52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0719 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0719  peptidase C39 bacteriocin processing  100 
 
 		 164 aa  338  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  31.21 
 
 		 164 aa  93.6  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1104  hypothetical protein  32.14 
 
 		 223 aa  73.2  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0738368 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  30.3 
 
 		 188 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1110  TPR repeat-containing protein  30.81 
 
 		 312 aa  66.2  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.166102  normal  0.864016 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0089  hypothetical protein  39.47 
 
 		 342 aa  66.2  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03118  FOG: TPR repeat 2396 protein  28.57 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2157  hypothetical protein  26.47 
 
 		 332 aa  64.7  0.0000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.97673  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0996  peptidase C39 bacteriocin processing  28.45 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000009  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000968879  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4194  hypothetical protein  27.97 
 
 		 347 aa  62  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  28.79 
 
 		 736 aa  61.6  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2454  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 326 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0869299  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0271  hypothetical protein  31.58 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000357372  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1974  hypothetical protein  31.01 
 
 		 317 aa  57.8  0.00000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.260801  normal  0.0442943 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0294  TPR repeat-containing protein  35.85 
 
 		 339 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.033214  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1043  hypothetical protein  30.43 
 
 		 322 aa  56.6  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2524  peptidase C39, bacteriocin processing  31.94 
 
 		 317 aa  55.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.497952  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28150  hypothetical protein  31.86 
 
 		 292 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0121186  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1288  hypothetical protein  33.33 
 
 		 330 aa  54.3  0.0000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000550461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  29.93 
 
 		 716 aa  54.7  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0530  tetratricopeptide TPR_4  28.87 
 
 		 314 aa  52.4  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.491525  normal  0.49371 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3003  ABC transporter related protein  29.46 
 
 		 918 aa  49.3  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.102792  normal  0.46573 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1828  TPR repeat-containing protein  28.17 
 
 		 310 aa  48.5  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  30.28 
 
 		 722 aa  48.1  0.00005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0237  bacteriocin-processing peptidase  28.28 
 
 		 715 aa  48.1  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.821835  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10340  putative toxin transporter  29.73 
 
 		 719 aa  47.8  0.00008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.294639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0582  hypothetical protein  30.46 
 
 		 234 aa  47.4  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  29.08 
 
 		 1038 aa  47  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0828  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.61 
 
 		 335 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.375671  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0946  putative toxin transporter  27.93 
 
 		 719 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  57.58 
 
 		 743 aa  44.7  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  28.37 
 
 		 1038 aa  44.3  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  32.14 
 
 		 715 aa  43.9  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0622  bacteriocin-processing peptidase  24.31 
 
 		 722 aa  43.5  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44571  normal  0.575885 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1143  colicin V processing peptidase cysteine peptidase MEROPS family C39  28.83 
 
 		 733 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0865539  normal  0.618932 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6343  ABC transporter related  30.63 
 
 		 719 aa  43.1  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  26.19 
 
 		 714 aa  43.1  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  32.38 
 
 		 238 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  32.38 
 
 		 238 aa  42.4  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2878  peptidase C39, bacteriocin processing  22.31 
 
 		 297 aa  42  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0648351  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1623  ABC transporter related protein  27.48 
 
 		 735 aa  42  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.068726  normal  0.025744 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0517  hypothetical protein  26.85 
 
 		 1134 aa  42  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0075  ABC transporter-like protein protein  23.7 
 
 		 722 aa  41.6  0.005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254201  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2200  tetratricopeptide repeat protein  25 
 
 		 1400 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000228728 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1976  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1400 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1994  TPR repeat-containing protein  25 
 
 		 1400 aa  41.2  0.006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2025  hypothetical protein  25 
 
 		 666 aa  41.2  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  26.96 
 
 		 721 aa  40.8  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  25 
 
 		 726 aa  40.8  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3132  tetratricopeptide repeat protein  25 
 
 		 1400 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0761546 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2185  tetratricopeptide repeat protein  25 
 
 		 1400 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2322  tetratricopeptide repeat protein  25 
 
 		 1400 aa  40.4  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.155443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>