256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1068 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  100 
 
 
222 aa  459  9.999999999999999e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  40.11 
 
 
200 aa  148  8e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  37.24 
 
 
192 aa  102  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1187  tellurite resistance related protein  28.19 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.954275  normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0182  tellurite resistance related protein  28.19 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0041705 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0338  tellurite resistance protein-related protein  31.02 
 
 
192 aa  94.4  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  29.84 
 
 
196 aa  90.5  2e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1032  methyltransferase type 11  34.44 
 
 
208 aa  82.4  0.000000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.507472  normal  0.696143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2548  thiopurine S-methyltransferase  34.87 
 
 
213 aa  82.4  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.997429  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  36.55 
 
 
208 aa  82  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2524  methyltransferase type 12  31.94 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.347392  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  33.54 
 
 
208 aa  79.3  0.00000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  32.24 
 
 
1287 aa  79.7  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35300  hypothetical protein  31.75 
 
 
218 aa  78.6  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  32.05 
 
 
199 aa  77.4  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1916  hypothetical protein  33.33 
 
 
211 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.193289  normal  0.326976 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1053  hypothetical protein  27.27 
 
 
192 aa  76.3  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.19261  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  30.92 
 
 
203 aa  75.5  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0572  methyltransferase type 11  33.73 
 
 
210 aa  75.1  0.0000000000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  28.48 
 
 
199 aa  74.7  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00128  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
202 aa  72.4  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000851543  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0233  hypothetical protein  33.85 
 
 
209 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.385291  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  31.01 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2747  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
195 aa  71.6  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.718719 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4053  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  28.04 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  29.94 
 
 
201 aa  69.7  0.00000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2491  Methyltransferase type 11  30.5 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.13744 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  29.89 
 
 
208 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 
222 aa  68.2  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2514  methyltransferase type 11  31.54 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0379622  normal  0.538818 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03040  methyltransferase family protein  29.77 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  26.29 
 
 
364 aa  65.1  0.0000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  29.87 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  26.86 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  28.21 
 
 
200 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1089  hypothetical protein  30.26 
 
 
193 aa  62  0.000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  28.89 
 
 
200 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_004310  BR1131  hypothetical protein  31.17 
 
 
193 aa  61.6  0.000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  26.19 
 
 
196 aa  60.5  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  29.13 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  26.29 
 
 
196 aa  59.3  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  27.1 
 
 
208 aa  58.2  0.0000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  26.49 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2262  hypothetical protein  28.86 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.363838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1093  methyltransferase  28.86 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280373  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  25.41 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0559  hypothetical protein  28.86 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0942  hypothetical protein  28.86 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2139  hypothetical protein  28.86 
 
 
201 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  28.86 
 
 
201 aa  55.1  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05119  tRNA methyltransferase (Eurofung)  30.89 
 
 
228 aa  55.1  0.0000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 
252 aa  55.1  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  27.03 
 
 
200 aa  54.3  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2538  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0718588  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2562  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290266  normal  0.0304213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  33.02 
 
 
269 aa  53.5  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1127  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 
246 aa  53.1  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  29.91 
 
 
222 aa  53.1  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1722  methyltransferase type 12  25.65 
 
 
575 aa  53.1  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0792321 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0498  Methyltransferase type 11  38.82 
 
 
229 aa  52.8  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216878  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  30.43 
 
 
214 aa  52.8  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2169  hypothetical protein  30.57 
 
 
187 aa  52.4  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.154386  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  29.82 
 
 
199 aa  52  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2627  methyltransferase type 11  28.72 
 
 
306 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3257  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 
551 aa  51.2  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.708921  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.45 
 
 
224 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1055  glycosyl transferase family 2  37.25 
 
 
1162 aa  50.4  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.289988  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01393  hypothetical protein  28.7 
 
 
535 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4856  methyltransferase type 11  28.89 
 
 
263 aa  50.4  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.900443  normal  0.280342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  26.92 
 
 
242 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5472  hypothetical protein  25.68 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.221639  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0720  methyltransferase type 11  30.47 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 
319 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  24.73 
 
 
220 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  28.83 
 
 
442 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  25.32 
 
 
197 aa  48.9  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  29.23 
 
 
219 aa  48.5  0.00007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2586  methyltransferase type 11  25 
 
 
204 aa  48.9  0.00007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.322136  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  29.25 
 
 
259 aa  48.5  0.00008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3910  hypothetical protein  27.55 
 
 
305 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.230808  normal  0.860748 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2510  hypothetical protein  33.04 
 
 
308 aa  48.5  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  26.62 
 
 
352 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  29.29 
 
 
190 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2455  tellurite resistance protein TehB  30.39 
 
 
298 aa  47.8  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32 
 
 
345 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 
254 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  30.91 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1132  hypothetical protein  29.2 
 
 
229 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1112  O-antigen biosynthesis protein; glycosyltransferase; methyltransferase  29.2 
 
 
229 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1225  hypothetical protein  29.2 
 
 
229 aa  47  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  29.46 
 
 
219 aa  47  0.0002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  21.85 
 
 
250 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1293  hypothetical protein  29.2 
 
 
229 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00493379 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  27.41 
 
 
400 aa  47.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2736  Methyltransferase type 11  25.5 
 
 
225 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3771  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
226 aa  47.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>