269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0838 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1953  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  66.59 
 
 		 460 aa  663    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.119434  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0838  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  100 
 
 		 458 aa  949    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2617  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  79.26 
 
 		 458 aa  782    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1532  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  67.1 
 
 		 459 aa  645    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  65.36 
 
 		 485 aa  636    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.36292  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0681  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  66.52 
 
 		 459 aa  658    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.746204  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1015  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  70.02 
 
 		 458 aa  684    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.502201  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1631  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  66.23 
 
 		 460 aa  642    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000877058  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0740  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  67.97 
 
 		 459 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  64.27 
 
 		 460 aa  629  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.077468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1154  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  61.96 
 
 		 461 aa  592  1e-168  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.813541  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3094  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  59.13 
 
 		 461 aa  578  1e-164  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1027  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  60.13 
 
 		 461 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.975928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2817  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  57.94 
 
 		 463 aa  566  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0557  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  56.33 
 
 		 455 aa  532  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0151336  normal  0.228475 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1146  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  55.24 
 
 		 455 aa  526  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0167  nitrogenase, subunit beta  47.81 
 
 		 456 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4486  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  42.95 
 
 		 518 aa  382  1e-105  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6879  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  42.51 
 
 		 518 aa  376  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.640197  normal  0.320804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3930  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  41.58 
 
 		 512 aa  371  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39743  normal  0.0737899 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4461  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  41.83 
 
 		 518 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4249  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  41.27 
 
 		 512 aa  362  5.0000000000000005e-99  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1051  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.44 
 
 		 472 aa  360  2e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1352  nitrogenase molybdenum-iron protein subunit beta  40.72 
 
 		 511 aa  361  2e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.475929  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1520  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  40.4 
 
 		 519 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.268449  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1238  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.4 
 
 		 519 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.028424 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1075  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.82 
 
 		 537 aa  356  3.9999999999999996e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.902597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3994  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.57 
 
 		 512 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1787  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.61 
 
 		 511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1815  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.61 
 
 		 511 aa  353  2.9999999999999997e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.994927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1198  nitrogenase  39.91 
 
 		 475 aa  352  5.9999999999999994e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0971  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.69 
 
 		 519 aa  352  5.9999999999999994e-96  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6223  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  41.4 
 
 		 513 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2118  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.46 
 
 		 511 aa  349  6e-95  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0200867 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0475  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.98 
 
 		 520 aa  349  6e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2366  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.59 
 
 		 511 aa  349  7e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5099  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.96 
 
 		 519 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3536  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.9 
 
 		 512 aa  348  1e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1607  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.73 
 
 		 519 aa  346  4e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262136  normal  0.703776 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2100  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.69 
 
 		 487 aa  345  8.999999999999999e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2190  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40 
 
 		 516 aa  344  2e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0387614  normal  0.12949 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0539  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40 
 
 		 506 aa  343  2.9999999999999997e-93  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0059  nitrogenase  38.76 
 
 		 458 aa  342  9e-93  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.148206  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0090  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.45 
 
 		 519 aa  340  2e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1012  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.33 
 
 		 510 aa  340  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.245367  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5054  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  40.27 
 
 		 513 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01400  Nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.1 
 
 		 523 aa  338  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4040  nitrogenase  39.45 
 
 		 475 aa  337  2.9999999999999997e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.342277  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4932  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.24 
 
 		 510 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0664  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.97 
 
 		 489 aa  336  7e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3630  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.95 
 
 		 519 aa  336  7e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5923  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain, nifK  38.17 
 
 		 519 aa  335  9e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0231  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.8 
 
 		 519 aa  335  1e-90  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.819432  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1248  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.89 
 
 		 506 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.836121 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1568  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.46 
 
 		 511 aa  333  4e-90  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.511918  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1467  nitrogenase, molybdenum-iron protein beta chain(NifK)  38.79 
 
 		 519 aa  332  8e-90  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.261912  hitchhiker  0.00055229 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1200  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.27 
 
 		 524 aa  330  4e-89  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00251423 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2819  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit  37.61 
 
 		 489 aa  329  6e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1177  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.39 
 
 		 487 aa  329  7e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0272  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.59 
 
 		 523 aa  328  9e-89  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.322626  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2076  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.96 
 
 		 487 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4138  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  39.19 
 
 		 512 aa  327  4.0000000000000003e-88  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.453924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0104  nitrogenase  38.07 
 
 		 458 aa  324  2e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.294919  normal  0.143181 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2143  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.74 
 
 		 487 aa  324  2e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.305963 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3469  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.96 
 
 		 487 aa  324  2e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3028  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.95 
 
 		 489 aa  323  5e-87  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2343  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.77 
 
 		 519 aa  320  1.9999999999999998e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.303723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1413  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.71 
 
 		 522 aa  320  3e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.079976 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0648  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.95 
 
 		 489 aa  320  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1797  nitrogenase  37.61 
 
 		 458 aa  320  5e-86  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7755  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  37.01 
 
 		 519 aa  318  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1432  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  38.17 
 
 		 519 aa  318  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.880154 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3205  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  35.48 
 
 		 489 aa  318  1e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0664  nitrogenase  37.39 
 
 		 458 aa  317  2e-85  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.683559  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0147  nitrogenase  39.09 
 
 		 490 aa  314  1.9999999999999998e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0493  nitrogenase molybdenum-iron protein beta chain  36.4 
 
 		 522 aa  310  5e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0102  nitrogenase  36.4 
 
 		 462 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0981911  normal  0.153494 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1799  nitrogenase  36.18 
 
 		 462 aa  306  7e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0061  nitrogenase  37.08 
 
 		 462 aa  305  9.000000000000001e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0662  nitrogenase  36.4 
 
 		 462 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.341539  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0165  nitrogenase associated protein N  35.56 
 
 		 477 aa  294  2e-78  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1955  Nitrogenase  38.14 
 
 		 450 aa  294  3e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0171503  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1250  nitrogenase iron-molybdenum cofactor biosynthesis protein NifN, putative  37.21 
 
 		 452 aa  290  3e-77  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.113259  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0842  Nitrogenase  35.1 
 
 		 450 aa  286  5.999999999999999e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1152  nitrogenase molybdenum-iron protein, beta subunit, putative  35.86 
 
 		 451 aa  285  1.0000000000000001e-75  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.680246  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1757  Nitrogenase  37.33 
 
 		 457 aa  284  2.0000000000000002e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0799606  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0679  Nitrogenase  36.68 
 
 		 451 aa  279  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0432483  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1430  nitrogenase  37.03 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2276  nitrogenase, subunit beta  33.63 
 
 		 461 aa  277  3e-73  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.665587  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1633  Nitrogenase  36.01 
 
 		 456 aa  274  2.0000000000000002e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000322358  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0555  Nitrogenase  34.51 
 
 		 456 aa  271  2.9999999999999997e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.376218 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1534  nitrogenase  36.01 
 
 		 450 aa  268  2e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.898228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1551  nitrogenase, subunit K  34.21 
 
 		 462 aa  267  2.9999999999999995e-70  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0738  nitrogenase  36.74 
 
 		 450 aa  267  2.9999999999999995e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4027  oxidoreductase/nitrogenase, component 1  36.81 
 
 		 463 aa  266  7e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.762261 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2815  nitrogenase  31.91 
 
 		 479 aa  265  1e-69  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2621  Nitrogenase  32.76 
 
 		 538 aa  265  1e-69  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48970  Fe-only nitrogenase, beta subunit  33.26 
 
 		 462 aa  265  1e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.12057  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1620  Fe-only nitrogenase, beta subunit  34.38 
 
 		 461 aa  262  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.855819  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1012  nitrogenase  33.18 
 
 		 454 aa  260  3e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.430786  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>