More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0963 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0963  histidine kinase  100 
 
 		 737 aa  1497    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1548  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 		 929 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.32 
 
 		 916 aa  365  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.18 
 
 		 1040 aa  352  2e-95  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2663  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 		 1369 aa  345  2e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1268  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 		 1069 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.04 
 
 		 1202 aa  342  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2216  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.64 
 
 		 812 aa  340  5e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.368148  normal  0.0314025 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  39.53 
 
 		 1135 aa  338  1.9999999999999998e-91  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0937  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  40.26 
 
 		 852 aa  338  2.9999999999999997e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.661814  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2674  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.71 
 
 		 1305 aa  337  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.07 
 
 		 977 aa  336  7.999999999999999e-91  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  39.18 
 
 		 1363 aa  331  4e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.86 
 
 		 1398 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  39.13 
 
 		 850 aa  327  3e-88  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.15 
 
 		 936 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1029  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 		 1820 aa  327  6e-88  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.165868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.63 
 
 		 833 aa  327  6e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.2 
 
 		 1118 aa  327  7e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 925 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.67 
 
 		 950 aa  325  2e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1958  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 816 aa  323  5e-87  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952692  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  38.21 
 
 		 923 aa  323  8e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  34.89 
 
 		 1053 aa  322  9.999999999999999e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 		 835 aa  322  9.999999999999999e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  37.64 
 
 		 1014 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0965  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  34.06 
 
 		 1331 aa  320  7.999999999999999e-86  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 		 1326 aa  318  2e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  34.23 
 
 		 1574 aa  317  7e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  36.86 
 
 		 1177 aa  316  9e-85  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.2 
 
 		 1397 aa  316  9.999999999999999e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1850  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.64 
 
 		 946 aa  314  2.9999999999999996e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0866059  normal  0.191772 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0008  PAS  34.22 
 
 		 1439 aa  313  6.999999999999999e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.130257  normal  0.0574671 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.73 
 
 		 932 aa  313  9e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1096  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.1 
 
 		 1548 aa  312  1e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.363033 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  36.01 
 
 		 1765 aa  312  2e-83  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 818 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.06 
 
 		 921 aa  311  2.9999999999999997e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  36.68 
 
 		 1346 aa  310  5e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  35.33 
 
 		 758 aa  310  5e-83  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 		 927 aa  310  6.999999999999999e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  34.65 
 
 		 1407 aa  310  6.999999999999999e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4165  sensory box histidine kinase/response regulator  33.23 
 
 		 1683 aa  310  9e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.418603  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.04 
 
 		 818 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2078  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.7 
 
 		 990 aa  308  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.553649  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2220  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.94 
 
 		 928 aa  308  3e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.467526 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0943  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 		 1384 aa  308  3e-82  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.292303  normal  0.468485 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3409  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 		 2654 aa  307  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.84 
 
 		 993 aa  307  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.295041 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2369  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.05 
 
 		 1316 aa  307  4.0000000000000004e-82  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.32 
 
 		 1767 aa  306  8.000000000000001e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.58 
 
 		 1771 aa  306  9.000000000000001e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 		 1767 aa  305  2.0000000000000002e-81  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.5 
 
 		 1442 aa  305  2.0000000000000002e-81  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0092  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 1313 aa  304  3.0000000000000004e-81  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.783031 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  36.1 
 
 		 1763 aa  304  3.0000000000000004e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.82 
 
 		 1768 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  35.92 
 
 		 2213 aa  303  6.000000000000001e-81  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.47 
 
 		 1643 aa  303  6.000000000000001e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.93 
 
 		 1767 aa  303  7.000000000000001e-81  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0960  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.08 
 
 		 1245 aa  303  9e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1117  ATPase domain-containing protein  38.67 
 
 		 847 aa  302  1e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.511479  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0833  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.07 
 
 		 682 aa  302  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0832804 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2946  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.88 
 
 		 1303 aa  302  1e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1512  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.41 
 
 		 1480 aa  301  2e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0878697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  33.74 
 
 		 1179 aa  302  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  31.27 
 
 		 932 aa  300  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 		 1310 aa  300  5e-80  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  32.55 
 
 		 920 aa  300  6e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37090  alginate regulatory hybrid histidine protein kinase GacS  35.86 
 
 		 905 aa  300  9e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0555684  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.47 
 
 		 1267 aa  300  9e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1768  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 		 1033 aa  298  2e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.046039  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1908  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.13 
 
 		 991 aa  298  2e-79  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2502  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.58 
 
 		 957 aa  298  3e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000217317 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2152  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.63 
 
 		 985 aa  297  4e-79  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0146455  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.06 
 
 		 1131 aa  297  4e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  34.51 
 
 		 925 aa  297  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 		 1255 aa  296  6e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  31.25 
 
 		 1499 aa  296  6e-79  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 		 1240 aa  297  6e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.57 
 
 		 1333 aa  296  7e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2205  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 		 887 aa  296  7e-79  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.188088 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  35.24 
 
 		 925 aa  296  7e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.7 
 
 		 1784 aa  296  9e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1977  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.76 
 
 		 1072 aa  296  1e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732577  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2554  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.22 
 
 		 876 aa  296  1e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00476673 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.51 
 
 		 1611 aa  295  2e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3119  Signal transduction histidine kinase-like  30.9 
 
 		 861 aa  295  2e-78  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0747  signal transduction histidine kinase-like protein  36.06 
 
 		 1287 aa  295  2e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4322  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.23 
 
 		 1245 aa  294  3e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2063  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.26 
 
 		 1622 aa  295  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.578386 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2520  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.63 
 
 		 929 aa  295  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.314221  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0316  response regulator, histidine kinase  35.68 
 
 		 891 aa  294  3e-78  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.304506  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 1765 aa  294  3e-78  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.69 
 
 		 1550 aa  294  4e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3502  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.96 
 
 		 1236 aa  294  5e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0136  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.95 
 
 		 912 aa  293  7e-78  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.122478 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2456  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.78 
 
 		 1128 aa  293  7e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.165433 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0858  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.22 
 
 		 1792 aa  293  8e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2370  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.83 
 
 		 1433 aa  292  1e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>