More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1054 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1054  efflux transporter, RND family, MFP subunit  100 
 
 		 400 aa  781    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.153115  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2204  RND family efflux transporter MFP subunit  55.84 
 
 		 411 aa  375  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0311908 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1210  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.53 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00968103 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  38.95 
 
 		 390 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5375  HlyD family secretion protein  42.2 
 
 		 399 aa  265  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.288749  normal  0.0889869 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1281  efflux transporter, RND family, MFP subunit  39.58 
 
 		 387 aa  260  3e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000959286  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4367  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.58 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.122634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4499  efflux transporter, RND family, MFP subunit  41.58 
 
 		 391 aa  253  5.000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.345717  normal  0.0635316 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1702  secretion protein HlyD  41.44 
 
 		 398 aa  251  1e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.16483  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1507  RND family efflux transporter MFP subunit  37.9 
 
 		 393 aa  250  4e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.679392  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1477  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.67 
 
 		 396 aa  249  6e-65  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.153552  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1419  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.63 
 
 		 387 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.267588  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1581  secretion protein HlyD  44.91 
 
 		 396 aa  242  7e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0301644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3438  putative secretion protein HlyD precursor  37.87 
 
 		 399 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0583205  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1916  RND family efflux transporter MFP subunit  40.97 
 
 		 401 aa  237  2e-61  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6250  RND family efflux transporter MFP subunit  40.92 
 
 		 388 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2283  RND family efflux transporter MFP subunit  39.47 
 
 		 398 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.181226  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2062  efflux transporter, RND family, MFP subunit  37.56 
 
 		 419 aa  229  6e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0208015  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4266  RND family efflux transporter MFP subunit  40.78 
 
 		 407 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0064  RND family efflux transporter MFP subunit  42.23 
 
 		 522 aa  226  4e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1011  RND family efflux transporter MFP subunit  39.23 
 
 		 402 aa  226  7e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0326  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.67 
 
 		 438 aa  226  8e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.856716 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0078  putative secretion protein HlyD  36.84 
 
 		 409 aa  223  3e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.36335 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1940  secretion protein HlyD  37.1 
 
 		 395 aa  222  9e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.345824  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2069  HlyD family secretion protein  42.09 
 
 		 404 aa  220  3e-56  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.473909 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1123  secretion protein HlyD  38.86 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.18847  normal  0.38508 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2304  RND family efflux transporter MFP subunit  38.46 
 
 		 396 aa  217  2.9999999999999998e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2959  RND family efflux transporter MFP subunit  42.93 
 
 		 393 aa  216  5e-55  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0300  RND family efflux transporter MFP subunit  40.3 
 
 		 407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3585  RND family efflux transporter MFP subunit  36.41 
 
 		 389 aa  192  7e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0218  hypothetical protein  31.97 
 
 		 392 aa  192  1e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1573  RND family efflux transporter MFP subunit  39.46 
 
 		 399 aa  192  1e-47  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5171  secretion protein HlyD  37.23 
 
 		 395 aa  189  7e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.345793  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4211  RND family efflux transporter MFP subunit  38.92 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.342556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2843  efflux transporter, RND family, MFP subunit  40.5 
 
 		 393 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2658  secretion protein HlyD  43.81 
 
 		 393 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.253454  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2749  efflux transporter, RND family, MFP subunit  44.62 
 
 		 393 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.130988  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2455  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.06 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.035635  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1713  multidrug resistance efflux pump-like protein  27.17 
 
 		 392 aa  105  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.254154  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2082  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.84 
 
 		 416 aa  95.9  1e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2928  RND family efflux transporter MFP subunit  26.61 
 
 		 431 aa  95.1  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00603978  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2586  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.35 
 
 		 388 aa  91.3  3e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000121955  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1147  RND family efflux transporter MFP subunit  36.13 
 
 		 395 aa  90.5  5e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1571  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.06 
 
 		 435 aa  86.3  9e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.334008  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4678  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.52 
 
 		 442 aa  82  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00314415  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2696  macrolide transporter subunit MacA  25.38 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.761507  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1597  macrolide transporter subunit MacA  25.38 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2611  macrolide transporter subunit MacA  25.38 
 
 		 370 aa  80.9  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2456  hypothetical protein  26.04 
 
 		 431 aa  80.9  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2872  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.05 
 
 		 387 aa  80.5  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1045  RND family efflux transporter MFP subunit  28.15 
 
 		 397 aa  80.1  0.00000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03125  ABC transporter permease  26.23 
 
 		 392 aa  79  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3445  RND family efflux transporter MFP subunit  27.78 
 
 		 401 aa  78.6  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.655677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3711  RND family efflux transporter MFP subunit  26.03 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3531  secretion protein HlyD  24.8 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.445744  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1916  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.53 
 
 		 384 aa  77.8  0.0000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00883  macrolide transporter subunit, membrane fusion protein (MFP) component  24.04 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2451  macrolide transporter subunit MacA  24.04 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00913289  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0982  macrolide transporter subunit MacA  24.04 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.44834  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0951  macrolide transporter subunit MacA  24.04 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0557503  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2949  RND family efflux transporter MFP subunit  22.34 
 
 		 376 aa  75.9  0.000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2718  macrolide transporter subunit MacA  24.04 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2938  RND family efflux transporter MFP subunit  26.85 
 
 		 444 aa  75.9  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00889  hypothetical protein  24.04 
 
 		 371 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2764  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.04 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.161658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1550  efflux transporter, RND family, MFP subunit  23.59 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0505882  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1039  macrolide transporter subunit MacA  24.04 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.184306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2282  macrolide transporter subunit MacA  24.04 
 
 		 371 aa  74.3  0.000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000339116  normal  0.0134871 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2837  RND family efflux transporter MFP subunit  26.19 
 
 		 406 aa  73.6  0.000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0025637 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2238  RND family efflux transporter MFP subunit  23.47 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.811605  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2452  RND family efflux transporter MFP subunit  27.25 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.591296 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4521  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.38 
 
 		 379 aa  72  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2214  secretion protein HlyD  23.16 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000155205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0225  RND family efflux transporter MFP subunit  26.58 
 
 		 461 aa  72  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.540049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1395  macrolide transporter subunit MacA  25.71 
 
 		 371 aa  71.6  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.458807  normal  0.0347786 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0567  RND family efflux transporter MFP subunit  27.14 
 
 		 424 aa  70.9  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1526  RND family efflux transporter MFP subunit  26.67 
 
 		 423 aa  70.5  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.692168  normal  0.0164989 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1940  efflux transporter, RND family, MFP subunit  21.36 
 
 		 377 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.69897  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0539  RND family efflux transporter MFP subunit  26.51 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03344  acriflavin resistance protein  26.97 
 
 		 417 aa  70.1  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3235  secretion protein HlyD  26.41 
 
 		 391 aa  70.1  0.00000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.185962  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2100  RND family efflux transporter MFP subunit  23.51 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0493506  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1908  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.81 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3500  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.39 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.226045 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02540  efflux transporter, RND family, MFP subunit  26.83 
 
 		 481 aa  68.6  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0229793  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2236  secretion protein HlyD  25.52 
 
 		 404 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0463  efflux transporter, RND family, MFP subunit  22.55 
 
 		 414 aa  68.2  0.0000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1830  secretion protein HlyD  23.84 
 
 		 449 aa  68.2  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.223746  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1695  secretion protein HlyD  26.15 
 
 		 360 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1385  efflux transporter, RND family, MFP subunit  27.25 
 
 		 380 aa  67.8  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0605754  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2466  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.19 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1298  efflux transporter, RND family, MFP subunit  25.34 
 
 		 410 aa  67.4  0.0000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.61066  normal  0.83964 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2954  RND family efflux transporter MFP subunit  23.77 
 
 		 364 aa  67  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000249187  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2617  secretion protein HlyD  24.62 
 
 		 385 aa  67  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000106145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1361  RND efflux membrane protein  27.41 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4005  efflux transporter, RND family, MFP subunit  28.1 
 
 		 387 aa  66.2  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3559  RND family efflux transporter MFP subunit  23.79 
 
 		 396 aa  65.9  0.000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4314  efflux transporter, RND family, MFP subunit  24.88 
 
 		 438 aa  65.5  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.544766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0454  secretion protein HlyD  22.28 
 
 		 373 aa  65.5  0.000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.63564  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2097  RND family efflux transporter MFP subunit  25.51 
 
 		 391 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.902105  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>