239 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0994 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0994  30S ribosomal protein S20  100 
 
 		 86 aa  162  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.945897  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  58.14 
 
 		 87 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  56.25 
 
 		 87 aa  94.7  3e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  55.81 
 
 		 87 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  54.65 
 
 		 87 aa  90.9  5e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  56.98 
 
 		 89 aa  88.2  3e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0016  30S ribosomal protein S20  51.16 
 
 		 87 aa  76.6  0.0000000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2087  30S ribosomal protein S20  52.5 
 
 		 86 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0701536  normal  0.341221 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1718  30S ribosomal protein S20  50 
 
 		 88 aa  71.2  0.000000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1783  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1598  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0075  ribosomal protein S20  52.5 
 
 		 91 aa  67  0.00000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1965  30S ribosomal protein S20  46.51 
 
 		 87 aa  67  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2044  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 86 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0741  30S ribosomal protein S20  46.67 
 
 		 89 aa  63.9  0.0000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1806  30S ribosomal protein S20  44.19 
 
 		 89 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0293621  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  50.63 
 
 		 91 aa  63.5  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  49.37 
 
 		 92 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1416  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.719270000000001e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3424  SSU ribosomal protein S20P  41.77 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 89 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0196  ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  45.35 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2108  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000204078  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  42.5 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1774  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058734  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2556  30S ribosomal protein S20  45.12 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1619  30S ribosomal protein S20  46.25 
 
 		 88 aa  57  0.00000009  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0771  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0756  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 87 aa  56.6  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000125202  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2436  ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 88 aa  56.2  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000012228  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2678  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.855392  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2717  30S ribosomal protein S20  48.1 
 
 		 90 aa  54.7  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.469442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3371  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 88 aa  53.9  0.0000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  44.05 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2765  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 88 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0071  30S ribosomal protein S20  43.21 
 
 		 95 aa  52.4  0.000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2904  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 88 aa  52  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.871002 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1517  SSU ribosomal protein S20P  39.19 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.256049  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3185  ribosomal protein S20  37.21 
 
 		 86 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3049  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 85 aa  51.2  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287118  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0377  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1075  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  41.67 
 
 		 94 aa  51.6  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0735  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1471  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 88 aa  51.6  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0677  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2512  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0919  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.459642  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0923  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0126  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4455  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115322  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4403  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4221  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000214767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4059  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.2501  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4069  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00157919  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2689  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2561  30S ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4441  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000591712  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4547  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3259  ribosomal protein S20  40.23 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.602906  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  38.75 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4344  30S ribosomal protein S20  41.25 
 
 		 85 aa  51.2  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000153456 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0546  30S ribosomal protein S20  40.48 
 
 		 87 aa  50.8  0.000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  50.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0041  30S ribosomal protein S20  42.68 
 
 		 95 aa  50.4  0.000007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.418613  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1150  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 89 aa  50.4  0.000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  hitchhiker  0.00399464  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0646  ribosomal protein S20  43.24 
 
 		 86 aa  50.4  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0947  ribosomal protein S20  40.74 
 
 		 97 aa  50.4  0.000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.351712 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 87 aa  50.4  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1039  ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 115 aa  50.4  0.000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000000562255  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  36.25 
 
 		 87 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3802  SSU ribosomal protein S20P  40 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.042204  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0795  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.111102  hitchhiker  0.0000000000117943 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4173  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 85 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0124088  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1756  30S ribosomal protein S20  40.24 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.443874  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  41.1 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1487  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.422821  normal  0.27879 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5883  30S ribosomal protein S20  39.02 
 
 		 90 aa  48.9  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.666229 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3551  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  40.7 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1667  30S ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00940932  normal  0.076211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  41.1 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 105 aa  48.9  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  39.53 
 
 		 88 aa  48.9  0.00002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  43.82 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  37.97 
 
 		 89 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  43.68 
 
 		 88 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3131  30S ribosomal protein S20  42.5 
 
 		 87 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000768382  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  37.5 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2211  30S ribosomal protein S20  37.8 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.829407  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0745  30S ribosomal protein S20  39.02 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.426088 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0500  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.166841  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1678  30S ribosomal protein S20  40 
 
 		 90 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>