More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0679 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_0679  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 		 472 aa  966    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.156874  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1555  peptidase M48, Ste24p  42.92 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0844  peptidase M48 Ste24p  41.56 
 
 		 470 aa  361  2e-98  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000290245  normal  0.0785618 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0483  peptidase M48 Ste24p  42.18 
 
 		 490 aa  336  5e-91  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260218 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2122  TPR repeat-containing protein  39.53 
 
 		 483 aa  334  2e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.318434  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1448  peptidase M48 Ste24p  39.66 
 
 		 469 aa  288  2e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.749654  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1630  peptidase M48 Ste24p  31.6 
 
 		 474 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.685537  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3647  peptidase M48, Ste24p  30.13 
 
 		 480 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00143596  normal  0.526227 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2576  molybdopterin converting factor, subunit 1  27.91 
 
 		 503 aa  150  3e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  33.04 
 
 		 480 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  28.5 
 
 		 487 aa  144  4e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  26.88 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002788  zinc metalloprotease  26.35 
 
 		 483 aa  140  7e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2384  peptidase  26.15 
 
 		 484 aa  139  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  28.07 
 
 		 485 aa  139  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03193  protease  26.52 
 
 		 484 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1330  hypothetical protein  26.3 
 
 		 473 aa  137  4e-31  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.643696  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  27.55 
 
 		 489 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  27.9 
 
 		 488 aa  134  3e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  27.7 
 
 		 489 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  27.7 
 
 		 489 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  28.26 
 
 		 489 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1913  peptidase M48, Ste24p  27.49 
 
 		 489 aa  133  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.910226  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1971  peptidase M48 Ste24p  30.34 
 
 		 486 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.436824  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  28.04 
 
 		 478 aa  132  1.0000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2619  peptidase M48, Ste24p  27.39 
 
 		 484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1647  peptidase M48, Ste24p  29.97 
 
 		 490 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  29.31 
 
 		 486 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1695  peptidase M48, Ste24p  28.96 
 
 		 490 aa  130  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.160832  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2495  peptidase M48 Ste24p  27 
 
 		 489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  27.8 
 
 		 478 aa  130  5.0000000000000004e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1790  peptidase M48 Ste24p  27 
 
 		 489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1827  peptidase M48 Ste24p  27 
 
 		 489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.223751  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1783  peptidase M48 Ste24p  27 
 
 		 489 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.510736  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1755  peptidase M48, Ste24p  28.7 
 
 		 489 aa  130  6e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1744  hypothetical protein  23.74 
 
 		 484 aa  127  3e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  33.06 
 
 		 494 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1356  peptidase M48 Ste24p  24.76 
 
 		 524 aa  127  5e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107911  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1239  M48 family peptidase  24.76 
 
 		 494 aa  127  6e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000273921  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2537  peptidase M48, Ste24p  34.35 
 
 		 502 aa  126  7e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.606815  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  30.35 
 
 		 500 aa  125  2e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  31.76 
 
 		 285 aa  124  4e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 278 aa  124  4e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0482  peptidase M48 Ste24p  35.05 
 
 		 569 aa  123  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  24.52 
 
 		 494 aa  123  6e-27  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3980  peptidase M48 Ste24p  30.47 
 
 		 478 aa  123  7e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3089  peptidase M48, Ste24p  27.9 
 
 		 483 aa  123  8e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2437  peptidase M48, Ste24p  28.3 
 
 		 486 aa  122  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00870552 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3190  hypothetical protein  24.95 
 
 		 483 aa  122  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.602192  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  32.3 
 
 		 268 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  27.96 
 
 		 474 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0469  peptidase M48 Ste24p  34.58 
 
 		 567 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0561  putative signal peptide protein  35.1 
 
 		 561 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.611701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  29.92 
 
 		 487 aa  120  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  31.8 
 
 		 521 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  25.06 
 
 		 487 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  39.38 
 
 		 588 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  39.38 
 
 		 588 aa  120  6e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1262  peptidase M48, Ste24p  29.57 
 
 		 478 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349395  normal  0.85963 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  39.38 
 
 		 564 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1232  hypothetical protein  29.57 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.705832 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4186  peptidase M48 Ste24p  29.57 
 
 		 478 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.129955  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51320  hypothetical protein  24.22 
 
 		 477 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000410651 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  30.69 
 
 		 561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  38.86 
 
 		 588 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  38.34 
 
 		 564 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  38.34 
 
 		 564 aa  118  3e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  39.06 
 
 		 589 aa  117  3e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  31.88 
 
 		 554 aa  118  3e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4392  hypothetical protein  25.28 
 
 		 477 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  24.58 
 
 		 487 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  39.38 
 
 		 593 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3958  hypothetical protein  24.72 
 
 		 477 aa  117  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  36.63 
 
 		 605 aa  117  6e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2164  protease  31.4 
 
 		 568 aa  116  8.999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0450  peptidase M48 Ste24p  34.24 
 
 		 562 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.101014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  38.54 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  31.4 
 
 		 268 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  30.03 
 
 		 553 aa  115  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  38.54 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  38.54 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  30.42 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  38.54 
 
 		 572 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  38.54 
 
 		 560 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1543  peptidase M48, Ste24p  24.66 
 
 		 477 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.457387  normal  0.0662018 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  38.54 
 
 		 589 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  38.54 
 
 		 589 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  25.27 
 
 		 481 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2820  peptidase M48, Ste24p  37.37 
 
 		 481 aa  114  4.0000000000000004e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  29.32 
 
 		 264 aa  113  8.000000000000001e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  33.96 
 
 		 541 aa  113  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  28.98 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  28.98 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  35.44 
 
 		 521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  33.64 
 
 		 573 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  35.44 
 
 		 521 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  28.98 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  33.94 
 
 		 266 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  28.98 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  28.98 
 
 		 487 aa  112  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>