More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0831 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0831  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
957 aa  1960    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2628  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.76 
 
 
902 aa  457  1e-127  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1409  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.44 
 
 
778 aa  444  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2309  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.7 
 
 
1055 aa  434  1e-120  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1582  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.94 
 
 
788 aa  413  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1426  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.88 
 
 
1079 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.688315  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3479  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.71 
 
 
1078 aa  409  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0181  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.99 
 
 
837 aa  397  1e-109  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.415169  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0743  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.02 
 
 
869 aa  393  1e-108  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  48.04 
 
 
676 aa  392  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00629905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1221  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.88 
 
 
1044 aa  384  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227424  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1770  histidine kinase  51.04 
 
 
742 aa  376  1e-103  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1424  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  51.03 
 
 
1050 aa  375  1e-102  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4662  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1251  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.46 
 
 
1101 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000252838 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0634  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.57 
 
 
1000 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.932649  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1425  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.75 
 
 
1096 aa  369  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.579353  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1570  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.9 
 
 
1039 aa  363  6e-99  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.184468  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0577  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  47.04 
 
 
1005 aa  358  2.9999999999999997e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0920445  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1628  multi-sensor hybrid histidine kinase  47.33 
 
 
1070 aa  354  4e-96  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2187  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  46.12 
 
 
705 aa  352  2e-95  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2101  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  50 
 
 
678 aa  344  4e-93  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.007905  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1413  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.03 
 
 
918 aa  343  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2683  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.41 
 
 
1358 aa  336  1e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.117306 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0392  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  49.74 
 
 
762 aa  335  2e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.5363 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0973  histidine kinase  47.42 
 
 
733 aa  335  3e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000797186 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1051  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.9 
 
 
862 aa  334  5e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1141  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.49 
 
 
1055 aa  333  6e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1153  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44.89 
 
 
1143 aa  332  2e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.648529  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0331  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  44 
 
 
955 aa  328  3e-88  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.383184 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4541  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.52 
 
 
896 aa  326  1e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1968  multi-sensor hybrid histidine kinase  45.99 
 
 
846 aa  325  2e-87  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2536  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
801 aa  324  4e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0800  histidine kinase  42.96 
 
 
882 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.127646  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0565  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.67 
 
 
947 aa  323  9.999999999999999e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2487  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  43.16 
 
 
1535 aa  319  2e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.162467  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2483  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.06 
 
 
1071 aa  317  5e-85  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1642  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  45.97 
 
 
1131 aa  317  8e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0330659  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2314  sensory box histidine kinase/response regulator  39.34 
 
 
982 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.581555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0562  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.39 
 
 
743 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.1893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2061  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
738 aa  316  1.9999999999999998e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0560  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.01 
 
 
940 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2929  histidine kinase  43.18 
 
 
606 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1982  multi-sensor hybrid histidine kinase  49.29 
 
 
1058 aa  311  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1328  Signal transduction histidine kinase-like protein  41.29 
 
 
763 aa  310  1.0000000000000001e-82  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1722  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 
1007 aa  309  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.608863  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3367  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.16 
 
 
1059 aa  308  4.0000000000000004e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.049018 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0566  MCP methyltransferase, CheR-type with PAS/PAC sensor  43.33 
 
 
1193 aa  307  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.16 
 
 
1977 aa  307  7e-82  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2468  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.65 
 
 
631 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.633599  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.51 
 
 
785 aa  304  5.000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1726  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.02 
 
 
881 aa  303  7.000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0185814  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0318  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
1223 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.455432  normal  0.438074 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0257  histidine kinase  45.43 
 
 
847 aa  303  1e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.952647  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1549  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 
1199 aa  303  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0120  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.43 
 
 
839 aa  302  2e-80  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.554495  normal  0.207208 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3402  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.22 
 
 
874 aa  301  3e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1697  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  41.29 
 
 
907 aa  300  7e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.13 
 
 
1070 aa  300  1e-79  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0658  histidine kinase  41.31 
 
 
627 aa  299  2e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0191  histidine kinase  38.92 
 
 
666 aa  298  3e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1550  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.12 
 
 
995 aa  298  4e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0179  histidine kinase  41.33 
 
 
758 aa  298  4e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6561  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.7 
 
 
863 aa  297  5e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2693  histidine kinase  44.64 
 
 
571 aa  296  9e-79  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0909214 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0806  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.62 
 
 
902 aa  295  3e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1820  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.09 
 
 
780 aa  295  3e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00145182  normal  0.723891 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0558  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  41.87 
 
 
893 aa  293  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.843554  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.56 
 
 
767 aa  292  2e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0720  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.29 
 
 
882 aa  292  2e-77  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.488385  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2453  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.15 
 
 
969 aa  293  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.19952  normal  0.304956 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5761  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
1204 aa  292  2e-77  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.122146 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0578  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  42.24 
 
 
667 aa  291  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3279  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.04 
 
 
1433 aa  291  6e-77  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.681112  normal  0.627666 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0559  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 
704 aa  290  7e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2784  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.66 
 
 
1222 aa  290  9e-77  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0520121 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1360  GAF sensor hybrid histidine kinase  38.46 
 
 
974 aa  289  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0599  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
957 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0065  histidine kinase  44.39 
 
 
578 aa  287  5.999999999999999e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3181  multi-sensor hybrid histidine kinase  43.48 
 
 
817 aa  287  7e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.182241  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2265  histidine kinase  42.07 
 
 
559 aa  287  8e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.592554  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4427  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.87 
 
 
772 aa  287  9e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4086  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal  41.97 
 
 
631 aa  286  1.0000000000000001e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3663  putative sensor/response regulator hybrid  41.88 
 
 
651 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.800386  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03166  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.85 
 
 
959 aa  286  1.0000000000000001e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1285  sensory box sensor histidine kinase/response regulator  36.14 
 
 
772 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4904  multi-sensor hybrid histidine kinase  42.05 
 
 
873 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.683005  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4224  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.5 
 
 
877 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.249922 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3528  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.29 
 
 
690 aa  285  2.0000000000000002e-75  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.148332  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1794  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.19 
 
 
965 aa  285  3.0000000000000004e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0332193  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4006  histidine kinase  41.25 
 
 
736 aa  285  3.0000000000000004e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.155316  hitchhiker  0.00128379 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2955  Hpt sensor hybrid histidine kinase  42.71 
 
 
764 aa  285  3.0000000000000004e-75  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3113  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.73 
 
 
898 aa  285  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.265974  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0379  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.21 
 
 
647 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2426  Hpt sensor hybrid histidine kinase  40.64 
 
 
827 aa  285  4.0000000000000003e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4076  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.98 
 
 
876 aa  285  4.0000000000000003e-75  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2525  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  40.1 
 
 
785 aa  285  4.0000000000000003e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.985854  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1522  histidine kinase  42.9 
 
 
544 aa  284  5.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3496  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  43.43 
 
 
643 aa  284  6.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3522  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.57 
 
 
1287 aa  283  1e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1342  multi-sensor hybrid histidine kinase  41.34 
 
 
944 aa  282  2e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>