77 
 
 
299 aa  42.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.571133 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0232  hypothetical protein  25.41 
 
 
217 aa  42.7  0.003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.111994  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0234  hypothetical protein  25.41 
 
 
217 aa  42.7  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0279  hypothetical protein  28.89 
 
 
190 aa  42.4  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00138726  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3182  protein of unknown function DUF500  30.77 
 
 
231 aa  42.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00271235  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1078  protein of unknown function DUF500  24.02 
 
 
231 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64686e-30 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0538  protein of unknown function DUF500  24.59 
 
 
230 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03841  hypothetical protein  28.03 
 
 
297 aa  41.2  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>