More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_0654 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_0654  apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
520 aa  1046    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1868  apolipoprotein N-acyltransferase  48.43 
 
 
505 aa  419  1e-116  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00767722 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1303  apolipoprotein N-acyltransferase  47.3 
 
 
502 aa  405  1e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.873503  normal  0.159256 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0554  apolipoprotein N-acyltransferase  44.1 
 
 
522 aa  367  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000781227 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1806  apolipoprotein N-acyltransferase  42.24 
 
 
528 aa  342  1e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.680205  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2734  apolipoprotein N-acyltransferase  36.65 
 
 
525 aa  279  9e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.8548  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1937  apolipoprotein N-acyltransferase  38.14 
 
 
552 aa  274  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2367  apolipoprotein N-acyltransferase  37.25 
 
 
521 aa  267  4e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1768  apolipoprotein N-acyltransferase  35.34 
 
 
542 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2281  apolipoprotein N-acyltransferase  38.59 
 
 
477 aa  264  3e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1785  apolipoprotein N-acyltransferase  38.88 
 
 
521 aa  255  1.0000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000151712  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1001  apolipoprotein N-acyltransferase  37.25 
 
 
507 aa  253  6e-66  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00299698  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2037  apolipoprotein N-acyltransferase  35.4 
 
 
516 aa  252  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3259  apolipoprotein N-acyltransferase  36.57 
 
 
507 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0723  apolipoprotein N-acyltransferase  37.05 
 
 
510 aa  247  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1236  apolipoprotein N-acyltransferase  37.95 
 
 
506 aa  246  6e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1116  apolipoprotein N-acyltransferase  28.45 
 
 
513 aa  194  5e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2341  apolipoprotein N-acyltransferase  30.49 
 
 
526 aa  179  1e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.254934  normal  0.0837539 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0442  apolipoprotein N-acyltransferase  33.26 
 
 
528 aa  179  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0171803  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3613  apolipoprotein N-acyltransferase  32.84 
 
 
523 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.157782  normal 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3951  apolipoprotein N-acyltransferase  32.84 
 
 
523 aa  178  2e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.680782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1183  apolipoprotein N-acyltransferase  32.19 
 
 
512 aa  177  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.072894 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1439  apolipoprotein N-acyltransferase  31.86 
 
 
524 aa  177  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.233971 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1679  apolipoprotein N-acyltransferase  31.69 
 
 
550 aa  176  9.999999999999999e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.751883  normal  0.642372 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3128  apolipoprotein N-acyltransferase  30.63 
 
 
529 aa  174  2.9999999999999996e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0015  apolipoprotein N-acyltransferase  33.26 
 
 
534 aa  170  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.449034  normal  0.161189 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0749  apolipoprotein N-acyltransferase  31.6 
 
 
512 aa  170  6e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.209793  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0552  apolipoprotein N-acyltransferase  32.71 
 
 
500 aa  169  8e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0704  apolipoprotein N-acyltransferase  31.6 
 
 
512 aa  169  8e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2988  apolipoprotein N-acyltransferase  31.6 
 
 
512 aa  169  8e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2969  apolipoprotein N-acyltransferase  31.6 
 
 
512 aa  169  9e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.948045  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3009  apolipoprotein N-acyltransferase  30.13 
 
 
515 aa  169  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.333345  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2919  apolipoprotein N-acyltransferase  30.13 
 
 
515 aa  169  9e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.476447  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1834  apolipoprotein N-acyltransferase  30.13 
 
 
515 aa  169  9e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00625  apolipoprotein N-acyltransferase  32.3 
 
 
512 aa  167  5e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00616  hypothetical protein  32.3 
 
 
508 aa  167  5.9999999999999996e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0820  apolipoprotein N-acyltransferase  30.33 
 
 
529 aa  166  8e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0710  apolipoprotein N-acyltransferase  30.33 
 
 
529 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.145232  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0784  apolipoprotein N-acyltransferase  30.33 
 
 
529 aa  166  9e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0725  apolipoprotein N-acyltransferase  30.33 
 
 
529 aa  166  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.84443 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0678  apolipoprotein N-acyltransferase  31.17 
 
 
512 aa  165  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1215  apolipoprotein N-acyltransferase  30.37 
 
 
509 aa  164  3e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.814042  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0771  apolipoprotein N-acyltransferase  30.36 
 
 
529 aa  164  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4808  apolipoprotein N-acyltransferase  32.33 
 
 
506 aa  164  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0590  apolipoprotein N-acyltransferase  30.95 
 
 
512 aa  163  7e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0646  apolipoprotein N-acyltransferase  31.95 
 
 
497 aa  162  1e-38  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0686  apolipoprotein N-acyltransferase  30.95 
 
 
512 aa  162  2e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00162787  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2952  apolipoprotein N-acyltransferase  30.87 
 
 
509 aa  161  2e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2158  apolipoprotein N-acyltransferase  31.66 
 
 
532 aa  161  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  unclonable  0.0003541  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1499  apolipoprotein N-acyltransferase  29.18 
 
 
554 aa  161  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3138  apolipoprotein N-acyltransferase  29.53 
 
 
509 aa  161  3e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2070  apolipoprotein N-acyltransferase  31.66 
 
 
532 aa  161  3e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000583807  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2337  apolipoprotein N-acyltransferase  30.72 
 
 
523 aa  160  4e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.111383 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1193  apolipoprotein N-acyltransferase  29.4 
 
 
509 aa  159  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2338  apolipoprotein N-acyltransferase  31.72 
 
 
489 aa  158  2e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0017  apolipoprotein N-acyltransferase  33.17 
 
 
534 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536194 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4666  apolipoprotein N-acyltransferase  31.55 
 
 
505 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.372109  normal  0.737188 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3783  apolipoprotein N-acyltransferase  31.33 
 
 
507 aa  158  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.299433 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2276  apolipoprotein N-acyltransferase  30.31 
 
 
524 aa  157  5.0000000000000005e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00039204 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1343  apolipoprotein N-acyltransferase  30.02 
 
 
522 aa  156  8e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.528625 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4349  apolipoprotein N-acyltransferase  30.95 
 
 
506 aa  156  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.37536  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4954  apolipoprotein N-acyltransferase  30.51 
 
 
507 aa  156  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.121084 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02234  apolipoprotein N-acyltransferase  28.03 
 
 
504 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.21676  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2380  apolipoprotein N-acyltransferase  31.59 
 
 
532 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000000838838  hitchhiker  0.0000262387 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1403  apolipoprotein N-acyltransferase  31.37 
 
 
479 aa  155  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.896977  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1976  apolipoprotein N-acyltransferase  30.22 
 
 
524 aa  155  2e-36  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.0457399 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1862  apolipoprotein N-acyltransferase  30.52 
 
 
503 aa  155  2e-36  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.480638  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4844  apolipoprotein N-acyltransferase  30.67 
 
 
505 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.552658  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4790  apolipoprotein N-acyltransferase  31.33 
 
 
505 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.295792 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0241  apolipoprotein N-acyltransferase  30.73 
 
 
521 aa  154  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0053  apolipoprotein N-acyltransferase  28.57 
 
 
553 aa  154  4e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3774  apolipoprotein N-acyltransferase  33.01 
 
 
531 aa  154  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1912  apolipoprotein N-acyltransferase  30.19 
 
 
537 aa  154  5e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000101188  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0398  apolipoprotein N-acyltransferase  33.33 
 
 
505 aa  154  5e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.415751 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2902  apolipoprotein N-acyltransferase  31.11 
 
 
590 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0754  apolipoprotein N-acyltransferase  30.72 
 
 
532 aa  152  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.411203  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1060  apolipoprotein N-acyltransferase  25.58 
 
 
526 aa  152  2e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0063  apolipoprotein N-acyltransferase  26.75 
 
 
506 aa  152  2e-35  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0709  apolipoprotein N-acyltransferase  28.41 
 
 
520 aa  152  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.309882  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0705  apolipoprotein N-acyltransferase  33.69 
 
 
487 aa  150  4e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.515448 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0472  apolipoprotein N-acyltransferase  32.07 
 
 
534 aa  150  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.44702 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2288  apolipoprotein N-acyltransferase  30.9 
 
 
507 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0510  apolipoprotein N-acyltransferase  31 
 
 
524 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.511831  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2584  apolipoprotein N-acyltransferase  31.88 
 
 
520 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.111585 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2717  apolipoprotein N-acyltransferase  30.85 
 
 
589 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.419709  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0238  apolipoprotein N-acyltransferase  28.66 
 
 
510 aa  149  1.0000000000000001e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2742  apolipoprotein N-acyltransferase  30.65 
 
 
514 aa  149  1.0000000000000001e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.447637  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0449  apolipoprotein N-acyltransferase  31.16 
 
 
510 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0202397  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1104  apolipoprotein N-acyltransferase  28.23 
 
 
511 aa  147  7.0000000000000006e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0889  apolipoprotein N-acyltransferase  34.3 
 
 
510 aa  147  7.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.623273  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0025  apolipoprotein N-acyltransferase  29.67 
 
 
528 aa  146  8.000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.129672  normal  0.499637 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0527  apolipoprotein N-acyltransferase  32.37 
 
 
523 aa  145  1e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.776126  normal  0.0299872 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3304  apolipoprotein N-acyltransferase  29.78 
 
 
521 aa  145  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12280  apolipoprotein N-acyltransferase  32.77 
 
 
511 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2809  apolipoprotein N-acyltransferase  31.11 
 
 
590 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3621  apolipoprotein N-acyltransferase  33.18 
 
 
557 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1013  apolipoprotein N-acyltransferase  33.68 
 
 
497 aa  145  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.179625  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0992  apolipoprotein N-acyltransferase  27.11 
 
 
501 aa  145  2e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.192008  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1177  apolipoprotein N-acyltransferase  30.11 
 
 
518 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1887  apolipoprotein N-acyltransferase  25.67 
 
 
560 aa  142  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>