57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0791 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0791  putative ABC transporter solute-binding protein  100 
 
 		 403 aa  829    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2122  putative ABC transporter solute-binding protein  60.61 
 
 		 409 aa  508  1e-143  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.708087 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0759  putative ABC transporter solute-binding protein  59.85 
 
 		 429 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1199  putative ABC transporter solute-binding protein  61.73 
 
 		 430 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.134978 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0532  putative ABC transporter solute-binding protein  57.64 
 
 		 439 aa  455  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.96386  normal  0.487675 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4231  putative ABC transporter solute-binding protein  41.69 
 
 		 410 aa  289  7e-77  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2438  hypothetical protein  37.62 
 
 		 409 aa  268  1e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.557423  normal  0.459913 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3278  putative ABC transporter solute-binding protein  38.85 
 
 		 408 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1832  putative ABC transporter solute-binding protein  39.68 
 
 		 401 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.563171 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2251  putative ABC transporter solute-binding protein  39.73 
 
 		 399 aa  260  4e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.11793  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0200  putative ABC transporter solute-binding protein  39.9 
 
 		 401 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91232  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3226  putative ABC transporter solute-binding protein  38.46 
 
 		 401 aa  258  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0901142  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1446  putative ABC transporter solute-binding protein  40.66 
 
 		 401 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.50777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4046  putative ABC transporter solute-binding protein  37.56 
 
 		 406 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1236  hypothetical protein  37 
 
 		 429 aa  245  9e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2068  putative ABC transporter solute-binding protein  38.21 
 
 		 424 aa  239  5.999999999999999e-62  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.730242  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1693  putative ABC transporter solute-binding protein  35.16 
 
 		 390 aa  226  6e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.949015  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2473  putative ABC transporter solute-binding protein  39.94 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1838  putative ABC transporter solute-binding protein  39.64 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01711  hypothetical protein  39.64 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1888  extracellular solute-binding protein family 1  39.64 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00824785  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01723  hypothetical protein  39.64 
 
 		 388 aa  222  8e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1878  putative ABC transporter solute-binding protein  39.64 
 
 		 388 aa  222  9.999999999999999e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000418187 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2003  putative ABC transporter solute-binding protein  39.64 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.203142  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1436  putative ABC transporter solute-binding protein  39.64 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.463512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1977  putative ABC transporter solute-binding protein  39.35 
 
 		 388 aa  219  5e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.942474  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2959  putative ABC transporter solute-binding protein  33.07 
 
 		 419 aa  218  2e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0976  putative ABC transporter solute-binding protein  33.25 
 
 		 435 aa  212  7.999999999999999e-54  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0656307 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0361  putative ABC transporter solute-binding protein  36.17 
 
 		 380 aa  204  2e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.083844  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1269  putative ABC transporter solute-binding protein  34.2 
 
 		 382 aa  201  1.9999999999999998e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000820878  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2153  extracellular solute-binding protein  34.65 
 
 		 404 aa  201  1.9999999999999998e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000427732 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02678  putative ABC transporter solute-binding protein  33.54 
 
 		 403 aa  197  4.0000000000000005e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003793  ABC transporter substrate-binding protein YnjB  33.74 
 
 		 386 aa  196  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000277117  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01789  putative ABC-type transport system, periplasmic component  33.54 
 
 		 384 aa  185  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2768  putative ABC transporter solute-binding protein  32.71 
 
 		 381 aa  184  2.0000000000000003e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.211813  normal  0.195627 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0393  putative ABC transporter solute-binding protein  33.02 
 
 		 373 aa  164  3e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.235452  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5613  ABC transporter substrate binding protein  27.42 
 
 		 395 aa  65.1  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7450  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6580  extracellular solute-binding protein family 1  26.94 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.384654  normal  0.213985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2094  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.76 
 
 		 377 aa  58.2  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1874  extracellular solute-binding protein family 1  24.48 
 
 		 375 aa  58.2  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.58176  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0518  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  24.5 
 
 		 385 aa  56.2  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2752  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.74 
 
 		 418 aa  53.9  0.000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6869  extracellular solute-binding protein family 1  22.39 
 
 		 419 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2171  extracellular solute-binding protein  25 
 
 		 360 aa  47.8  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.56432  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2451  hypothetical protein  25.46 
 
 		 360 aa  47.8  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3472  thiamine ABC transporter, periplasmic binding protein  27.62 
 
 		 337 aa  46.2  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3703  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 		 377 aa  46.2  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2059  putative spermidine/putrescine ABC transporter, periplasmic spermidine/putrescine-binding protein  25.09 
 
 		 360 aa  45.8  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.791804  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4968  extracellular solute-binding protein family 1  24.45 
 
 		 364 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0985864  normal  0.213163 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1682  ABC spermidine/putrescine transporter, periplasmic ligand binding protein  24.45 
 
 		 364 aa  45.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.551017 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0180  extracellular solute-binding protein family 1  26.18 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5538  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  22.29 
 
 		 396 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1283  twin-arginine translocation pathway signal  30.36 
 
 		 420 aa  44.3  0.004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00667141  normal  0.645291 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0810  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.28 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0760  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21.28 
 
 		 393 aa  44.3  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.372778  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4218  spermidine/putrescine transport system substrate-binding protein  30.07 
 
 		 413 aa  43.1  0.009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.244138  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>