293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0842 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  100 
 
 
450 aa  919    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2621  Nitrogenase  59.57 
 
 
538 aa  554  1e-156  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1012  nitrogenase  54.75 
 
 
454 aa  496  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430786  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  48.8 
 
 
456 aa  469  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0679  Nitrogenase  51.55 
 
 
451 aa  468  1.0000000000000001e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0432483  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  49.78 
 
 
457 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  49.67 
 
 
450 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1534  nitrogenase  51.66 
 
 
450 aa  462  1e-129  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.898228  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  49.55 
 
 
452 aa  463  1e-129  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0738  nitrogenase  49.45 
 
 
450 aa  456  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  49.1 
 
 
451 aa  444  1e-123  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  44.47 
 
 
477 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0555  Nitrogenase  42.29 
 
 
456 aa  350  3e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1029  Nitrogenase  40.88 
 
 
466 aa  345  1e-93  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  36.65 
 
 
458 aa  336  3.9999999999999995e-91  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  39.73 
 
 
479 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  37.33 
 
 
458 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  36.65 
 
 
458 aa  320  3.9999999999999996e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  36.88 
 
 
458 aa  319  6e-86  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1148  nitrogenase  40.6 
 
 
463 aa  313  2.9999999999999996e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.134067  normal  0.680511 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  36.81 
 
 
475 aa  310  2.9999999999999997e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3097  nitrogenase  50.52 
 
 
512 aa  293  3e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  36.57 
 
 
475 aa  293  4e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  36.36 
 
 
461 aa  289  6e-77  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.17 
 
 
458 aa  289  7e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  35.62 
 
 
456 aa  286  5.999999999999999e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.1 
 
 
458 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.25 
 
 
459 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.17 
 
 
461 aa  283  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.94 
 
 
455 aa  282  7.000000000000001e-75  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.62 
 
 
455 aa  281  1e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.6 
 
 
461 aa  280  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.83 
 
 
460 aa  280  5e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.52 
 
 
460 aa  278  1e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.3 
 
 
459 aa  275  8e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  34.31 
 
 
462 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  33.86 
 
 
462 aa  272  9e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.94 
 
 
460 aa  271  1e-71  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  34 
 
 
462 aa  270  2.9999999999999997e-71  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.79 
 
 
485 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  34.44 
 
 
463 aa  267  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.63 
 
 
459 aa  263  4e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  33.41 
 
 
490 aa  256  5e-67  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  32.29 
 
 
462 aa  256  5e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1015  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.49 
 
 
458 aa  256  6e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  33.92 
 
 
472 aa  249  7e-65  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.37 
 
 
487 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.31 
 
 
524 aa  248  2e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.37 
 
 
523 aa  243  3.9999999999999997e-63  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.08 
 
 
523 aa  242  1e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3491  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  36.55 
 
 
919 aa  240  4e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.65 
 
 
511 aa  239  5e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0234  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  33.56 
 
 
457 aa  238  1e-61  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0346519  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2077  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  36.47 
 
 
918 aa  238  1e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5921  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  32.95 
 
 
464 aa  238  2e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.833917  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0477  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  33.86 
 
 
459 aa  238  2e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.41 
 
 
511 aa  238  2e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0092  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  34.31 
 
 
475 aa  236  4e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.14452  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.04 
 
 
518 aa  236  6e-61  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2142  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  36.24 
 
 
918 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0853728 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1077  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  33.8 
 
 
458 aa  235  9e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1201  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  35.58 
 
 
917 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.62 
 
 
518 aa  234  2.0000000000000002e-60  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0639  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  36.14 
 
 
915 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.835283  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.95 
 
 
511 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.95 
 
 
511 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  33.18 
 
 
511 aa  234  3e-60  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2324  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  31.6 
 
 
471 aa  234  3e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.122989  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.29 
 
 
512 aa  232  1e-59  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0973  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  33.92 
 
 
458 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.41646 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4459  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  33.02 
 
 
457 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32 
 
 
522 aa  229  5e-59  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0493  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.56 
 
 
522 aa  229  8e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1234  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  33.71 
 
 
453 aa  229  9e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00125588 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1516  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  33.71 
 
 
453 aa  229  9e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0669  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  35.98 
 
 
919 aa  228  1e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.961568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  31.88 
 
 
461 aa  228  2e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3628  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  31.91 
 
 
464 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.350687 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  33.41 
 
 
489 aa  227  4e-58  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.36 
 
 
506 aa  225  1e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1350  nitrogenase molybdenum-iron cofactor biosynthesis protein NifN  32.05 
 
 
457 aa  225  1e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1566  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  32.82 
 
 
465 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4932  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.24 
 
 
510 aa  224  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.36 
 
 
516 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.82 
 
 
511 aa  225  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5097  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  34.49 
 
 
457 aa  224  2e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2806  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  36.19 
 
 
919 aa  224  3e-57  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.853873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1051  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.42 
 
 
472 aa  224  3e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2189  bifunctional nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifE/NifN  31.67 
 
 
943 aa  223  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.235442 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.35 
 
 
512 aa  223  4e-57  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0537  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  31.67 
 
 
455 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7730  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  32.41 
 
 
449 aa  223  6e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  32.01 
 
 
487 aa  223  6e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.46 
 
 
512 aa  223  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.8 
 
 
506 aa  222  9e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.75 
 
 
489 aa  221  9.999999999999999e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1250  nitrogenase molybdenum-cofactor biosynthesis protein NifN  31.61 
 
 
455 aa  222  9.999999999999999e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  32.27 
 
 
462 aa  222  9.999999999999999e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  33.03 
 
 
489 aa  222  9.999999999999999e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  31.61 
 
 
487 aa  222  9.999999999999999e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>