158 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0847 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0847  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  100 
 
 		 325 aa  671    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.918447  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  51.53 
 
 		 326 aa  364  1e-100  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  47.24 
 
 		 326 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0881  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  47.71 
 
 		 345 aa  316  4e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0333925  normal  0.884852 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  42.25 
 
 		 329 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1974  lipoate-protein ligase  47.08 
 
 		 332 aa  282  5.000000000000001e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  41.46 
 
 		 329 aa  281  7.000000000000001e-75  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0616  lipoate-protein ligase A family protein  41.77 
 
 		 328 aa  279  5e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0882  lipoate-protein ligase A  42.04 
 
 		 329 aa  276  3e-73  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1086  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  40.85 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000389692  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1108  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  40.85 
 
 		 328 aa  273  4.0000000000000004e-72  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000525877  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  39.94 
 
 		 329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  40.61 
 
 		 329 aa  261  1e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  40.3 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  40.3 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  40.3 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  40.3 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  40.3 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  40.3 
 
 		 329 aa  259  3e-68  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  40.3 
 
 		 329 aa  260  3e-68  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  40 
 
 		 329 aa  259  4e-68  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  40.3 
 
 		 329 aa  259  6e-68  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2184  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  37.61 
 
 		 329 aa  258  1e-67  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000642263 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1014  lipoate-protein ligase  42.62 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00464071  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1006  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  39.7 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2647  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  37.16 
 
 		 331 aa  247  2e-64  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.179015  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1551  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase family protein  36.06 
 
 		 331 aa  238  1e-61  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.23083  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  34.86 
 
 		 336 aa  238  1e-61  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0785  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  38.72 
 
 		 327 aa  229  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  38.19 
 
 		 334 aa  226  3e-58  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  35.12 
 
 		 337 aa  225  9e-58  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  35.18 
 
 		 333 aa  221  9.999999999999999e-57  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  35.87 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  33.54 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  33.44 
 
 		 334 aa  201  1.9999999999999998e-50  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2894  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  37.23 
 
 		 334 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0376  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  34.25 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0386  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  34.25 
 
 		 340 aa  188  1e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  36.18 
 
 		 339 aa  186  5e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0070  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  32.06 
 
 		 343 aa  178  9e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0197  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  32.81 
 
 		 339 aa  177  2e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05080  lipoate-protein ligase  34.97 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.341449  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1542  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  32.42 
 
 		 332 aa  175  9e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4933  lipoate-protein ligase A  35.15 
 
 		 338 aa  173  5e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.553112  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1733  lipoate-protein ligase A  35.09 
 
 		 338 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2604  lipoate-protein ligase A  35.09 
 
 		 338 aa  172  9e-42  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1839  lipoate-protein ligase A  35.09 
 
 		 338 aa  172  9e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04262  lipoate-protein ligase A  35.15 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3612  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  35.15 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5901  unknown domain/lipoate-protein ligase A fusion protein  35.15 
 
 		 562 aa  171  1e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04227  hypothetical protein  35.15 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4621  lipoate-protein ligase A  35.15 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3670  lipoate-protein ligase A  35.15 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.632003 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4935  lipoate-protein ligase A  35.15 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.672461 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0545  lipoate-protein ligase A  33.96 
 
 		 338 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0965348 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4028  lipoate-protein ligase A  34.55 
 
 		 337 aa  167  2.9999999999999998e-40  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4985  lipoate-protein ligase A  34.85 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4899  lipoate-protein ligase A  34.78 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1000  lipoate-protein ligase A  33.75 
 
 		 338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4826  lipoate-protein ligase A  34.08 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4987  lipoate-protein ligase A  34.18 
 
 		 338 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4985  lipoate-protein ligase A  34.58 
 
 		 338 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4933  lipoate-protein ligase A  34.65 
 
 		 338 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2465  lipoate-protein ligase A  33.54 
 
 		 338 aa  160  3e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.249663  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2162  lipoate-protein ligase A  34.47 
 
 		 337 aa  159  5e-38  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.922433 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1629  lipoate-protein ligase A  34.74 
 
 		 338 aa  157  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  29.39 
 
 		 345 aa  152  5e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01600  conserved hypothetical protein  33.73 
 
 		 396 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0897  Lipoate--protein ligase  33.17 
 
 		 247 aa  112  7.000000000000001e-24  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13820  lipoate-protein ligase A  37.36 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  27.15 
 
 		 363 aa  108  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1106  Lipoate--protein ligase  30.85 
 
 		 245 aa  100  3e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000000820504  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.82 
 
 		 360 aa  99.8  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.01 
 
 		 530 aa  97.4  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  27.36 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.36 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0450  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.36 
 
 		 259 aa  96.7  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1053  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.8 
 
 		 357 aa  96.7  5e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05732  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06950)  33.04 
 
 		 437 aa  95.9  9e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.04 
 
 		 343 aa  95.5  1e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58727  predicted protein  26.71 
 
 		 475 aa  93.6  4e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0291322 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3413  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.16 
 
 		 261 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0322711  normal  0.107721 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10810  lipoate-protein ligase A  28.23 
 
 		 349 aa  91.3  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0653511  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2379  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.31 
 
 		 358 aa  91.3  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0965  Lipoate--protein ligase  28.5 
 
 		 257 aa  90.9  3e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.119458  normal  0.259111 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1514  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.94 
 
 		 261 aa  90.1  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0104687 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4031  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.72 
 
 		 349 aa  90.1  5e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.242009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1172  Lipoate--protein ligase  29.46 
 
 		 358 aa  88.6  2e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.260617 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2218  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.42 
 
 		 349 aa  87  4e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09720  lipoate-protein ligase A  29.49 
 
 		 364 aa  84.3  0.000000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.331543  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1701  biotin/lipoate A/B protein ligase  26.64 
 
 		 349 aa  84.3  0.000000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.407225  normal  0.0224551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2128  biotin/lipoate A/B protein ligase  29.33 
 
 		 372 aa  82.4  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0607832  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1560  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.96 
 
 		 344 aa  82  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0396798 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0980  lipoate-protein ligase A  33.13 
 
 		 253 aa  80.9  0.00000000000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1480  lipoate-protein ligase  23.59 
 
 		 364 aa  78.6  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.521497  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.61 
 
 		 344 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1879  biotin/lipoate A/B protein ligase  31.29 
 
 		 365 aa  75.9  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00459014 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0187  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.14 
 
 		 276 aa  75.5  0.000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2611  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.32 
 
 		 253 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.60182  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0967  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.94 
 
 		 278 aa  74.7  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.170763  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>