176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0983 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  100 
 
 		 134 aa  271  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1565  putative transcriptional regulator, ModE family  45.69 
 
 		 139 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0033  ModE family transcriptional regulator  46.49 
 
 		 155 aa  102  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0601173  normal  0.403792 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  43.36 
 
 		 131 aa  102  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1394  ModE family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 171 aa  96.3  1e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 125 aa  89.7  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0650  putative transcriptional regulator, ModE family  41.23 
 
 		 136 aa  88.6  3e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.33047 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3511  Fis family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 155 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 123 aa  72.8  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 127 aa  72  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1265  putative molybdenum transport protein ModA  43.53 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  32.11 
 
 		 245 aa  64.3  0.0000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2144  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  39.77 
 
 		 195 aa  62.8  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.947345  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2068  TOBE domain protein  37.38 
 
 		 257 aa  62.4  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1529  ModE family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 269 aa  60.8  0.000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  31.48 
 
 		 242 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0447  transcriptional regulator, ModE family  37.89 
 
 		 268 aa  60.8  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1537  ModE family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 258 aa  60.1  0.000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  34.83 
 
 		 236 aa  60.1  0.000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2967  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  42.68 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.23709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  39.42 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1573  putative molybdenum-binding protein  44.12 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.163171  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 137 aa  58.2  0.00000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  38.55 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3075  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  48.33 
 
 		 346 aa  57  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0506443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2849  regulatory protein LysR  48.33 
 
 		 345 aa  57  0.00000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.312034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 145 aa  57  0.00000009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  34.41 
 
 		 263 aa  57  0.0000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  32.99 
 
 		 128 aa  56.6  0.0000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  38.89 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  43.28 
 
 		 121 aa  56.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0207  ModE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  31.52 
 
 		 115 aa  55.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0616  molybdate metabolism transcriptional regulator  46.67 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0588457  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1034  molybdenum-pterin-binding protein, molybdate transport system regulatory protein  44.83 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.296727  normal  0.0986762 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  29.36 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  32.35 
 
 		 116 aa  54.7  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  34.29 
 
 		 114 aa  53.9  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1543  molybdenum-binding protein-like  34.41 
 
 		 270 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  31.19 
 
 		 245 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1986  transcriptional regulator, ModE family  36.78 
 
 		 269 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  31.19 
 
 		 233 aa  53.5  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1335  molybdate metabolism transcriptional regulator  44.29 
 
 		 340 aa  53.5  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  31.19 
 
 		 233 aa  53.1  0.000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1692  transcriptional regulator, ModE family  37.7 
 
 		 263 aa  52  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  32.95 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0967  molybdate metabolism transcriptional regulator  48.98 
 
 		 359 aa  51.6  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.930984  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2529  transcriptional regulator, ModE family  37.7 
 
 		 263 aa  52  0.000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00120651 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0735  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 269 aa  51.6  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 276 aa  52  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  36.54 
 
 		 114 aa  51.2  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0339  molybdate metabolism transcriptional regulator  44.64 
 
 		 358 aa  51.2  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1230  molybdenum-pterin binding protein  34.83 
 
 		 281 aa  51.2  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3020  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  48.98 
 
 		 359 aa  51.2  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0475131  normal  0.0124041 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0210  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  41.38 
 
 		 348 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0173  ModE family transcriptional regulator  44.78 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.727956  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0673  transcriptional regulator, ModE family  39.34 
 
 		 270 aa  50.8  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2964  molybdenum transport regulatory protein ModE  34.69 
 
 		 269 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  36 
 
 		 177 aa  49.7  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4147  molybdate metabolism transcriptional regulator  37.78 
 
 		 368 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.70321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  49.02 
 
 		 368 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  49.02 
 
 		 368 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  49.02 
 
 		 368 aa  49.7  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 112 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2404  putative ModE family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.424301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0910  molybdate metabolism transcriptional regulator  37.78 
 
 		 368 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527444  normal  0.0178578 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1638  transcriptional regulator, ModE family  32.63 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0731324  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0552  molybdate metabolism transcriptional regulator  43.33 
 
 		 373 aa  49.7  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.269597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0898  molybdate metabolism transcriptional regulator  37.78 
 
 		 368 aa  49.7  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  29.36 
 
 		 114 aa  49.7  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0446  molybdate transport repressor  45.1 
 
 		 344 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3008  regulatory protein  45.1 
 
 		 344 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3479  regulatory protein LysR  40.82 
 
 		 373 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1625  molybdate transport repressor  45.1 
 
 		 368 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2363  molybdate metabolism transcriptional regulator  47.06 
 
 		 368 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 118 aa  48.9  0.00003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2591  molybdate transport repressor  45.1 
 
 		 359 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0963  molybdate transport repressor  45.1 
 
 		 359 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2898  LysR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 359 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2960  LysR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 359 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0184  molybdate transport repressor  45.1 
 
 		 359 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1919  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  36.11 
 
 		 366 aa  48.5  0.00003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.360263  normal  0.895882 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0662  molybdate uptake regulatory protein, HTH containing  29.7 
 
 		 270 aa  48.1  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1989  ModE family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 263 aa  48.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.455542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  37.31 
 
 		 278 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  32.71 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1869  putative transcriptional regulator, ModE family  37.66 
 
 		 125 aa  48.1  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.214893  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 129 aa  48.1  0.00004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 107 aa  47.8  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1822  molybdate metabolism transcriptional regulator  45 
 
 		 386 aa  47.8  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00250223 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3787  transcriptional regulator, LysR family  40.82 
 
 		 358 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.387361 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2243  transcriptional regulator of molybdate metabolism, LysR family  34.72 
 
 		 366 aa  47.4  0.00006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.963081  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2092  hypothetical protein  34.72 
 
 		 366 aa  47.4  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.306178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 278 aa  47.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 95 aa  47.4  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>