More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0974 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0974  Extracellular ligand-binding receptor  100 
 
 
408 aa  836    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1221  Extracellular ligand-binding receptor  59.62 
 
 
472 aa  461  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0653937 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0712  putative lipoprotein  59.51 
 
 
480 aa  457  1e-127  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2369  extracellular ligand-binding receptor  58.4 
 
 
423 aa  424  1e-117  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.391884  normal  0.390615 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1595  extracellular ligand-binding receptor  38.48 
 
 
411 aa  250  2e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.523513  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1615  extracellular ligand-binding receptor  37.72 
 
 
411 aa  249  4e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.308041 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1307  Extracellular ligand-binding receptor  37.1 
 
 
425 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.168587  normal  0.0355411 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3153  extracellular ligand-binding receptor  36.39 
 
 
398 aa  239  8e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.154593  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5604  putative extracellular ligand-binding receptor  37.02 
 
 
386 aa  237  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.236032 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3540  extracellular ligand-binding receptor  37.82 
 
 
377 aa  229  6e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.229705  normal  0.129038 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2746  Extracellular ligand-binding receptor  38.89 
 
 
385 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3111  Extracellular ligand-binding receptor  38.89 
 
 
385 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3178  extracellular ligand-binding receptor  36.34 
 
 
386 aa  228  2e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.677267  normal  0.56284 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2079  Extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 
386 aa  223  4e-57  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1004  Extracellular ligand-binding receptor  35.64 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1033  extracellular ligand-binding receptor  35.64 
 
 
416 aa  221  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.344987  hitchhiker  0.000487812 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0335  Extracellular ligand-binding receptor  38.24 
 
 
374 aa  218  1e-55  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0961  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  36.41 
 
 
496 aa  217  2e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.731254  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3001  extracellular ligand-binding receptor  36.16 
 
 
392 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1131  extracellular ligand-binding receptor  37.46 
 
 
385 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0920  extracellular ligand-binding receptor  33.67 
 
 
382 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1725  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  35.29 
 
 
393 aa  211  2e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2864  Leu/Ile/Val-binding signal peptide protein  37.01 
 
 
385 aa  211  3e-53  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110112  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2059  Extracellular ligand-binding receptor  37.39 
 
 
375 aa  203  5e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0558608  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0963  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  32.83 
 
 
517 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1635  putative branched-chain amino acid ABC transporter  34.32 
 
 
497 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.314294  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0953  extracellular ligand-binding receptor  34.4 
 
 
426 aa  197  3e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4876  extracellular ligand-binding receptor  34.88 
 
 
378 aa  196  6e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.983185  normal  0.391676 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0768  extracellular ligand-binding receptor  35.67 
 
 
380 aa  196  9e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.567193 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5877  putative branched-chain amino acid ABC transporter periplasmic component  34 
 
 
379 aa  194  2e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0825  extracellular ligand-binding receptor  32.58 
 
 
380 aa  194  3e-48  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03096  putative Leu/Ile/Val-binding lipoprotein transmembrane  34.21 
 
 
386 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0735365  normal  0.368181 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4184  extracellular ligand-binding receptor  34.59 
 
 
377 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.891545 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1828  hypothetical protein  33.7 
 
 
539 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  hitchhiker  0.00860183  normal  0.522901 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0108  Extracellular ligand-binding receptor  32.4 
 
 
388 aa  187  2e-46  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3869  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  31.11 
 
 
519 aa  184  3e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.222307 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3748  extracellular ligand-binding receptor  35.21 
 
 
370 aa  182  1e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.178822  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5396  extracellular ligand-binding receptor  33.15 
 
 
378 aa  181  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3029  Extracellular ligand-binding receptor  34.93 
 
 
370 aa  181  2e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0452  extracellular ligand-binding receptor  36.89 
 
 
382 aa  180  2.9999999999999997e-44  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.128382  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0443  Extracellular ligand-binding receptor  36.6 
 
 
382 aa  178  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.363055  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3815  extracellular ligand-binding receptor  34.11 
 
 
368 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0921  extracellular ligand-binding receptor  32.73 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.589524  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3030  Extracellular ligand-binding receptor  33.25 
 
 
374 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.394704  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3749  extracellular ligand-binding receptor  33.25 
 
 
374 aa  173  5e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.314564  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21341  hypothetical protein  34.82 
 
 
342 aa  173  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.551591 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1693  extracellular ligand-binding receptor  33.33 
 
 
377 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.502178  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4140  extracellular ligand-binding receptor  30.92 
 
 
370 aa  172  1e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.544868 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0962  putative ABC-type branched-chain amino acid transport system, periplasmic component  32.88 
 
 
512 aa  171  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2010  Extracellular ligand-binding receptor  33.06 
 
 
377 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.467518  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0210  Extracellular ligand-binding receptor  33.5 
 
 
592 aa  171  2e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.019468 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4704  Extracellular ligand-binding receptor  31.22 
 
 
371 aa  170  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0487  extracellular ligand-binding receptor  30.64 
 
 
367 aa  167  5e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4703  Extracellular ligand-binding receptor  31.39 
 
 
368 aa  164  3e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4060  extracellular ligand-binding receptor  30.95 
 
 
384 aa  163  5.0000000000000005e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.255859 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4342  extracellular ligand-binding receptor  32.36 
 
 
373 aa  163  6e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.688129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0188  Extracellular ligand-binding receptor  30.35 
 
 
386 aa  157  4e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3606  extracellular ligand-binding receptor  32.1 
 
 
395 aa  152  1e-35  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.316629 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2750  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.17 
 
 
425 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0109739  normal  0.254921 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0666  ABC transporter substrate-binding protein  28.19 
 
 
410 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.112312 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1020  twin-arginine translocation pathway signal  28.65 
 
 
383 aa  147  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0299  extracellular ligand-binding receptor  29.01 
 
 
378 aa  146  6e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3561  extracellular ligand-binding receptor  28 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0436  Extracellular ligand-binding receptor  30.41 
 
 
379 aa  139  8.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3504  extracellular ligand-binding receptor  24.81 
 
 
392 aa  138  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0407454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2080  Extracellular ligand-binding receptor  31.09 
 
 
383 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2248  Extracellular ligand-binding receptor  27.39 
 
 
410 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0352  extracellular ligand-binding receptor  26.01 
 
 
410 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.115416  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3339  extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 
410 aa  136  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.154352  normal  0.135284 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1738  leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  28.53 
 
 
409 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0827731 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0531  extracellular ligand-binding receptor  25.94 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000267349  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3061  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.66 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.664691  normal  0.158134 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0549  extracellular ligand-binding receptor  29.88 
 
 
384 aa  132  2.0000000000000002e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0807314 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1040  Extracellular ligand-binding receptor  30.77 
 
 
382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.098407 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0446  Extracellular ligand-binding receptor  27.66 
 
 
388 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7082  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  26.93 
 
 
407 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4100  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
387 aa  130  6e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.199713  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1879  putative amino acids-binding transmembrane protein  28.92 
 
 
383 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.399388  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4245  ABC transporter substrate-binding protein  26.08 
 
 
410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5732  extracellular ligand-binding receptor  26.37 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.588725 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3562  putative leucine/isoleucine/valine-binding protein precursor  25.88 
 
 
409 aa  127  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4101  extracellular ligand-binding receptor  25 
 
 
387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4246  Extracellular ligand-binding receptor  26.51 
 
 
409 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0874  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  27.66 
 
 
406 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.034766  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7651  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  26.34 
 
 
415 aa  127  5e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99279  normal  0.165016 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0789  extracellular ligand-binding receptor  29.06 
 
 
383 aa  126  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.394286  normal  0.786087 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1739  extracellular ligand-binding receptor  24.73 
 
 
410 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.152869 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3566  extracellular ligand-binding receptor  26.05 
 
 
411 aa  124  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.172998  normal  0.680161 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0508  extracellular ligand-binding receptor  26.09 
 
 
403 aa  124  3e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000199641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0796  extracellular ligand-binding receptor  27.51 
 
 
406 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3559  extracellular ligand-binding receptor  28.08 
 
 
418 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0888701  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2733  Extracellular ligand-binding receptor  24.69 
 
 
407 aa  124  4e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7650  putative branched-chain amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  25.44 
 
 
395 aa  123  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4244  Extracellular ligand-binding receptor  30.69 
 
 
411 aa  123  7e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3009  extracellular ligand-binding receptor  25.64 
 
 
415 aa  122  9e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000545529  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7081  branched chain amino acid ABC transporter periplasmic-binding protein  26.49 
 
 
407 aa  122  9e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220124  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4590  Extracellular ligand-binding receptor  29.24 
 
 
441 aa  122  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0801  putative amino-acid ABC transport system, periplasmic binding protein  27.25 
 
 
409 aa  122  9.999999999999999e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350264  normal  0.0350726 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0045  extracellular ligand-binding receptor  27.86 
 
 
385 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.406138  normal  0.264074 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4650  putative ABC transporter (substrate-binding protein); putative branched-chain amino acid transporter  26.7 
 
 
400 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>