More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0715 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0715  response regulator receiver protein  100 
 
 		 124 aa  250  4.0000000000000004e-66  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3023  response regulator receiver protein  47.93 
 
 		 130 aa  106  1e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0063  response regulator receiver protein  40.19 
 
 		 130 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1521  response regulator receiver domain-containing protein  37.5 
 
 		 126 aa  84.7  3e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1780  response regulator receiver protein  35.51 
 
 		 130 aa  77  0.00000000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.233106 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32720  Response regulator  37.17 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2829  response regulator receiver protein  35.65 
 
 		 134 aa  66.2  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3849  response regulator receiver (CheY) modulated Serine phosphatase  34.17 
 
 		 412 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.658628 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2359  putative two-component response regulator  35.25 
 
 		 394 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0332  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.89 
 
 		 228 aa  63.9  0.0000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0145192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1682  response regulator receiver modulated serine phosphatase  33.61 
 
 		 412 aa  63.5  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2165  response regulator  34.17 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0249002  normal  0.813701 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1706  response regulator receiver modulated serine phosphatase  34.17 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000168842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3577  response regulator receiver protein  34.17 
 
 		 393 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00266085  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27940  putative two-component response regulator  34.43 
 
 		 394 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1168  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  30.33 
 
 		 433 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0764  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  30.33 
 
 		 433 aa  62.4  0.000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00454819  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2015  two component hybrid sensor response regulator  33.06 
 
 		 391 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0676  two comoponent transcriptional regulator  30.83 
 
 		 231 aa  61.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000000021656  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0791  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC (Ornithine/argininedecarboxylase inhibitor)  30.33 
 
 		 451 aa  60.8  0.000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.261898  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1043  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  29.51 
 
 		 433 aa  60.8  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0366555  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3603  response regulator receiver protein  32.2 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.656399  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1114  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.96 
 
 		 501 aa  60.5  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1055  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 481 aa  60.1  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.874499  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1183  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  34.96 
 
 		 481 aa  60.5  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0229  two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.444604  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1017  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.61 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1923  response regulator receiver domain-containing protein  36.25 
 
 		 149 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0795  putative PAS/PAC sensor protein  39.13 
 
 		 458 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0670898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1399  two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 228 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.11718 
 
 
-
 
NC_004310  BR2006  DNA-binding response regulator  33.61 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.347503  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1105  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 475 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.926771  normal  0.835973 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2117  response regulator  31.67 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0129975  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1929  DNA-binding response regulator  33.61 
 
 		 227 aa  59.3  0.00000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1912  response regulator receiver:stage II sporulation E  31.67 
 
 		 394 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.432168  hitchhiker  0.00180426 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.15 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  38.84 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0038  two component transcriptional regulator  34.43 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000503825 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1929  response regulator receiver protein  33.9 
 
 		 394 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.310245 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0051  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  58.2  0.00000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.480932 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2950  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0252  response regulator receiver protein  32 
 
 		 239 aa  58.5  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.114255 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1350  response regulator receiver protein  31.86 
 
 		 147 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00189482  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2937  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.71 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.33 
 
 		 239 aa  57.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0526  sigma-54 dependent DNA-binding response regulator  30.43 
 
 		 429 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2483  two component transcriptional regulator  28.81 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  32.5 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1894  two component transcriptional regulator  30.25 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000765732  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0965  two component transcriptional regulator  32.77 
 
 		 227 aa  58.2  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2399  two component transcriptional regulator, winged helix family  30.25 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00272  hitchhiker  0.00893631 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2709  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 501 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.710197  normal  0.745824 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2021  regulatory protein VanR  31.15 
 
 		 228 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1694  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  30.58 
 
 		 472 aa  57.8  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 229 aa  57.8  0.00000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0840  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.88 
 
 		 241 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214337  normal  0.533835 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.43 
 
 		 216 aa  57.4  0.00000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0710  response regulator receiver domain-containing protein  33.65 
 
 		 240 aa  57  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0074  two component transcriptional regulator  30.33 
 
 		 236 aa  57.4  0.00000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0964  sigma-54 dependent transcriptional regulator/response regulator  32.5 
 
 		 478 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1098  PAS:GGDEF  29.75 
 
 		 705 aa  57  0.00000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2315  two component transcriptional regulator  28.81 
 
 		 233 aa  57  0.00000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0960  two component transcriptional regulator  32.5 
 
 		 236 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0214647 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3454  winged helix family two component transcriptional regulator  28.81 
 
 		 279 aa  57  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.631289 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0703  two component transcriptional regulator, winged helix family  34.45 
 
 		 236 aa  57  0.00000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1884  two component transcriptional regulator  32.79 
 
 		 233 aa  57  0.00000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3222  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.86 
 
 		 447 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0905113 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2679  response regulator receiver domain-containing protein  26.45 
 
 		 129 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.380915  normal  0.27601 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0435  response regulator receiver protein  31.78 
 
 		 124 aa  57  0.00000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00876892  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2796  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.512352  hitchhiker  0.00000533196 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  30.33 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1927  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000341688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1461  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  50 
 
 		 491 aa  56.2  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.750458 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  31.15 
 
 		 230 aa  56.6  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0630  response regulator FixJ  35.65 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.136769  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2936  two component transcriptional regulator  27.97 
 
 		 233 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0808073 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2934  response regulator receiver protein  28.1 
 
 		 129 aa  56.6  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000852899  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1920  two component transcriptional regulator  29.41 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000662196  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2526  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3485  two component transcriptional regulator  31.67 
 
 		 236 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31480  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.88 
 
 		 239 aa  56.6  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  hitchhiker  0.00376265  normal  0.556858 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0670  sensor histidine kinase/response regulator  35.58 
 
 		 1170 aa  56.2  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.315036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0289  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.12 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000126796  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0173  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  32.23 
 
 		 463 aa  56.2  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.127235  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  31.97 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0025  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.65 
 
 		 468 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0807039 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0417  two component transcriptional regulator  33.33 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03240  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  31.45 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604152  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0024  nitrogen assimilation regulatory protein NtrX, putative  33.65 
 
 		 468 aa  55.8  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2564  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0589521  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2341  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000166477  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2302  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0831  response regulator receiver:sigma-54 factor, interaction region  32.5 
 
 		 494 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00148287 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2083  two component transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.129585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2574  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000040017 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  29.84 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0938  DNA-binding response regulator  30.58 
 
 		 234 aa  55.5  0.0000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000299191  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1578  two component LuxR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 207 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.661779  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0471  two component transcriptional regulator  31.15 
 
 		 226 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.734397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>